Description多组数据，每组给出两个小写字母组成的字符串，求两个字符串的最长公共子串，如有多个按字典序顺序输出，如没有输出 No common sequence.，每两组数据间输出一个空行，最后一组数据后不应输出空行。Solution将两个字符串用分隔符连在一起，求出SA求出height的最大值，要求这个最大值对应的两个串位于分隔符两侧所有相同的答案在height数组中都是连续的，遇到相同
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2021-04-07 12:08:32
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掌握序列算法已经成为面试笔试的标配。基本的序列问题多用动态规划技巧解。动态规划通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题。本文中将要讨论的以下三个问题多用到动态规划：最大连续子序列（Maximum Consecutive Subsequence），最长递增子序列（Longest Increasing Subsequence），最长公共子序列（Longest Common Subseque
文章目录一、基本原理二、构建文库三、测序芯片四、上机测序五、测序模型1、Circular Consensus Sequencing (CCS)
原创
2022-03-08 15:59:18
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Gnome SequencingTime Limit: 1000MS Memory Limit: 65536KTotal Submissions: 1267 Accepted: 865DescriptionIn the book All Creatures of Mythology, gnomes are kind, bear
原创
2023-08-21 16:49:25
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链接 题意: 给出$N$个字符串，全都是由(和)组成的，判断$S_1,S_2.....S_n$能否以合理的顺序，满足其中的(和)配对成功。(注意配对的(和)一定是(在前，)在后）. 思路: 首先这是个字符串匹配问题,我们就可以将其转化成(为1,)为-1.这样就将一个字符串转化两个有意义的值,一个是最 ...
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2021-07-24 11:32:00
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A - DNA Sequencing 后缀数组 题目大意： 给你两个字符串，问两个字符串的最长相同子串，如果有多个则按照字典序输出，如果没有则输出"No common sequence."，输出与输出之间空一行，多组输入。 题解： 这个因为数据范围很小，所以可以不同后缀数组写，不过刚刚学习了这个算法
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2021-02-15 16:08:00
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链接题意:给出\(N\)个字符串，全都是由(和)组成的，判断\(S_1,S_2.....S_n\)能否以合理的顺序，满足其中的(和)配对
原创
2022-07-15 10:30:45
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NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的tep...
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2023-05-02 21:54:29
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Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 （原理、代码和评述）)、DN...
原创
2023-05-02 22:00:01
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群体基因组系列文章-1标题（英文）：Comprehensive profiling of 1015 patients’ exomes reveals genomic-clinical associations in colorectal cancer标题（中文）：对 1015 名患者外显子组的综合分析揭示了结直肠癌的基因组临床关联发表期刊：nature communications作者单位：中山大
原创
2024-03-01 18:46:09
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关键词：基因编辑；基因测序；变异检测；文献简介标题（英文）：Consistency and reproducibility of large panel next-generation sequencing: Multi-laboratory assessment of somatic mutation detection on reference materials with mismatch
原创
2024-09-24 11:05:35
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试图揣测作者的思考方式 Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing 这篇文章[1]的一个亮点在于对肿瘤中的T细胞有了认识。 #data 不得不说，这个样本的数量和质量真的太好 ...
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2021-08-17 21:46:00
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肿瘤测序系列文章-1标题（英文）：The relationship between genetic characteristics and clinical characteristics and the efficacy of 131I therapy in children and adolescents with locally advanced or metastatic dif
原创
2023-08-24 14:30:03
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肿瘤测序系列文章-1标题（英文） ：Thiabendazole Inhibits Glioblastoma Cell Proliferation and Invasion Targeting Mini-chromosome Maintenance Protein 2标题（中文） ：噻苯咪唑靶向小染色体维护蛋白 2 抑制胶质母细胞瘤细胞增殖和侵袭发表期刊：The Journal of Pharmac
原创
2024-02-24 16:03:12
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群体基因组系列文章-1标题（英文）：The Impact of ACEs on BMI: An Investigation of the Genotype-Environment Effects of BMI标题（中文）：ACEs对BMI的影响：探究BMI的基因型-环境效应发表期刊：Behavior Genetics作者单位：美国俄勒冈州立大学心理学系发表年份：2022文章地址：https://d
原创
2023-08-24 14:20:13
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研究者通过将PacBio 长读长数据进行组装后对基因组进行 repeat 和 gene 注释。然后，利用测序或者从公开发表文献中下载的棉花基因组数据进行比对、变异检测、联合基因分型对亚洲栽培棉和非洲亚种进行比较。此过程中，Sentieon DNAseq 模块被用于 illumina 数据的变异检测和联合基因分型。
原创
2024-05-27 15:32:49
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TCGA是什么 TCGA：The Cancer Genome Atlas Program，癌症基因组图谱计划。TCGA存储了哪些信息临床样本信息：Biospecimen Clinical测序数据：RNA sequencing MicroRNA sequencing DNA sequencing SNP-based platforms Array-based DNA methylation sequ
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2024-06-18 04:02:29
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论文题目 Small RNA and mRNA Sequencing Reveal the Rolesof microRNAs Involved...
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2022-03-18 10:20:44
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PaperTyping methods based on whole genome sequencing dataUelze et al. On
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2023-04-26 10:19:11
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二代测序的简介 第二代测序（Next-generation sequencing，NGS）又称为高通量测序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序（Sequencing by Synthesis）。二代测序在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱
