实验内容和要求自己构建数据库，可选用 AT&T 数据库，包含自己的人脸，进行 eigenface 人脸识别的训练、识别、重构训练：指定能量百分比，将训练结果输出到 model 文件，展示平均脸与前十个特征脸；识别：装载 model 文件，对输入的人脸图像进行识别，将识别结果叠加在输入的人脸图像上，展示训练库中最相似的图像；重构：装载 model 文件，对输入的人脸图像变换到特征脸空间，然后
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2024-04-22 13:53:21
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edgeR包是进行RNA-seq数据分析非常常用的一个R包。该包需要输入每个基因关于每个样本的reads数的数据，每行对应一个基
原创
2023-10-31 14:58:43
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转录组edgeR分析差异基因edgeR是一个研究重复计数数据差异表达的Bioconductor软件包。一个过度离散的泊松模型被用于说明生物学可变性和技术可变性。经验贝叶斯方法被用于减轻跨转录本的过度离散程度，改进了推断的可靠性。该方法甚至能够用最小重复水平使用，只要至少一个表型或实验条件是重复的。该软件可能具有测序数据之外的其他应用，例如蛋白质组多肽计数数据。可用性：程序包在遵循LGPL许可证下可
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2023-11-03 09:45:11
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#************************************************************ #差异基因：DESeq2/edgeR/limma #************************************************************ # ...
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2021-10-09 16:03:00
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DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析，主要也是用于RNA-Seq数据，同样也可以处理类似的ChIP-Seq,shRNA以及质谱数据。这两个都属于R包，其相同点在于都是对count data数据进行处理，都是基于负二项分布模型。因此会发现，用两者处理同一组数据，最后在相同阈值下筛选出的大部分基因都是一样的，但是有一部分不同应该是由于其估计离散度的不同方法所导致的。 ### DESeq2
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2023-12-11 12:46:12
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欢迎关注”生信修炼手册”!我们都知道raw count的定量方式，是无法直接在样本间进行比较的。所以差异分析
原创
2022-06-21 09:20:39
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因项目的需求，需要对数据进行简单的分类，然后找差异表达基因。 虽然我自知自己在这个过程中的很多方面并不理解透彻，很糊涂的去做。但是我愿意去尝试完成。 现在开始跟着Seurat上面的教程一点点的来做。参考链接：https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html1、加载分析必须的包library(Seurat)
library(dply
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2024-01-11 12:17:10
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文章目录介绍环境搭建软件下载结果展示基因数据下载流程基因数据处理利用GEO分析绘制拟火山图 注意，本 系列 有连贯性，每一步都很详细，每一步都很重要，请耐心读完！！ 介绍本系列文主要依据真实论文制图流程，详细说明制图过程，
其中包括：
1. 基因数据下载
2. 制图所需数据格式
3. 火山图制作流程
4. 聚类热图制作流程环境搭建软件下载结果展示基因数据处理 注意删除末行注释基因
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2023-08-31 16:29:08
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DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析，主要也是用于RNA-Seq数据，同样也可以处理类似的ChIP-Seq,shRNA以及质谱数据。这两个都属于R包，其相同点在于都是对count data数据进行处理，都是基于负二项分布模型。因此会发现，用两者处理同一组数据，最后在相同阈值下筛选出的大部分基因都是一样的，但是有一部分不同应该是由于其估计离散度的不同方法所导致的。 ### D
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2024-05-31 00:53:39
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简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析，主要也是用于RNA-Seq数据，同样也可以处理类似的ChIP-Seq,shRNA以及质谱数据。这两个都属于R包，其相同点在于都是对count data数据进行处理，都是基于负二项分布模型。因此会发现，用两者处理同一组数据，最后在相同阈值下筛选出的大部分基因都是一样的，但是有一部分不同应该是由于其估计离散度
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2023-12-04 17:01:55
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欢迎关注”生信修炼手册”!edgeR 接受raw count的定量表格，然后根据样本分组进行差异分析，具体步
原创
2022-06-21 06:15:08
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1. 基因数据的差异性分析的概念基因差异表达分析（Differential Expression Analysis, DEA）是一种针对不同生物样本或不同处理条件下基因表达量变化的分析方法。它可以用来识别基因在两个或多个样本之间的表达差异，从而帮助我们了解基因在不同生物状态下的功能和调控机制。对于基因芯片的差异表达分析，由于其数据普遍被认为服从正态分布，因此常用的差异表达分析方法是在每个基因上应用
最近搜集整理单细胞研究的时候，看到于2015年发表在nature杂志的文章是：Single-cell analysis reveals a stem-cell program in human metastatic breast cancer cells ，蛮有意思的，居然是 Single-cell multiplex qPCR 数据哦！研究者们首先通过流式预先把细胞分类，分成：basal/ste
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2024-01-12 02:03:02
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目录一、软件安装二、七种基本数据类型的变量定义三、tuple定义的两种方式四、定义一个元素的元组五、定义空元组的两种方式六、tuple类型的两个操作方法的使用(data.count和data.index)一、软件安装1、下载完成后双击执行 python-3.9.0-amd64.exe 程序，进入安装界面。2、自定义安装路径选项下的 “Add Python 3.9 to PA
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2023-06-29 13:03:10
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怎么能快速地掌握Python？这是和朋友闲聊时谈起的问题。Python包含的内容很多，加上各种标准库、拓展库，乱花渐欲迷人眼。我一直希望写一个快速的、容易上手的Python教程，而且言语简洁，循序渐进，让没有背景的读者也可以从基础开始学习。我将在每一篇中专注
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2021-07-18 13:38:21
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Python基础教程（入门教程），30分钟玩转Python编程！这是一篇针对初学者的 Python 基础教程，只要你认真阅读，花费 30 分钟即可快速了解 Python。这篇 Python 入门教程讲解的知识点包括：Python 编程环境的搭建、Python 基本操作入门、Python 数据类型、Python 语句和函数。Python环境下载和配置根据 Windows 版本（64位/32位）从 P
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2023-09-12 22:18:51
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安装python之前，可以看一下python2与python3的区别：点击链接
Window 平台安装 Python:Python下载地址：https://www.python.org/downloads/windows/
Python3：Python2：以下教程以Python2为例：环境变量配置方法一：在环境变量中添加Python目录：win+R 输入cmd回车进入命令窗口： 在命令提
文章目录前言 一、安装python运行环境 1.官网https://www.python.org下载安装包.exe 2.安装python 二、python模块下载 1.配置pip环境变量 2.下载python模块 二、python模块下载 三、第一个python脚本运行 四、相关命令 总结前言之前刷博客看到一个很好玩的python脚本，正好今日闲来无事打算跑起来看看效果，然后开始找pyth
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2023-07-04 17:20:41
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主题：Python基础教程作者：阿木又
?亲爱的朋友们，欢迎来到“ESRG技录橙”。
目录安装 Python基础语法1.输出2.注释3.变量4.运算符5.数据类型6.控制流程7.函数 Python 是一种高级编程语言，具有简单、易学、可读性强等特点，被广泛应用于 Web 开发、数据科学、人工智能等领域。本文将介绍 Python 的基础语法、数据类型、流程控制和函数、模块、文件操作内容
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2023-08-05 22:03:13
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Python3 错误和异常作为 Python 初学者，在刚学习 Python 编程时，经常会看到一些报错信息，在前面我们没有提及，这章节我们会专门介绍。Python 有两种错误很容易辨认：语法错误和异常。Python assert（断言）用于判断一个表达式，在表达式条件为 false 的时候触发异常。语法错误Python 的语法错误或者称之为解析错，是初学者经常碰到的，如下实例>>&g
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2023-07-28 08:02:46
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