第三代长序列测序技术为获得高质量的基因组数据提供了机遇。二代测序会产生很多数百个碱基大小的读长，而三代测序的读长可以长达10kbp。这种长读长对基因组的从头组装、基因组结构变异和基因分型（phasing）有重要的意义。自从二代测序技术商业化以来，很多测序平台相继出现，比如Roche/454（2005年），Illumina/Solexa（2007年）等。这些测序平台使得测序价格大幅下降。因此，人们可
原创
2020-12-29 20:44:49
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一、测序原理先介绍 Nanopore 测序中的几位主角：Reader ：在自然界中，有一种可以嵌入到细胞膜中作为离子或分子通道的跨膜蛋白，具有天然的蛋白纳米孔。经过人为基因工程修饰后，得到的就是 Nanopore 测序所需的 Reader 蛋白。Membrane：Reader 蛋白会被嵌入到高电阻率的 Membrane
原创
2022-03-08 15:57:57
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文章目录一、基本原理二、构建文库三、测序芯片四、上机测序五、测序模型1、Circular Consensus Sequencing (CCS)
原创
2022-03-08 15:59:18
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目前主流三代测序平台除了Oxford 家的 Nanopore，还有 Pacific Biosciences（简称 PacBio）公司的 Single Molecule Real-Time（SMRT）Sequencing。该平台的优势在于： 在不会影响吞吐量和准确性的前提下，提供目前最长的 25 kb 的 Reads 长度如果不含系统误差，准确度可达 99.999％，这样高质量的
论文https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-020-02244-4Ratatosk: hybrid error correction of long reads enables accurate variant calling and assemblyhttps://github.com/Decod
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2022-03-28 10:09:37
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论文lra: A long read aligner for sequences and contigshttps://journals.plos.org/ploscompbiol/article?id=10.1371/journal.pcbi.1009078https://github.com/ChaissonLab/LRA安装直接使用condaconda install -c
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2022-03-28 10:23:33
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SV鉴定方法概述 近日，范德堡大学发表一篇关于长读长鉴定SV比较的文章。 Tradeoffs in alignment and assembly-based methods fo
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2024-06-23 12:52:30
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# 如何实现“三代 NLP”
在自然语言处理（NLP）的领域，“三代 NLP”指的是基于深度学习的模型，如 Transformer、BERT 和 GPT 等。对于新手来说，实现这一系列模型可能会感到困惑，但其实只需要按照一定的流程即可成功。以下是实现三代 NLP 的步骤和核心代码示例。
## 实现流程
以下流程图展示了实现“三代 NLP”的基本步骤：
```mermaid
flowchar
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2024-09-06 04:16:52
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本文主要和广大的电脑爱好者分享内存条怎样区分是几代的？希望能够给大家带来更多实用的电脑知识，首先为大家介绍的是三代内存条的全家照（下图），从上到下分别是DDR3、DDR2、DDR。大家牢牢记住它们的样子，因为后面的内容会提到这幅图。  
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2023-08-01 11:46:19
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PacBio+BioNano+Hi-C+遗传图谱薏苡，又称薏米或薏苡仁，起源于亚洲，是远古乃至中国夏商时代最重要的作物之一。据文献记载及考古学发现互相印证，薏苡在中国有~7000年的栽培和驯化历史[1]。薏苡除了作为我国原产的传统药、食两用经济作物之外，还兼具很高的饲用和观赏价值[2-4]。然而目前为止，关于其农艺性状的遗传基础、系统进化和驯化的基因组位点都知之甚少。为了解决上述问题，中国农业大学
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2022-09-01 11:50:48
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目录计算机科学的发展Unix操作系统GNU计划Lunix开源许可 在我们的工作及学习中，由于业务或者工程上性能的要求，我们总要引入一些开源软件，这些开源软件极大的方便了我们的开发工作、缩减了开发时间、丰富了我们的业务和工程功能，但是伴随开源软件的还有一个紧箍咒“开源许可”，比如GPL、LGPL、MIT、Apache许可等等，那为什么会产生许可、出现的历史背景是什么、对我们的业务有什么影响？
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2023-12-26 23:07:35
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fastq格式 使用 seqkit这个工具 seqkit帮助文档的链接https://bioinf.shenwei.me/seqkit/usag...
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2022-03-18 09:36:27
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目 录16-数据表设计-第一范式1NF1、举例1（student2数据表）2、举例2（student2数据表==拆字段==》student3数据表）17-数据表设计-第二范式2NF1、订单表（联合主键=>共同组成订单表的主键）2、订单表问题（不满足2NF）3、拆表18-数据表设计-第三范式3NF19-查询练习-数据准备1、新建一个查询用的数据库：selectTest2
经过上期两款B550M的对比，相信大家对次顶级B550的性能有了比较清晰的认知。可许多同学却觉得两块800+的B550有点贵，自己也就上个3500X、3600这种千元级别的CPU而已，主板预算也就五百多。可是呢，就着买新不买旧的原则，有些同学又对B550M有点心动。其中问的最多的就是曾经开车价599元的技嘉B550M AORUS ELITE与开车价599元的微星B550M Bazoo
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2023-10-30 14:47:19
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“售前穷三代，PM毁一生”，其实是句戏言，广大售前和PM们苦中作乐的一种自嘲。但我确实看到很多售前同学们，在入行三五年之后，就感觉到了瓶颈，这种瓶颈不仅是职级层面的，也是收入层面的。这种情况，在从事硬件产品售前的人群中尤为明显，大家普遍感到迷茫。于是，有人心下念念的要转型做销售，走另一条同样艰辛、但不枯燥重复、甚至偶有惊喜的职业路线。有人则从A厂跳B厂，
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2021-05-13 06:48:58
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中国自主知识产权三代核电技术“华龙一号”，是中国核电自主创新和集成创新的集大成者，已成为中国与高铁齐名的“国家名片”。 中新社记者中广核摄中国核电已成为世界能源市场一支不容忽视的力量。中国核学会理事长、中国工程院院士李冠兴日前表示，核能在中国已进入规模化发展的新时期，中国正在成为核电发展的中心，并为全球核能发展注入强劲动力。在建机组规模位居世界第一，技术路线“百花齐放”，在三代堆型中，既有从国外引
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2023-08-30 14:01:01
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# Java二代三代代码的实现流程
## 概述
在开始之前，我们需要明确Java二代三代代码的实现流程。下面是一个简单的表格展示了这个流程：
| 步骤 | 描述 |
| ------ | ---------------------------------------------
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2023-12-19 09:28:01
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文章 Assembly of chloroplast genomes with long- and short-read data: a com...
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2022-03-18 11:38:18
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经过基因组的比较之后，就发现了目标菌株的一些特殊序列 (例如：短的SNP/InDel，或长片段结构变异，无非就是这些)
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2024-06-26 17:30:34
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这个问题部分地解决了： 仍存在的"Error"可能与原核特殊的密码子使用、基因组存在g称...
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2023-04-26 10:12:08
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