导读本文整理了R语言绘图中使用频率较高的程序包,每个程序包都附载相应的参考来源链接(链接里有实现绘图的脚本)和下载链接。另:茗创科技为大家提供免会员极速下载服务,需要相应程序包的小伙伴可以私信茗创科技周翊工程师,微信号MCKJ-zhouyi或17373158786。gganimate:在R中绘制动态图gganimate在CRAN上可通过install.packages('gganimate')来安
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2023-11-05 19:59:46
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广义线性模型扩展了线性模型的框架,它包含了非正态的因变量分析广义线性模型拟合形式:$$g(\mu_\lambda) = \beta_0 + \sum_{j=1}^m\beta_jX_j$$
$g(\mu_\lambda)为连接函数$. 假设响应变量服从指数分布族中某个分布(不仅仅是正态分布),极大扩展了标准线性模型,模型参数估计的推导依据是极大似然估计,而非最小二乘法.
可以放松Y为正态分布的假设
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2023-11-22 15:34:29
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# R语言VGAM包的介绍
## 什么是VGAM包?
VGAM(Vector Generalized Additive Models)是R语言中的一个强大包,主要用于拟合各种类型的广义加性模型。这种模型可以处理多种数据类型,包括数量型、分类型以及时间序列数据等。VGAM包的灵活性和功能丰富性使其在统计建模、数据分析和计量经济学等领域受到广泛应用。
### VGAM包的主要功能
VGAM包支
广义可加模型(generalized additive models,GAMs)是广义线性模型和可加模型的结合,由 Hastie T 和 Tibshirani R于1986 年首先提出,其不要求应变量与自变量满足线性关系,适用于非线性数据的研究。 发本文章的起因为收到粉丝投稿要求我做个这样的图,来自于2017年发表在Eur Urol期刊(SCI IF=17.9分)。The Impact of Lo
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2023-09-11 12:37:59
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Author:龙箬 多元数据的直观表示及R使用均值条图及R使用> X=read.table("clipboard",header=T)
> X运行结果如下:食品 衣着 设备 医疗 交通 教育 居住 杂项
北京 4934.05 1512.88 981.13 1294.07 2328.51 2383.96 1246.19 649.66
天津 4
前言 最近想试一下捣腾一个 R 包出来,故参考了一些教程。现在看到的最好的就是谢益辉大大之前写过的开发R程序包之忍者篇,以及 Hadley 大神(ggplot2 devtools 等一系列包的作者)的 教程。但是前者有一些过时,后者是全英文的,所以我这里记录一下比较简单的过程,给读者们一个参考思路。如果你有一些 R 程序,想塞到去一个自创的 R 包中,那么这篇文章就可能是你想要的。为了方
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2023-09-02 15:12:54
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2.3.6 导入 SPSS 数据
IBM SPSS数据集可以通过foreign包中的函数read.spss()导入到R中,也可以使用Hmisc
包中的spss.get()函数。函数spss.get()是对read.spss()的一个封装,它可以为你自动设
置后者的许多参数,让整个转换过程更加简单一致,最后得到数据分析人员所期望的结果。
首先,下载并安装Hmisc包(foreign包已被默认安装
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2024-02-28 10:47:41
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1. vim 删除一列先使用ctrl + v,移动方向键,选择矩形区域,然后按 d 进行删除如果要在每一列前面加一个“{ ”------>修改列为特殊字符(ctrl + v选好后使用r替换成特殊字符),然后使用:%s替换命令如果要在每一列后面加一个“},” ------> 1. 修改最后一个字符为特殊;2. 使用命令“:%s /,\r/
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2024-08-20 20:02:48
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数据挖掘主要分为4类,即预测、分类、聚类和关联,根据不同的挖掘目的选择相应的算法。R语言博大精深,吸纳了来自各方的挖掘算法包,这些包都是由统计学家或是算法研究人员提供,我们可以站在这些伟人的肩膀上实现算法的应用。下面对常用的数据挖掘包做一个汇总:连续因变量的预测:stats包stats包stats包rpart包RWeka包adabag包adabag包randomForest包e1071包kernl
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2023-06-21 18:36:04
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qgg包:一款大规模数量遗传和基因组分析的R包一、概述该包基于:假设基因组特征可能会富集影响性状的因果变体。根据以往的研究和不同的信息来源,可以分成几种基因组特征,如基因、染色体或生物途径。1、核心功能拟合线性混合模型 构建基因组关系矩阵 估计遗传参数(遗传性和相关性) 基因预测 单标记关联分析 基因集合富集分析2、qgg利用以下处理大规模数据使用openMP的多核处理 在BLAS库(如OpenB
另外再推荐一个在线绘制venn图的网站(除了广告较多都挺好的):https://www.meta-chart.com/venn具体包括下面三个包: limma、venneuler、VennDiagram。总的来说,三个包都有着各自的不足。下面会一一进行说明,这里先放上结论:综合方便程度以及函数的多样性而言,VennDiagram > venneuler > limma。limma首先针
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2024-01-25 16:49:11
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转录组edgeR分析差异基因edgeR是一个研究重复计数数据差异表达的Bioconductor软件包。一个过度离散的泊松模型被用于说明生物学可变性和技术可变性。经验贝叶斯方法被用于减轻跨转录本的过度离散程度,改进了推断的可靠性。该方法甚至能够用最小重复水平使用,只要至少一个表型或实验条件是重复的。该软件可能具有测序数据之外的其他应用,例如蛋白质组多肽计数数据。可用性:程序包在遵循LGPL许可证下可
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2023-11-03 09:45:11
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R 2.14.0版本以后,parallel包被作为核心包引入R,这个包主要建立在 multicore 和 snow 包的工作基础之上,包含了这两个包大部分功能函数,以及集成了随机数发生器。实际上对于R来说,并行化可以在不同的层级上实现:比如,在最底层,现在的多核CPU可以实现一些基础的数值运算(比如整数和浮点算数); 高级一点的,一些扩展BLAS包使用多线程并行处理向量和矩阵的操作,甚至有些R扩展
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2023-12-09 12:17:34
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R语言利用ALL数据集作柱状图和热图#下载数据包
#BiocManager::install(“ALL”)
#BiocManager::install(“Biobase”)#加载数据包
library(“ALL”)
library(“Biobase”)#载入数据集
data(“ALL”)#查看相关消息
ALL‘筛选数据子集,并且将数据存入case1内,条件一:BT列数据在前五行的集合内
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2023-08-09 20:55:45
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(课程视频链接:https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?p=1)1.R语言 R语言是S语言的一种实现。R是一个全面的统计研究平台,提供了各式各样的数据分析技术,拥有顶尖的绘图功能。 R
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2023-10-30 21:30:41
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[更新~] Python网络爬虫与文本数据分析dplyr简介dplyr是R语言的数据分析包,很像python中的pandas,能对dataframe类型的数据做很方便的数据处理和分析操作。最初我也很奇怪dplyr这个奇怪的名字,我查到其中一种解释d代表dataframeplyr是英文钳子plier的谐音library(tidyverse)## ── Attaching packages ─────
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2024-08-02 22:36:37
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目录引言1、数据构造2、筛选2.1 dplyr::filter基本语法:案例2.2 sqldf:sqldf关键字select、from、where、where3、排序3.1 dplyr::arrange3.2 sqldf:sqldf关键字:order by4、选择列4.1dplyr::select4.2 sqldf::select5、创建新的变量5.1 dplyr::mutate5.2 sqld
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2023-08-18 14:48:10
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文章目录包检查可用R语言的包1. 获取包含R包的库位置2. 获取已安装的所有软件包列表3. 获取当前在R环境中加载的所有包4. 安装一个新的软件包有两种方法安装:5. 加载包到当前R环境6. 卸载包包R语言的包是R函数,编译代码和样本数据的集合。 它们存储在R语言环境中名为“library”的目录下。默认情况下,R语言在安装期间安装一组软件包。 随后添加更多包,当它们用于某些特定目的时。 当我们启
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2023-05-18 22:26:36
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1. stringr介绍stringr包被定义为一致的、简单易用的字符串工具集。所有的函数和参数定义都具有一致性,比如,用相同的方法进行NA处理和0长度的向量处理。字符串处理虽然不是R语言中最主要的功能,却也是必不可少的,数据清洗、可视化等的操作都会用到。对于R语言本身的base包提供的字符串基础函数,随着时间的积累,已经变得很多地方不一致,不规范的命名,不标准的参数定义,很难看一眼就上手使用。字
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2023-10-17 08:48:18
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shiny包学习笔记(一)认识shiny第一个例子(01_hello)认识shiny APP的构成用户界面 (ui)服务器功能 (server)shinyApp函数 认识shinyshiny是一个R的软件包,它使得直接从R构建交互式web app更加简单。 shiny包中有11个例子,可以非常形象直观地解释shiny的工作方式。第一个例子(01_hello)认识shiny APP的构成shiny
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2023-08-06 20:02:21
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