做完mapping之后，需要知道mapped reads在基因组上的分布，所以尝试在ubuntu系统中使用IGV软件，简单记录使用过程，如下：１．下载IGV软件 去IGV官网: http://www.broadinstitute.org/software/igv/download，下载 binary distribution类型软件２．运行IGV软件 软件下载后，直接解压。在命令行运行：sh
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2024-08-06 12:45:10
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简介在分析二代测序数据，进行变异检测的流程中，人工的确认和解读比对的read是非常重要的。人工的检查极大的提高了检测的可信度，降低假阳性的风险。Integrative
Genomics
Viewer（IGV）是一个提供NGS数据可视化的工具，目前还提供丰富的工具用于检查、验证和解读NGS数据集和其他类型的基因组数据。本文作者展示了IGV变异检查这个功
原创
2021-03-26 11:26:11
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IGV (Itegrative Genomics Viewer)是一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，能够将基
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2023-07-18 16:55:53
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中新社广西凭祥8月1日电 (杨陈 黄金兰 周游)广西交科集团有限公司8月1日介绍，由该公司承建的中越友谊关—友谊货运通道智慧口岸(以下称中越智慧口岸)项目首个IGV(智慧型引导运输车)卡口系统地磅，日前在新二道卡顺利完成吊装，标志着智慧口岸信息化建设加速。
8月1日，中越友谊关—友谊货运通道智慧口岸施工现场。广西交科集团有限公司供图
友谊关口岸位于广西凭祥市，是中国通往越南乃
原创
2024-08-16 17:42:42
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# 二代IGV点突变数据分析
在现代生物医学研究中，第二代测序技术（NGS）已经成为基因组学的一个重要工具。通过二代测序，我们能够获得大量的基因组数据，尤其是点突变信息。这些改变在疾病研究中尤为重要，如癌症生物学。本文将通过点突变数据分析，探讨如何使用IGV（Integrative Genomics Viewer）和Python进行数据处理与可视化。
## 什么是点突变？
点突变是指基因组D
原创
2024-10-09 04:59:53
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欢迎关注”生信修炼手册”!基因组浏览器可以直观的展示基因组及其各种注释信息，是展示NGS数据和分析结果的利器
原创
2022-06-22 04:52:42
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欢迎关注”生信修炼手册”!bam文件记录了reads比对到参考基因组的详细信息，是NGS分析中的核心文件。该
原创
2022-06-21 09:47:56
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中新网广西凭祥9月12日电(付冬月 黄金兰)9月11日，中越友谊关智慧口岸项目IGV无人车换电站完成调试工作，标志着换电站正式具备试运行条件。
图为IGV无人车换电站调试现场。广西交科集团供图
据悉，中越友谊关智慧口岸项目在中国国内率先将高效率IGV换电站应用于智慧口岸建设。该换电站拥有380V AC动力供电源，供电容量达到2500kVA，可满足50台IGV无人车用电需求。换
原创
2024-09-13 17:38:32
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找到了一个解释 https://sites.google.com/site/bioinformaticsremarks/bioinfo/sam-...
原创
2022-07-16 00:12:22
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欢迎关注”生信修炼手册”!除了动态的查看基因组学数据，IGV还内置了以下两个工具BlatMotif find
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2022-09-05 13:40:46
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一、软件下载http://software.broadinstitute.org/software/igv/download这里以下载 Windows 版本为例，下载带有 Java 的版本，方便安装。由于大部分数据是通过服务器跑出的结果，所以也有小伙伴有在 Linux 服务器端使用的需求。这里推荐几种方式：配合远程控制软件来使用，国产推荐 Todesk，向日葵话说目前
原创
2022-03-08 16:06:09
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中新网广西凭祥9月9日电(黄聪 黄宁)9月9日，随着最后30米的路面摊铺完成，标志着中越友谊关智慧口岸项目完成IGV无人车试运行演示路线交付，向全线交付使用迈出了关键的一步。
图为项目建设现场。广西路桥集团供图
据项目承建方广西路桥集团介绍，项目自开工建设以来，实行挂图作战，24小时不间断作业，全面推动项目健康有序发展。项目将于2024年9月参与第21届中国—东盟博览会，进行
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2024-09-13 17:42:12
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中新网广西凭祥8月26日电(黄金兰)8月25日，由广西交科集团牵头承建的中越智慧口岸(友谊关—友谊)项目完成首个IGV(智慧型引导运输车)车道卡口系统调试工作，为后续车队调度管理系统、场站指挥调度平台联调工作奠定基础。
图为IGV新二道卡实车流程测试。广西交科集团供图
IGV车道卡口系统是中越智慧口岸(友谊关—友谊)24小时通关系统及配套设施建设的重要组成部分，通过前端信息采
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2024-09-13 17:38:32
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欢
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2022-06-21 09:49:58
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欢迎关注”生信修炼手册”!motif在基因组上结合位点的查找是生信分析中的一项基本技能，在转录因子的chip
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2022-09-05 13:41:00
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转基因，是通过人工的手段修改原有基因。基因突变，是基因在自然状态下自我拷贝时，不小心出错了。转基因是人为行为，基因突变是自然行为。转基因时间段，目的明确，而基因突变时间漫长，目的随机。但是转基因和基因突变的结果是一样的，都是改变原本的基因。转基因是在人工干预下的基因突变。然而目前很多人都反对转基因食品。他们的理由是转基因的食品不安全，吃了转基因的食品会得癌症或者会绝育，尽管这个理由还没有被完全证实
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2023-09-29 19:50:57
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IGV软件内置了很多的参考基因组，全部放在亚马逊的云服务器上，完整的参考基因组列表见如下链接http://software.broadinstitute.org/software/igv/Genomes每次打开IGV软件的时候，会从该服务器下载一个默认的参考基因组，通常是hg19由于网络原因，可能会下载的非常慢，甚至是下载失败。对于这种情况，我们可以在本地构建一个参考基因组，每次从本地导入
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2022-06-21 09:49:29
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IGV安装Integrative Genomic Viewer(IGV)bam文件可视化必备软件。官方下载：http://software.broadinstitute.org/software/igv/download官方使用说明：http://software.broadinstitute.org/software/igv/book/export/html/6民间中文教程：http://tir
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2024-01-26 22:50:07
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U盘安装Ubuntu 16.04 教程（安装全过程，不包含下载）官网：cn.ubuntu/下载连接：位：http://releases.ubuntu/16.04/ubuntu-16.04-desktop-amd.iso32位：http://releases.ubuntu/16.04/ubuntu-16.04-desktop-i386.iso
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2024-08-22 17:27:33
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当你需要下载并安装 Python 模块时，有几种常用的方法。以下是一些步骤，你可以根据你的需求选择其中一种方法：使用 pip 安装：首先，确保你已经在本地安装了 Python 环境。你可以在命令行中输入 python 来查看你的 Python 版本。如果你的命令行中找不到 pip 命令，你需要手动安装它。输入以下命令：python -m ensurepip确认 pip 是否正常工作，你可以输入 p
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2024-04-08 10:00:11
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