edgeR的使用

原创

emanlee 2023-10-31 14:58:43 ©著作权

文章标签 html 数据分析数据 文章分类 JavaScript 前端开发

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edgeR包是进行RNA-seq数据分析非常常用的一个R包。该包需要输入每个基因关于每个样本的reads数的数据，每行对应一个基因，每一列对应一个样本。

安装edgeR

先启动R，然后运行下面代码：

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("edgeR")

使用edgeRlibrary(edgeR)

REF

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/edgeR.html

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