简介在分析二代测序数据，进行变异检测的流程中，人工的确认和解读比对的read是非常重要的。人工的检查极大的提高了检测的可信度，降低假阳性的风险。Integrative
Genomics
Viewer（IGV）是一个提供NGS数据可视化的工具，目前还提供丰富的工具用于检查、验证和解读NGS数据集和其他类型的基因组数据。本文作者展示了IGV变异检查这个功
原创
2021-03-26 11:26:11
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做完mapping之后，需要知道mapped reads在基因组上的分布，所以尝试在ubuntu系统中使用IGV软件，简单记录使用过程，如下：１．下载IGV软件 去IGV官网: http://www.broadinstitute.org/software/igv/download，下载 binary distribution类型软件２．运行IGV软件 软件下载后，直接解压。在命令行运行：sh
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2024-08-06 12:45:10
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找到了一个解释 https://sites.google.com/site/bioinformaticsremarks/bioinfo/sam-...
原创
2022-07-16 00:12:22
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欢
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2022-06-21 09:49:58
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中新社广西凭祥8月1日电 (杨陈 黄金兰 周游)广西交科集团有限公司8月1日介绍，由该公司承建的中越友谊关—友谊货运通道智慧口岸(以下称中越智慧口岸)项目首个IGV(智慧型引导运输车)卡口系统地磅，日前在新二道卡顺利完成吊装，标志着智慧口岸信息化建设加速。
8月1日，中越友谊关—友谊货运通道智慧口岸施工现场。广西交科集团有限公司供图
友谊关口岸位于广西凭祥市，是中国通往越南乃
原创
2024-08-16 17:42:42
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# 二代IGV点突变数据分析
在现代生物医学研究中，第二代测序技术（NGS）已经成为基因组学的一个重要工具。通过二代测序，我们能够获得大量的基因组数据，尤其是点突变信息。这些改变在疾病研究中尤为重要，如癌症生物学。本文将通过点突变数据分析，探讨如何使用IGV（Integrative Genomics Viewer）和Python进行数据处理与可视化。
## 什么是点突变？
点突变是指基因组D
原创
2024-10-09 04:59:53
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一、张量的操作拼接torch.cat(): 将张量按维度dim进行拼接torch.stack()：在新建的维度dim上进行拼接t = torch.ones((2, 3))
t_0 = torch.cat([t, t], dim=0)
t_1 = torch.stack([t, t], dim=0)
print(t_0)
print(t_0.shape)
print(t_1)
print(t_1
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2024-06-18 15:49:18
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#第一种情况 当两个分支内容一致时 分支图如何展示 子分支比主分支少一个节点 少一块功能 其余功能一致 ####在vs2019查看传入/传出 ####可以看到当前分支的状态 、 ####使用sourcetree查看 可以看到dev-yun并不是最新的分支 它是一条内容和master分支一致 且慢一点 ...
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2021-08-31 16:17:00
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命令:AV加空格键，或者双击鼠标中键
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2021-07-09 16:19:24
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在git config文件里面设置别名。git config --global alias.lg "log --graph --all --pretty=format:'%Cred%h%Creset -%C(yellow)%d%Creset %s %Cgreen(%cr) %C(bold blue)
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2020-06-09 16:28:00
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# 深入了解Java火焰图
Java程序的性能优化是开发过程中不可或缺的一部分，其中火焰图是非常有用的可视化工具。火焰图可以帮助开发者识别性能瓶颈，理解程序的调用关系。本文将详细介绍Java火焰图的概念、生成方法以及实际应用，同时也将使用相应的代码示例和图示来说明。
## 什么是火焰图？
火焰图是一种用于可视化程序调用栈的工具，通常用于性能分析。火焰图的每一层代表一个方法调用的堆栈，宽度代表
# 如何使用 Java 查看类图
在 Java 编程中，类图是非常重要的，它展示了类之间的关系及结构，帮助开发者理解代码设计和架构。类图通常在 UML（统一建模语言）中使用，是面向对象设计的核心组成部分。在这篇文章中，我们将探讨如何在 Java 中查看类图，包括示例代码及工具推荐。
## 什么是类图？
类图是 UML 的一种静态结构图，它描述了系统中的类、属性、方法及它们之间的关系。类图为我
欢迎关注”生信修炼手册”!基因组浏览器可以直观的展示基因组及其各种注释信息，是展示NGS数据和分析结果的利器
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2022-06-22 04:52:42
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http://dtpixel.dothinkey.com/
原创
2023-05-11 09:17:15
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# 如何实现 Java 火焰图查看
火焰图是一种用于可视化程序性能分析的强大工具，可以帮助开发者了解方法的耗时情况，从而定位性能瓶颈。本文将详细向你介绍如何实现 Java 火焰图查看，包括每一步的具体代码与作用。
## 1. 实现流程
以下是实现 Java 火焰图查看的基本流程：
| 步骤 | 描述 |
原创
2024-10-06 05:52:11
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加载大图到内存是一件令人头疼的事情。因为大图的原因，我们会在Crash报告中看到OOM(内存不足).Android的内存有限，这一点我们应该心里有数。stackoverflow上有许多相关问题的回答，当你碰到oom时，可以直接跳过本文，粘贴复制答案即可。但是对于其他人来说，我想告诉你们一些加载大图的知识和原理。加载Bitmap到内存so easy.你所需要做的就是使用BitmapFactory解码
# Java查看内存图
在Java开发中，了解内存的使用情况对于编写高效的程序非常重要。通过查看内存图，我们可以分析应用程序的内存使用情况，了解对象的创建、销毁和内存分配情况。本文将介绍如何使用Java工具来查看内存图，并通过代码示例进行说明。
## 内存图简介
内存图是一个用于描述应用程序在运行过程中内存使用情况的图形化表示。它可以显示对象的创建、销毁以及内存分配情况，帮助开发人员找出内存
原创
2024-01-10 03:19:50
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# Android Studio查看类图
Android Studio是一款流行的集成开发环境，用于开发Android应用程序。在Android开发中，经常需要查看应用程序的类图，以便更好地理解应用程序的结构和关系。Android Studio提供了一个方便的功能，可以帮助开发人员快速生成并查看应用程序的类图。
## 什么是类图
类图是一种用于描述类之间关系的图形表示法。类图展示了类之间的继
原创
2024-06-14 06:28:02
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文章目录PyTorch 动态计算图Pytorch张量第一个网络mnist网络初始化和前向传播dataloader/dataprivder优化器和损失函数训练过程完整代码 PyTorch 动态计算图在讨论 PyTorch 的各个组件前，我们需要了解它的工作流。PyTorch 使用一种称之为 imperative / eager 的范式，即每一行代码都要求构建一个图，作为定义完整计算图的一个部分。即
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2023-10-26 14:02:25
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火焰图（flame graph）是性能分析的利器。本文介绍它的基本用法。 一、perf 命令 让我们从 perf 命令（performance 的缩写）讲起，它是 Linux 系统原生提供的性能分析工具，会返回 CPU 正在执行的函数名以及调用栈（stack）。 通常，它的执行频率是 99Hz（每秒99次），如果99次都返回同一个函数名，那就说明 CPU 这一秒钟都在执行同一个函数，可能存在性
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2023-12-19 22:06:28
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