东北林大《Plant cell》报道木质素研究新发现
GFF1、GFF2、GFF3格式
Bowtie和Bowtie2使用 1. 下载Bowtie和Bowtie 2都可以在这里下载： http://sourceforge.net/projects/bowtie-bio/files/这里以 Building from source 为例
Bowtie和Bowtie2使用【怪毛匠子整理】Source URL: http://www.bbioo.com/lifesciences/40-112837-1.htmlBowtie和Bowtie2使用碱基 序列 种子 前导链 错配 基因组 末端标题: Bowtie和Bowtie2使用摘要: [Bowtie
一、转录组还是基因组？是基因组测序（DNA-seq）还是转录组测序(mRNA-seq)。其中的区别是对于真核生物而言，mRNA序列与DNA序列并不完全相同，在经历了后剪切之后，成熟的mRNA可能是原基因的一部分，甚至顺序及个别碱基会产生变化。如果是mRNA测序，那map工作就会在DNA测序map的基础上再多一步，map到转录组上去。所以最为流行的做法是，（使用BWA来进行ChIP-seq测序）使
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2024-08-06 09:07:03
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前言高通量测序技术又称为下一代测序技术，以能一次并行比对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和读长较短为标志，其中比较出名的有Roche454焦磷酸测序、IlluminaSolexa合成测序和ABISOLiD连接法测序。测序得到read进行质控后，就是对read进行比对，所以随之产生了许多用来比对的软件。今天小编给大家介绍BWA与Bowtie这两个软件，BWA全称为Burrows-Wheeler
原创
2021-03-27 07:28:40
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1. 介绍2. 安装2.1下载2.2 解压2.3 设置环境变量3. 使用3.1 命令3.1.1 必需参数3.1.2 可选参数（常用）3.2 构建索引3.2.1 官方索引3.2.2 自建索引3.3 例子3.3.1 例子：M. musculus, UCSC mm101. 介绍Bowtie2 是将测序reads与长参考序列比对工具。适...
原创
2022-03-08 14:12:26
2973阅读
gyuigod
原创
2020-12-20 14:23:52
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What is Bowtie 2? Bowtie 2 is an ultrafast and memory-efficient tool for aligning sequencing reads to long reference sequences. It is paror 1,0...
原创
2023-11-07 11:45:24
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现在Linux是非常火的 很多人喜欢用它，界面简单，操作容易，有很多图形化工具如WinSCP可以与Ubuntu进行文件的上传的与下载，Xshell就是如同控制ubuntu的终端一样，简单方便，不过要在Windows下图形化访问Ubuntu或其它Linux系统桌面环境有很多方法，我比较喜欢的是使用VNC服务，需要在Ubuntu下安装VNC Server和在Windows下安装客户端访
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2023-09-04 11:09:05
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下载Bowtie程序是在Linux系统上进行基因组比对分析的重要工具之一。Bowtie程序是一款快速而高效的比对工具，在生物信息学领域有着广泛的应用。今天我们将介绍如何在Linux系统上下载和安装Bowtie程序。
首先，让我们来了解一下Bowtie程序的特点和优势。Bowtie程序采用了一种新的算法，能够快速而准确地比对 DNA 序列。它支持单端和双端比对，并且具有较高的灵敏度和准确性。此外
原创
2024-03-25 11:41:36
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感谢好友 sc ！Ubuntu 编译安装内核（2）; 卸载内核方法
原创
2022-06-21 12:19:22
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# 如何在Ubuntu上安装Python 2
## 概述
在Ubuntu上安装Python 2相对比较简单，但对于一名刚入行的小白来说可能会有些困惑。在本文中，我将向你展示如何在Ubuntu系统上安装Python 2，并解释每一步需要做什么，包括相应的代码和注释。
## 安装步骤
以下是安装Python 2的步骤：
```mermaid
flowchart TD
A[更新软件包列表]
原创
2024-07-12 05:55:08
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一、Git安装： 1、 二进制方式安装：$ sudo apt-get install git-core 安装完成后，在终端中输入 git 就可以看到相关的命令了。如果只是需要使用git来管理本地的代码，那么现在 就 可 以使用了。如果需要和github上的项目结合，还需要做其他的一些操作。 2、github帐号的申请 如果只是需要将github上感兴趣的代码拷贝到本地，自己进行修改使用，
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2023-10-18 19:02:51
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由于16.04 server 默认安装python 3.X ,部分应用需要依赖2.7 原文：https://www.jianshu.com/p/743967c7ab1b安装：下载Python2包，最新的版本为2.7.15
wget https://www.python.org/ftp/python/2.7.15/Python-2.7.15.tgz
解压缩
tar -xvf Python
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2023-06-20 15:36:51
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安装中文版火狐浏览器第一步：先卸载：sudo apt-get remove firefox第二步：安装：sudo apt-get install firefox第三步：设置成中文；sudo apt-get install firefox-locale-zh-han 安装google-chrome下载:wget https://dl.google.com/linux/direct/goog
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2024-01-03 07:20:34
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这篇文章是在重装了5次Ubuntu系统后写下的。当然，万恶之源就是这篇文章的主题——安装NVIDIA显卡驱动！之前按照网上的“教程”安装，不是在切换到了命令行界面再也回不去图形界面了，就是卡在登录界面反反复复，亦或是黑屏、暗屏…或许是我领悟力太差，没有get到这些“教程”的灵魂吧。目前，网上Ubuntu安装NVIDIA显卡驱动的教程大体可分为两种方法：1、使用Ubuntu软件仓库中的稳定版本安装具
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2023-10-10 10:00:43
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１、查看现在python的位置which python２、解压安装包tar xvf Python-2.7.10.tgz３、指定安装路径cd Python-2.7.10
./configure --prefix=/usr/local/python24、编译并安装make
sudo make install5、创建链接将python指向2.7版本在terminal中输入python，进行交互式环境，发
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2023-06-26 09:54:35
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Bowtie使用介绍Bowtie（下载）是一个超级快速的，较为节省内存的短序列拼接至模板基因组的工具。它在拼接35碱基长度的序列时，可以达到每小时2.5亿次的拼接速度。Bowtie并不是一个简单的拼接工具，它不同于Blast等。它适合的工作是将小序列比对至大基因组上去。它最长能读取1024个碱基的片段。换言之，bowtie非常适合下一代测序技术。在使用bowtie前，需要使用bowtie-buil
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2024-01-10 20:10:45
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1. 安装redis
（1）安装redis server： sudo apt-get install redis-server （安装后redis默认启动）
（2）查看redis进程： ps -aux|grep redis （127.0.0.1:6379对应进程号）
（3）通过pid查看redis服务状态： netstat -nlt|grep 6379 （tcp/tcp 6均处于list
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2023-07-28 14:28:33
146阅读
error：
用客户端能正常登录收发邮件，但用域名登录报错，
nslookup结果如下：
C:\Documents and Settings\l**>nslookup mail.m.cn
DNS request timed out.
timeout was 2 seconds.
*** Can't find server name for a
原创
2011-07-18 15:10:34
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使用apt-get安装
#sudo apt-get install openssh-server
安装完成后即可用SecureCRT登入Linux.
若登入很慢,可以设置如下:
#vim /etc/ssh/sshd_config
将以下两行注释掉
#GSSAPIAuthentication yes
#
原创
2012-07-30 17:55:03
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