GeneOntology富集分析是高通量数据分析的标配,不管是转录组、甲基化、ChIP-seq还是重测序,都会用到对一个或多个集合的基因进行功能富集分析。分析结果可以指示这个集合的基因具有什么样的功能偏好性,进而据此判断相应的生物学意义。GOEAST,去东方今天向大家推荐一款,中科院遗传所王秀杰老师组2008年发表的在线工具GOEAST,访问网站是http://omicslab.genetics.
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2024-02-25 05:02:16
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对于一个 Go 局部变量,如何确定它被分配在堆上还是栈上? 按照官方 FAQ How do I know whether a variable is allocated on the heap or the stack? 的解释
原创
2022-06-02 20:23:30
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写在前面原本,我并无写这一稿件的想法。主要原因有二:网络上已有相关资料较多,尽管类似的问题天天仍然有人问再谈起 GO富集分析,距离上次已是五六年,简单来说,不想谈如果要找合理解释,那么针对第一点,就是每天仍然有大量新接触生信数据分析的朋友;针对第二点,…在前两天我推的文稿《零基础快速完成基因功能注释 / GO / KEGG / PFAM…》中,评论区答应了下,阅读过5000,那就写一写富集分析。于
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2024-03-27 10:40:14
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1.append 不修改切片内容,所以一般写法 s1 = append(s1,
原创
2022-11-17 00:39:44
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我们的云平台上的GO富集分析工具,需要输入的文件表格和参数很简单,但很多同学都不明白其中的原理与结果解读,这个帖子就跟大家详细解释~一、GO富集介绍: Gene Ontology(简称GO)是一个国际标准化的基因功能分类体系,提供了一套动态更新的标准词汇表(controlled vocabulary)来全面描述生物体中基因和基因产物的属性。GO总
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2024-01-07 21:28:04
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生信学习之通路富集一(GO分析):富集分析的理论知识富集分析(Enrichment Analysis)是一种广泛应用于生物信息学研究的统计方法,主要用于检验一个基因集合中某些功能或特征的富集程度。富集分析的主要目的是从大量基因数据中找出有生物学意义的模式和功能。根据分析的目标和方法,富集分析可以分为以下几种类型:基因本体论富集分析(Gene Ontology Enrichment Analysis
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2023-09-08 23:19:30
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Go和KEGG富集教程前提操作步骤注释中心库 前提假设现在你已经在R官网上下载并安装好了R,并且已经有了自己的基因数据,例如一个excel表格中存放的数据。如下面这种形式。 现在需要做GO富集和KEGG的富集并生成想要的气泡或者通路图。操作步骤安装clusterProfilerif (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
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2024-01-12 11:52:54
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何为功能富集分析?功能富集分析是将基因或者蛋白列表分成多个部分,即将一堆基因进行分类,而这里的分类标准往往是按照基因的功能来限定的。换句话说,就是把一个基因列表中,具有相似功能的基因放到一起,并和生物学表型关联起来。何为GO和KEGG?为了解决将基因按照功能进行分类的问题,科学家们开发了很多基因功能注释数据库,。这其中比较有名的一个就是Gene Ontology(基因本体论,GO)和Kyoto E
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2023-07-02 16:47:58
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Go 语言(或 Golang)起源于 2007 年,并在 2009 年正式对外发布。Go 是非常年轻的一门语言,它的主要目标是“兼具 Python 等动态语言的开发速度和 C/C++ 等编译型语言的性能与安全性”。Go 语言是编程语言设计的又一次尝试,是对类 C 语言的重大改进,它不但能让你访问底层操作系统,还提供了强大的网络编程和并发编程支持。Go语言的用途众多,可以进行网络编程、系统编程、并发
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2023-07-12 00:11:44
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前言Go是编译型语言,Go程序需要经过编译生成可执行文件才能运行,实现编译的命令就是go build。go build使用对指定文件或文件夹编译时的命令如下:go build [-o output] [-i] [build flags] [packages]Go支持交叉编译,可以跨平台编译,如在mac平台编译在linux平台运行的包。如需要交叉编译,可以在go build前添加目标平台、平台架构环
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2023-07-12 00:07:13
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https://www.anquanke.com/post/id/85694https://rednaga.io/2016/09/21/reversing_go_binaries_like_a_pro/?tdsourcetag=s_pcqq_aiomsghttps://github.com/haidragon/golang_loader_assist
原创
2019-01-04 17:35:26
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上篇文章中提到了阅读gRPC源码的几大困难,其中数据结构是基础中的基础。如果连这些数据结构的原理和作用都不了解的话,阅读起代码来肯定事倍功半。因此这篇文章对gRPC提供的数据结构进行讲解。 grpc_closure闭包闭包是一些编程语言中提供的功能,如python. closure就是闭包的英文名称.简单的理解,闭包函数将创建闭包时的上下文中的变量与自己绑定在一起,将变量的生存
本文基于 Go 1.13逃逸分析是 Go 编译器的一部分。它分析源代码并确定哪些变量应该分配到栈上、哪些逃逸到堆上。静态分析Go 在编译阶段就定义了什么应该在堆,什么应该在栈上。在 go run 或 go build 时加上 -gcflags="-m" 就可以得到分析结果。
这里有个简单的例子:func main() {
num := getRandom()
println(*num)
}
GO是Gene Ontology的简称,是基因功能国际标准分类体系。它旨在建立一个适用于各种物种的,对基因和蛋白质功能进行限定和描述的,并能随着研究不断深入而更新的语言词汇标准。GO分为分子功能(Molecular Function)、生物过程(Biological Process)、和细胞组成(Cellular Component)三个部分。富集分析主要用于差异基因在GO term的富集程度...
原创
2021-05-25 09:26:30
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void) { int num = 1234; /* ... */ return #}du
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2022-11-10 12:24:31
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逃逸分析,是一种可以有效减少程序
原创
2023-08-07 22:05:36
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前言单例模式是最简单的一个模式,指的是全局只有一个实例,并且它负责创建自己的对象。单例模式不仅有利于减少内存开支,还有减少系统性能开销、防止多个实例产生冲突等优点。 因为单例模式保证了实例的全局唯一性,而且只被初始化一次,所以比较适合全局共享一个实例,且只需要被初始化一次的场景,例如数据库实例、全局配置、全局任务池等。两个方式单例模式又分为饿汉方式和懒汉方式。饿汉方式饿汉方式指全局的单例实例在包被
互斥锁 前言 本次的代码是基于go version go1.13.15 darwin/amd64 什么是sync.Mutex sync.Mutex是Go标准库中常用的一个排外锁。当一个goroutine获得了这个锁的拥有权后, 其它请求锁的goroutine就会阻塞在Lock方法的调用上,直到锁被释 ...
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2021-10-21 16:07:00
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# R语言GO分析
## 介绍
Gene Ontology(GO)是一种用于描述基因功能和相关生物过程的标准化系统。GO分析是通过将基因与GO术语相关联来解释基因表达数据的功能富集分析方法。在生物学研究中,GO分析被广泛应用于研究基因功能和生物过程。
R语言是一种用于数据分析和统计建模的强大工具。它提供了丰富的包和函数,可以用于进行GO分析。本文将介绍如何使用R语言进行GO分析,并提供相应的
原创
2023-10-26 17:37:46
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Go 中的runtime 类似 Java的虚拟机,它负责管理包括内存分配、垃圾回收、栈处理、goroutine、channel、切片(slice)、map 和反射(reflection)等。Go 的可执行文件都比相对应的源代码文件要大很多,这是因为 Go 的 runtime 嵌入到了每一个可执行文件当中。常见的几种gc算法:引用计数:对每个对象维护一个引用计数,当引用该对象的对象被销毁时,引用计数