01 引言之前发了几篇文章关于矩阵中 特征向量和PCA主元分析的文章，大家反响不错。当时并没有涉及到数学运算，只是大概讲了讲原理。这篇文章我们一起来一步一步解读PCA的计算过程如何用Python实现PCA分析 准备就绪 02 第一步：数据获取第一步，大量的数据收集是必须的。手边此时并没有数据，就通过python自己制造点数据吧。 构造数据框架 我们的项目计划是 看看 白种人和黄种人
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2024-04-20 21:43:42
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# Python做CNV分析
## 1. 什么是CNV？
CNV全称为Copy Number Variation，中文名为拷贝数变异，是指基因组中长度为1kb以上的DNA片段的拷贝数目发生变异的现象。CNV是人类基因组中最常见的一种基因结构变异，它对于人类的遗传多样性和疾病易感性具有重要影响。
CNV的分析可以帮助我们了解基因组的结构变异，揭示基因突变与疾病之间的关联。在过去的几年中，随着高
原创
2023-08-24 20:10:19
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词法分析（Lexical Analysis）：分析由字符组成的单词是否合法，如果没有问题的话，则产生一个单词流。语法分析（Syntactic Analysis）：分析由单词组成的句子是否合法，如果没有问题的话，则产生一个语法树。在词法分析器分析源代码文本的时候，有一个概念需要明确：1.物理行：由回车字符序列（在Windows上是CR LF，在Unix上是LF）结尾的字符序列组成一个物理行
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2023-08-01 15:32:10
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# 使用Python进行EOF分析：解决气候数据问题
EOF（Empirical Orthogonal Function，经验正交函数）分析是一种应用广泛的统计方法，通常用于气候数据的分析。它可以提取主成分，揭示数据的主要变化模式。这在处理气候变化、天气预测以及环境监测等问题时尤为重要。
## 实际问题
假设我们有一组地区的气温数据，想要分析该地区气温变化的主要模式并找出影响气温的主要因素。
# 使用Python进行GO分析
## 介绍
Gene Ontology（GO）是一个用于描述基因和蛋白质功能的标准化分类系统。GO分析是通过将基因与GO词汇相关联来识别基因集合中的生物学过程、细胞组分和分子功能。在这篇文章中，我们将介绍如何使用Python进行GO分析。
## 实际问题
假设我们有一组基因序列数据，我们想要对这些基因进行GO分析，以了解它们在生物学过程中的功能。我们将使用Py
原创
2024-05-01 05:11:06
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现在找工作黄金时间，作为一个测试，经常被面试官问到，什么是装饰器，或者你对装饰器了解多少？ 抛出一个问题，而只会回答，装饰器是装饰函数的，通常是提升函数功能，返回一个函数。然后继续深入问问的话，就自己把自己说挂了。 装饰器：装饰器(Decorators)是 Python 的一个重要部分。简单地说：他们是修改其他函数的功能的函数。他们有助于让我们的代码更简短，也更Pythonic
欢迎关注”生信修炼手册”!基于全基因组数据来检测CNV是非常有效的一个手段，然而全基因组的成本还是挺高的。全
原创
2022-06-21 09:25:36
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欢迎关注”生信修炼手册”!CNV全称为Copy Number Variatiosn, 即拷贝数异常，是广泛存
原创
2022-06-21 09:56:35
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欢迎关注”生信修炼手册”!CNVkit是一款CNV预测软件，适用于全外显子，目的区域靶向测序等数据的CNV检
原创
2022-06-21 09:25:22
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# 用Python进行GATA家族分析
## 引言
GATA家族是一组重要的转录因子，参与了多种生物学过程，包括细胞发育、分化和疾病。本文将介绍如何使用Python进行GATA家族的分析，以识别和分析这些转录因子在不同条件下的表达模式。我们将使用公开的基因表达数据集，结合一些常用的Python库（如Pandas、Matplotlib、Seaborn和Biopython）来实现这一功能。
##
每周专业学习周记-1标签（空格分隔）： 周记说明：接下来的每一周都将会跟新我的专业学习周记，内容包括代码+总结。目前主要除了课程内的《数据结构与算法》课程之外，还有Python语言学习，Python作为现在比较热门并且易入门的编程语言，学习它无论是用作工具还是提升自己都会有很好的帮助，教材使用【美】《Python编程从入门到实践》。
接下来的每周我将会持续更新我的学习情况。数据结构篇#includ
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2023-12-18 14:58:00
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什么是CNV？ copy number variation (CNV) A copy number variation (CNV) is when the number of copies of a particular gene varies from one individual to the
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2021-05-07 14:49:00
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# 用Python进行视频分析：新手入门指南
作为一名刚入行的开发者，你可能对如何使用Python进行视频分析感到困惑。别担心，本文将为你提供一个详细的入门指南，帮助你快速掌握视频分析的基础知识。
## 1. 视频分析流程
首先，让我们通过一个表格来了解视频分析的整体流程：
| 步骤 | 描述 |
| --- | --- |
| 1 | 安装必要的库 |
| 2 | 读取视频文件 |
|
原创
2024-07-25 08:41:38
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# 用Python做实证分析
在现代社会，数据已经变得异常重要。数据分析已经成为了许多领域中的一个重要组成部分，其中实证分析是一种通过对数据进行统计分析和模型建立来验证假设的方法。Python作为一种功能强大且易学易用的编程语言，被广泛应用于数据分析和实证研究中。
## 什么是实证分析
实证分析是一种基于数据和事实进行研究的方法。它通过对数据进行收集、整理、分析和解释，来验证或者推翻一个假设
原创
2024-06-12 05:32:48
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1.python-梯度下降法 做重回归分析准备好数据文件csv： 直接上代码：import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
data=np.genfromtxt('./漫画数据2.csv',delimiter=',')
x_data=data[:,:-
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2024-05-30 12:08:34
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欢迎关注”生信修炼手册”!相比全基因组，全外显子组只针对外显子区域进行测序，更加的经济高效。全外显子利用特定
原创
2022-06-21 09:25:10
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keams聚类：（可以试试） scipy cluster库简介scipy.cluster是scipy下的一个做聚类的package, 共包含了两类聚类方法: 1. 矢量量化(scipy.cluster.vq):支持vector quantization 和 k-means 聚类方法 2. 层次聚类(scipy.cluster.hierarchy):支持hierarchical cluster
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2024-02-04 07:56:20
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公司财务小姐姐每月需要根据如下报表统计出本月、上月、去年同期的销售额、客流量、客单价数据：每个月都要手动计算，非常耗费时间，本着乐于助人的原则，我用python写了个小程序，能够实现自动生成财务报表，现把具体过程分享给大家：一、pandas导入数据源import pandas as pd
data=pd.read_csv('数据模板.csv',encoding='gbk',parse_dates=
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2023-08-08 11:23:56
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OS模块函数os.getcwd()：功能：获取当前目录，python的工作目录。cwd = os.getcwd()
print(cwd)
打印结果：C:\Users\complexzx\Desktopos.environ[ ]os.environ['USER']:当前使用用户。
os.environ['LC_COLLATE']:路径扩展的结果排序时的字母顺序。
os.environ['SHELL
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2023-11-07 08:14:28
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一、什么是AARRR模型，以及为什么它如此受欢迎？让我们深入了解Dave McClure的模型。AARRR代表：用户拉新Acquisition 用户激活Activation 用户留存Retention 用户推荐Referral 商业收入Revenue二 、RARRA模型是托马斯·佩蒂特Thomas Petit和贾博·帕普Gabor Papp对于海盗指标-AARRR模型的优化。RARRA模型突出了用
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2023-10-03 11:30:01
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