1.7 获取帮助有很多种资源可以帮你学习关于R的更多知识,其中包括R自身的一些工具,当然,还有网上的资料。开发者们做了很多工作使R更加自文档化。下面我们将介绍一些R内置的帮助工具,以及互联网上的资源。1.7.1 help()函数想获取在线帮助,可调用help()。例如,要获取seq()函数的信息,就键入下面的命令:1.7.2 example()函数每个帮助条目都附带有例子。R的一个非常好用的特性是
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2023-08-21 03:03:12
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引入平常我们利用GEODatasets的表达量数据进行基因表达分析的时候,常常是下载表达矩阵,利用limma包进行分析,如果能找到注释包,那就把探针注释成Entrez_id或者是Symbol_id,如果找不到,那就下载对应GPL提供的注释文件,但是很可能还是不好注释,比如今天拿来做例子的GSE15222对应的GPL2700: 我们看到这个GPL只提供了GB_ACC也就是Genebank的一个号码,
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2023-12-18 19:01:27
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数据预处理是将 原始数据 转化成能够用于建模的一致数据的过程,它是分析流程中非常关键的一个环节!!!! 首先,载入需要的R包 caret :提供机器学习模型及拟合效果的系统交互界面 e1071:各类计量经济和机器学习的延伸,我们使用其中的naiveBayes函数进行朴素贝叶斯判别 gridExtra:绘图辅助功能,将不同图形组合在一起成为图表 lattice:建立在核心绘图能力上的格子框
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2023-08-11 14:05:05
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1. 从R中获取帮助查找某个函数# 打开mean函数的帮助页面
?mean
help("mean")
# 打开加号操作的帮助页面
?"+"
help("+")
# 打开if的帮助页面,用于分支代码
?"if"
help("if")
# 搜索所有包含"plotting"的主题
??plotting
help.search("plotting")
# 搜索所有与regression mo
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2023-11-08 21:40:19
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FROM:《Using The foreach Package》 foreach包提供了一种新的循环运行R脚本的循环结构,它支持并行运算。 #1 简介
require(foreach)## Loading required package: foreach#利用foreach重复运行sqrt函数
foreach(i=1:3) %do% sqrt(i)## [[1]]
## [1] 1
##
#
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2023-10-01 19:36:50
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R语言中 segments函数
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2023-05-30 11:15:18
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1、 vector格式 vector是一维的数据集合,其数据必须为同一类型,例如都是int型,都是character型。一个原本全是数字组成的vector中一个元素替换为字母时,其余元素也会变为character型。> a <- 1:6
> str(a)
int[1:6] 1 2 3 4 5 6
> a[1] <- 'a'
> str(a)
chr[1:6
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2023-08-17 10:48:29
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决策树(Decision Tree):是在已知各种情况发生概率的基础上,通过构成决策树来求取净现值的期望值大于等于零的概率,评价项目风险,判断其可行性的决策分析方法,是直观运用概率分析的一种图解法。(即分类的属性均在数据表中,不能决策出不存在的属性) 2、set.seed()函数 set.seed()用于设定随机数种子,一个特定的种子可以产生一个特定的伪随机序列,这个函数
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2024-01-24 08:25:35
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# R语言中的for循环与if语句用法
R语言是一种广泛使用的编程语言,尤其适合数据分析和统计计算。在R语言中,`for`循环和`if`语句是控制程序执行流程的基本工具。本文将深入探讨这两种控制结构的用法,并提供代码示例帮助理解。
## 一、for循环
`for`循环用于遍历一个序列(例如向量、列表等),对每个元素执行指定的操作。其语法格式为:
```r
for (variable in
原创
2024-09-10 05:31:44
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sprintf指的是字符串格式化命令,函数声明为 int sprintf(char *string, char *format [,argument,…]);,主要功能是把格式化的数据写入某个字符串中,即发送格式化输出到 string 所指向的字符串。sprintf 是个变参函数。使用sprintf 对于写入buffer的字符数是没有限制的,这就存在了buffer溢出的可能性。解决这个问题,可以考
=R是一个优秀的统计计算语言,但是因为它是解释型语言, 所以在对数组元素的迭代运算方面会很慢。 在R用C语言程序可以既保留R的易用性又可以在必要时提高速度。 本文讲述在Windows环境下如何用Borland的C编译器来完成R和C的结合。假设我们要用C编码的问题是两个向量的卷积问题, 当然,R中已经有convolve可以实现, 我们这里只是作为一个例子。 两个无穷向量x和y的卷积定义为z[i] =
既然R语言是一种语言,那么就应该包含所有串行语言都有的基本控制语句:分支和循环。下面介绍相应的语句。1.1 分支语句1.1.1 if-else分支语句 二分支语句if-else是最常见的控制语句,其基本形式如下:if(<判断1>)
{ 处理1
} else
{
处理2
}
或者:
if(<判断
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2023-08-29 18:22:53
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A. 处理循环 - R不仅有for/while循环语句,还有更强大的实现循环的"一句话"函数B. 排序C. 总结数据信息1. lapply:可以循环处理列表中的每一个元素,总是返回一个列表 - lapply(列表,函数/函数名,其他参数) - sapply:简化结果 a. 结果列表元素长度均为1,返回向量 b. 结果列表元素长度相同且大于1,返回矩阵# lapply
str(l
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2024-01-28 17:22:57
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数据基本信息获取获取数据的基本情况: summary() 函数。 任何 R 对象都可作为summary() 函数的参数,返回对象的统计和概要信息,日常常用且实用的函数。获取数据维度:dim() 函数 对于高维数据,如矩阵和数据框,dim() 函数可返回对象的维度:行数,列数。获取数据长度: **length()**函数 用于计算向量、矩阵中元素的个数。 对于一个数据框,length() 则返回列(
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2023-06-25 15:19:27
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入门书籍:R语言实战进度:1-4章摘要:1)实用的包forecast:用于做时间序列预测的,有auto.arima函数RODBC:可以用来读取excel文件。但据说R对csv格式适应更加良好,相应的导入导出均较为方便(read.table, write等)reshape:目前用到rename函数,可以方便的对数据变量重命名fCalendar:在日期输入处提及,据说对日期运算有奇效,但无具体示例。同
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2023-07-11 22:30:31
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好在R和Python中有现成的数据集分割函数,避免手动写函数导致划分比例不合理、训练集与测试集的样本的结构与总体不均衡的问题。
R语言中caTools包中的sample.split函数可以用来自动将原始数据集分割成训练集和测试集。
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2023-05-30 13:21:24
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printf("ni hao \n ma ?\n");
printf("ni hao \r ma ? \r");
printf("ni hao \n ma ?\n");
printf("ni hao \r ma ? \r"); 打印结果为: ni hao
ma ?
ma ?
ni
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2023-09-08 20:30:39
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经过上一节的介绍相信各位读者已经知道如何安装R及R程序包。本节拟通过一个简单的例子说明用R语言进行预测的主要步骤,旨在让各位读者了解用R语言进行预测的基本过程。本例使用forecast包中自带的数据集wineind,它表示从1980年1月到1994年8月,由葡萄酒生产商销售的容量不到1升的澳大利亚酒的总量。数据示意如下:从数据中可知,这是典型的时间序列数据,一行表示一年,12列表示一年的12个月,
这一篇文章是回答知识星球中一位星友的提问,她的电脑内存有限,无法直接使用所有数据,只能分析部分数据。数据来源: https://content.cruk.cam.ac.uk/jmlab/atlas_data.tar.gz 解压缩之后,得到下面数据
数据清单
其中raw_counts.mtx是以稀疏矩阵格式存放的表达量数据,文件为6.5G, 用普通的文本编辑器无法
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2023-11-14 15:11:56
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缺失值的处理方法——多重插补法 1 基本思想 利用蒙特卡洛模拟法(MCMC)将原始数据插补成几个完整数据集,在每个数据集中利用线性回归(lm)或广义线性规格(glm)等方法进行插补建模,再将这些完整的模型整合到一起,评价插补模型的优劣并返回完整数据集。该方法主要利用程辑包mice中的mice( )进行。 大致步骤如下: 缺失数据集——MCMC估计插补成几个数据集——每个数据集进行插补建模(glm、
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2023-06-21 22:40:07
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