第一代DNA测序技术在1975年，由Sanger等人开创，并在1977年完成第一个基因组序列(噬菌体X174)，全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进(如使用了不同策略的作图法、鸟枪法)，2001年完成的首个人类基因组图谱就是以改进了的Sanger法为其测序基础。一代测序的原理是首先在模板中分别加入A、T、G、C和四种ddNTP双脱氧核苷酸（加入ddNTP序列合成
## 用R语言一代测序结果作图
在基因组学研究中，一代测序是通过测定DNA序列来理解生物体的基因组信息的一种重要方法。一代测序产生的海量数据需要进行分析和可视化，而R语言是一种强大的数据分析和可视化工具，能够帮助研究人员快速、准确地处理测序数据。
### 流程图
```mermaid
flowchart TD
A(获取一代测序数据) --> B(数据质控)
B --> C(比
Splatter是一个用于模拟单细胞RNA测序数据的R包，本文概述并介绍Splatter的功能一、参数功能名称功能说明可以通过splatEstimate函数估计备注nGenes -> (Genes)基因数量要模拟的基因数量√全局参数nCells -> (Cells)细胞数量要模拟的细胞数量√全局参数seed -> [Seed]随机种子用于生成随机数的种子，包括从分布中选择值。通过
一、时间序列的定义 时间序列是将统一统计值按照时间发生的先后顺序来进行排列，时间序列分析的主要目的是根据已有数据对未来进行预测。一个稳定的时间序列中常常包含两个部分，那么就是：有规律的时间序列+噪声。所以，在以下的方法中，主要的目的就是去过滤噪声值，让我们的时间序列更加的有分析意义。二、时间序列的预处理1、平稳性检验：拿到一个时间序列之后，我们首先要对其稳定性进行判断，只有非白噪声的稳定性时间序列
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2020-04-19 12:14:00
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Move mean滑动平均差法直接上代码，原理可以看这个文章。DOI: 10.11821/dlxb201811003#滑动平均差法
Q <- read.csv("D:/OneDrive/UCAS/stu/2022zdx/zdx_data.csv")
n <- length(Q$Runoff)
p <- 19 #假定时间序列周期
Moavse <- function(Q,n
生物信息学生物信息学——基础篇：一至三代测序技术 文章目录生物信息学一、一代测序二、二代测序三、三代测序四、总结 一、一代测序概述：一代测序（又称Sanger测序）。原理：Sanger测序利用一类特殊的核昔酸，即ddNTP (双脱氧核苷三磷酸)：这种核昔酸不能形成磷酸二酯键，故会中断DNA的延长。如果用同位素对ATCG四个碱基进行部分标记，电泳后通过放射显影就可以知道这4个碱基出现的位置。例如针对
Frederick Sanger 是一位1918年出生于美国的生物化学家，曾经两度获得诺贝尔化学奖 。上世纪70年代末，他提出快速测定脱氧核糖核酸（DNA）序列的技术“双脱氧终止法”，也被称作“Sanger法”。早在2001年完成的人类基因组框图，采用的就是该方法。而且因准确率高，直到今天还在广泛使用，也被称为基因检测的金标准。下面我们来看看Sanger法是怎样测得基因序列的。Sanger ...
原创
2022-03-08 14:42:44
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R批量做GSEA分析还没有官方的包，但是clusterprofiler可以做，它调用了最新的gfsea包。Gene Set Testing for RNA-seq - fgsea教程 RNA-seq是利器，大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据，所以RNA-seq的分析需求应该是很大的（大部分的生信从业人员应该都差不多要沾边吧）。普通的转录组套路并不多，差异表达基因、富集分析、WGCN
# R语言一代测序结果分析
## 1. 引言
随着高通量测序技术的发展，一代测序（Next-Generation Sequencing，简称NGS）已经成为了生物学和医学研究中最常用的方法之一。而R语言作为一种功能强大的统计分析工具，被广泛应用于NGS数据的处理和分析中。本文将介绍R语言在一代测序结果分析中的应用，并提供一些具体的代码示例。
## 2. 数据预处理
在进行一代测序结果分析之
原创
2023-07-11 04:56:19
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上次我们分享了：全基因组DNA甲基化实验怎么做：手把手教你做全基因组DNA甲基化测序分析，深受同学们的欢迎。本期，易基因小编给您讲讲简化基因组DNA甲基化实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程等三方面详细介绍。 一、简化基因组DNA甲基化测序（RRBS）技术原理简化基因组甲基化测序 (Reduced Representation Bisulfite S
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2023-08-02 22:09:44
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70代=老产品，功能少但是耐用。不容易死机，抗压能力强。80代=升级产品，功能多了，但是容易出现小问题，抗压能力稍弱。90代=过渡产品，没有准确参数，一切都是为了试验下一代新产品而产生的，所以没有定型，责任感，使命感，感恩这些东西荡然无存。00代=也许是新产品。正宗的新一代。
PS：一个人划归到哪个年代里并不能完全按照出生年份，特别是出生在过渡年份(1970、1980、1990年
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2007-11-05 12:46:43
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Windows 叒准备推出新版本了？据外媒报道称，微软将于 2024 年推出 Windows 12。Windows 12 的传闻，已经有一段时间，去年 10 月，Windows 12 原型系统的用户界面，就被曝光。系统界面包括浮动式任务栏、正面上方居中式消息栏、桌面小部件位于左上角，时间/日期/电池/Wi-Fi 状态位于右上角等元素。根据微软的文件，Windows 12 笔记本电脑将需要配备蓝牙
R语言语言学与R语言的碰撞Xu & YangPhoneticSan 学习参考Discovering Statistics Using RStatistics for Linguistics with RHow to Do Linguistics with RR in ActionAnalyzing Linguistic DataR Graphics Cookbook··· ···Rec
# R语言 载入 基因测序
作为一名经验丰富的开发者，我很高兴能够教会你如何使用R语言来载入基因测序数据。在本文中，我将向你展示整个流程，并提供每个步骤所需的代码和注释，以帮助你更好地理解。
## 流程概览
以下是载入基因测序数据的整个流程的概览：
| 步骤 | 描述 |
| ---- | ---- |
| 步骤 1 | 安装和载入必要的包 |
| 步骤 2 | 导入基因测序数据 |
|
太阳下 早没有新鲜事 现在的事情 重覆着过去 一代过去一代又兴起 曾有的功勋 有谁再提起 大声欢笑 转眼又哭泣 快乐像朝露 悲哀却坚固 辛苦劳碌 只为填满肚腹 日日的反覆 何时才满足 想要留住青春 青春却变老 镜子中的你 已不再像自己 想要抓住永远 永远的爱情 而风从哪里来 而爱往哪里去 今天太阳
原创
2022-05-08 16:47:50
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当我们读小学的时候，读大学不要钱 当我们读大学的时候，读小学不要钱 我们还没能工作的时候，工作也是分配的 我们可以工作的时候，撞得头破血流才勉
原创
2022-01-06 15:03:09
86阅读
# R语言在基因测序中的应用
基因测序是生物医学领域中一项至关重要的技术，通过读取DNA序列，我们能够理解基因组的复杂性以及其对生物体的影响。随着高通量测序技术的快速发展，分析这些数据变得日益重要，而R语言因其优秀的统计分析能力和数据可视化功能，成为了基因测序数据分析的热门工具。
## R语言简介
R语言是一种用于统计计算和图形绘制的编程语言。它拥有丰富的包和函数，能够高效处理和分析各种类型
Meta、索尼今年陆续发布了新款VR头显，与此同时Valve已经两年多没有迭代VR硬件，这让人不禁好奇Valve未来的VR策略。比如，今年Valve发布的硬件产品是Steam Deck掌机而不是VR头显，是否意味着放弃了VR呢？然而从种种迹象表明，Valve多年来一直在内部研发VR相关技术，尽管我们不知道下一款Index什么时候亮相，但通过一些爆料和数据挖掘，或许可以侧面了解Valve目前在VR领
近年来，随着企业的业务形态从线下走到线上，企业的传统业务逐渐向互联网方向转型，对IT系统提出了新的要求，企业级客户纷纷采用云计算作为新一代的IT架构。互联网公司的飞速发展，已经印证了云计算可以对互联网业务提供有力支撑。因此，企业级客户借鉴互联网公司的经验，逐步建立新一代云计算IT架构，以更好地支撑互联网相关新业务。Google作为IT行业的标杆，是云计算领域公认的领头羊之一。Google打造了一套
IT“茫一代”
表面看起来风光无限的高薪IT白领，除了面对高强度的工作压力之外，还有一个职业生涯的十字路口，这里的选择早晚都会出现在你面前。对于大部分的IT从业者来说，当自己的激情消耗殆尽的时候，是走是留就成了一个必选题。以下是腾讯科技带来的一篇报道，写的很不错：
“心在寻找，眼睛才会看见。”
写这句话的人是一个
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精选
2012-11-26 10:41:49
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