1. 场景描述一直做java，因项目原因，需要封装一些经典的算法到平台上去，就一边学习python，一边网上寻找经典算法代码，今天介绍下经典的相关性算法，算法原理就不介绍了，只从代码层面进行介绍，包含：rest接口、连接mpp数据库、回传json数据、下载图片及数据。（python聚类算法解决方案（rest接口/连接mpp数据库/回传json数据/下载图片及数据））2. 解决方案2.1 项目套路（
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2024-04-14 13:43:12
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桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你134篇原创内容桓峰基因公众号推出基于基因组数据生信分析教程并配有视频在线教程，目前整理出来的教程目录如下：DNA 1. Germline Mutation Vs. Somatic Mutation 傻傻分不清楚DNA 2. SCI 文章中基因组变异分析神器之 ma
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2019-04-25 19:26:00
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前言在生物信息学数据分析中，许多分析软件都是基于R开发的。这里介绍一个可以在Python 中进行基因富集分析的Python 软件 GSEAPY (Gene Set Enrichment Analysis in Python)GSEApy is a python wrapper for GESA and Enrichr.
It’s used for convenient
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2023-09-13 17:28:38
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2019-04-25 19:26:00
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1131：基因相关性时间限制: 1000 ms 内存限制: 65536 KB提交数: 10401 通过数: 5283【题目描述】为了获知基因序列在功能和结构上的相似性，经常需要将几条不同序列的DNA进行比对，以判断该比对的DNA是否具有相关性。现比对两条长度相同的DNA序列。定义两条DNA序列相同位置的碱基为一个碱基对，如果一个碱基对中的两个碱基相同的话，则称为相...
原创
2021-08-10 09:59:54
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时间限制: 1000 ms 内存限制: 65536 KB 提交数: 10401 通过数: 5283
【题目描述】为了获知基因序列在功能和结构上的相似性，经常需要将几条不同序列的DNA进行比对，以判断该比对的DNA是否具有相关性。现比对两条长度相同的DNA序列。定义两条DNA序列相同位置的碱基为一个碱基对，如果一个碱基对中的两个碱基相同的话，则称为相同碱基对。接着计算相同碱基对占总碱基对数量的比例，
原创
2022-03-24 11:34:35
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问题描述蒜厂有一个 h×w 的矩形公告板，其中 h 是高度，w 是宽度。 现在有若干张 1×Wi 的公告， Wi 是宽度，公告只能横着放，即高度为 1 的边垂直于水平面，且不能互相有重叠，每张公告都要求尽可能的放在最上面的合法的位置上。 若可以放置，输出每块可放置的位置的行号；若不存在，输出 −1。行号由上至下分别为 1,2,…,h。 输入格式 第一行三个整数 h，w，n (1≤h,w≤10^9;
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2023-07-07 23:59:26
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首先，做这个相关性分析，在这里需要安装几个R包。 使用场景 1.已经确定研究的基因，但是想探索他潜在的功能，可以通过跟这个基因表达最相关的基因来反推他的功能，这种方法在英语中称为guilt of association，协同犯罪。2.我们的注释方法依赖于TCGA大样本，既然他可以注释基因，那么任何跟肿瘤相关的基因都可以被注释，包括长链非编码RNABiocManager::install
Ted Talks环境：Python2.7 Anaconda Jupyter Notebook数据集: https://www.kaggle.com/rounakbanik/ted-talks导入相应的库
%matplotlib inline
import pandas as pd
import numpy as np
from scipy import stats
import matplotl
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2024-03-12 07:29:35
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https://nanti.jisuanke.com/t/31459逆向考虑 对于每个矩形的右上顶点(xi,yi) 查一下y=yi这条直线上最大的x值 若小于xi 则答案加上这个差值 x=xi亦然主要是因为逆向考虑有一个等效替代的过程 画图模拟一下即可#include <bits/stdc++.h>using namespace std;#define ll long long
原创
2022-06-16 00:45:39
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题目地址：https://nanti.jisuanke.com/t/20AC代码：import java.util.Arrays;import java.util.Scanner;public classtem.in)
原创
2022-08-04 13:06:00
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https://nanti.jisuanke.com/t/16497题目描述一条长为L路，上有N个公共座椅（忽略长度），现在在路上要修路灯，每个路灯覆盖的长度为l，为了让所有座椅都被路灯覆盖到最少需要多少路灯?输入描述第一行为三个正整数L(#includeusing ...
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2018-11-16 12:34:00
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表观遗传学是与遗传学(genetic)相对应的概念。遗传学是指基于基因序列改变所 致基因表达水平变化，如基因突变、基因杂合丢失和微卫星不稳定等；而表观遗传学则是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化，如DNA甲基化和染色质构象变 化等；表观基因组学(epigenomics) 则是在基因组水平上对表观遗传学改变的研究。 数据库介绍 01DNA
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2023-12-21 10:38:40
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题目链接 本来想把题目粘贴过来，但是格式不好，就不弄过来了。 典型的贪心，注意的贪心
原创
2022-09-07 16:36:37
177阅读
# 用Python绘制基因相关性热图
## 引言
随着基因组学的发展，研究人员越来越关注基因之间的相互关系。基因相关性热图是一种强有力的可视化工具，可以帮助我们直观地分析基因之间的相关性。在这篇文章中，我们将使用Python库来绘制基因相关性热图，并通过代码示例演示具体的实现过程。
## 基因相关性热图的概念
基因相关性热图是一种矩阵图像，其中每个方格表示两个基因之间的相关性。热图中的颜色
在蒜厂年会上有一个抽奖，在一个环形的桌子上，有 nnn 个纸团，每个纸团上写一个数字，表示你可以获得多少蒜币。但是这个游戏比较坑，里面竟然有负数，表示你要支付多少蒜币。因为这些数字都是可见的，所以大家都是不会出现的赔的情况。
游戏规则：每人只能抓一次，只能抓取一段连续的纸团，所有纸团上的数字和就是你可以获得的蒜币。
蒜头君作为蒜厂的一员在想，我怎么可以获得最多的蒜币呢？最多能获取多少蒜币呢？
因为...
原创
2022-02-03 14:07:48
89阅读
在蒜厂年会上有一个抽奖，在一个环形的桌子上，有 nnn 个纸团，每个纸团上写一个数字，表示你可以获得多少蒜币。但是这个游戏比较坑，里面竟然有负数，表示你要支付多少蒜币。因为这些数字都是可见的，所以大家都是不会出现的赔的情况。游戏规则：每人只能抓一次，只能抓取一段连续的纸团，所有纸团上的数字和就是你可以获得的蒜币。蒜头君作为蒜厂的一员在想，我怎么可以获得最多的蒜币呢？最多能获取多少蒜币呢？因为...
原创
2021-08-27 14:27:18
153阅读
小米是一个幼儿园老师，每学期的泥塑课上，她都会给每个学生发不超过 250250 立方厘米的等量橡皮泥，教大家做泥塑。在上课过程中，她发现每个班都恰好有一个小朋友会去抢另一个小朋友的橡皮泥，于是她决定，在正式开始做泥塑前，让大家把手里的橡皮泥都捏成一个立方体，并且测量手里捏好的橡皮泥的长、宽和高。这样
原创
2021-07-15 11:18:30
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一、内容二、思路由于输入的坐标（x,y）是按照先按Y排序，再按X排序，所以Y大的一定是后面输入，在Y（相同高度的情况下），x小的一定先输入。所以我们维护1-n区间的棋子数，判断某个棋子（X,Y）它左下方棋子的数量就等于1-x这个区间所保存的值，然后进行树状数组的更新。将当前的棋子更新进去，更新的点就是X点。由于x,y可能等于0，那么更新的时候就会陷入死循环，因为0的lowbit ==...
原创
2021-08-27 14:29:15
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