前言主坐标分析（principal co-ordinates analysis，PCoA）是一种非约束性的数据降维分析方法，可用来研究样本群落组成的相似性或相异性。PCoA以样本距离为整体考虑，应用非常广泛。这期，我们用R语言ggplot2来实现PCoA可视化。引用https://zhuanlan.zhihu.com/p/389494756 （在线作图丨数据降维方法②——主坐标分析PCoA） ht
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2023-08-21 15:08:08
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par()函数：用来设置画图参数的函数par()的作用直到画板被关闭为止 1.设置背景颜色#设置背景颜色
> par(bg="gray") #设置画板背景色
> plot(rnorm(100)) #如果在plot函数中设置了背景颜色，则会覆盖par命令
#只设置坐
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2023-05-23 10:23:29
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Simulation今天学习的内容是模拟 —— Simulation，在统计和一些其他的应用中很重要，所以在这里介绍一些R语言中可以做模拟的函数。用于模拟已知概率分布的数字和变量有些函数可以直接生成符合某种概率分布的随机数字或变量，例如：rnorm()：指定一个均值和标准差，即可生成符合正态分布的随机数字变量rpois()：从已知平均发生率（rate）的泊松分布中生成泊松随机变量一共有四类基本的函
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2023-06-21 22:42:13
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接前文：R语言基础(一)：注释、变量3.常用函数函数就是一些已经编写好的功能，我们拿过来直接使用就可以了。3.1 查看变量ls()也许你清空了控制台，看不到之前的变量。但是它一直存在于系统中。我们可以使用ls()函数查看已经定义过的变量(后续内容中：>开头的行是代码，[1]开头的行是运行结果，同学们在写代码的饿时候，不需要写每行开头的>)。> x<-10
> y<
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2023-05-22 14:25:10
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par函数概述在R绘图时，有时我们想在一个绘图区中同时绘制多幅图。在R语言中可以有多个函数来实现此要求。这里先介绍一下绘图参数par函数的使用。R中的par()函数可以将绘图区分割成规则的几个部分。多图环境用参数mfrow或参数mfcol来设定，如：par(mforw=c(3,2))则是在同一绘图区中绘制3行2列共6个图形，而且是先按行绘制，即绘制完第1行的2个图形后，再绘制第2行的2个图形，最
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2023-06-01 15:22:31
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在R语言的帮助文档里，apply函数的功能是：Retruns a vector or array or list of values obtained by applying a function to margins of an array or matrix.就是说apply把一个function作用到array或者matrix的margins(可以理解为数组的每一行或者每一列)中，返回值时v
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2024-07-19 16:25:22
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R语言使用rnorm函数生成正太分布数据、使用qqnorm函数绘制QQ图、如果向量为正态分布则数据点基本在一条直线上目录R语言使用rnorm函数生成正太分布数据、使用qqnorm函数绘制QQ图、如果向量为正态分布则数据点基本在一条直线上R 语言特点R语言使用rnorm函数生成正太分布数据、使用qqnorm函数绘制QQ图、如果向量为正态分布则数据点基本在一条直线上R 语言特点R 语言环境软件属于 G
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2023-08-08 14:52:34
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R语言中diag函数用于获取矩阵的对角线元素001、dat <- matrix(1:9, nrow = 3) ## 生成矩阵（方阵，行列相等）
dat
diag(dat) ## 取对角线元素 002、非方阵情况dat <- matrix(1:15, nrow = 3) ## 生成3行5列矩阵
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2023-05-23 11:31:32
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dplyr 包提供了一系列好用的函数，用来进行数据处理和转换，掌握之后可以高效解决数据处理中的绝大多数问题，我们先来看一下 dplyr 包最核心的 5 个函数。select: 筛选字段filter: 按条件过滤arrange: 按字段排序mutate: 创建新字段summarize: 数据汇总这一章需要使用 gapminder 数据集，该数据集记录了 140 多个国家的人口、寿命、国内生产总值(g
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2023-08-09 20:34:30
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在使用R语言作图时，有时需要在图上标注诸如求和、积分、上下标等数学符号，该操作可以通过expression函数完成。
expression(...)
括号中输入数学表达式，配合plot、text、title、axis等函数使用，可以将数学公式绘制在图表上。
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2023-05-30 10:21:07
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两模型比较：anova（）函数：可以比较两个嵌套模型的拟合优度。fit1<-lm(Murder~Population+Illiteracy+Income+Frost,data=states)
fit2<-lm(Murder~Population+Illiteracy,data=states)
anova(fit2,fit1) 结论：p=0.994，不显著，不需要将Income
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2023-05-23 09:26:04
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加载包# install.packages(lubridate)
library(lubridate)第一个函数ymd():解析日期为年月日格式x <- c("09-01-01", "09-01-02", "09-01-03")
ymd(x)[1] “2009-01-01” “2009-01-02” “2009-01-03”x <- c("2009-01-01", "2009-01-0
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2023-05-23 12:26:01
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函数 kron 格式 C=kron (A,B) kron即为Kronecker积，所谓Kronecker积是一种矩阵运算，其定义可以简单描述成： X与Y的Kronecker积的结果是一个矩阵：X11*Y X12*Y … X1n*Y X21*Y X22*Y … X2n*Y …… Xm1*Y 
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2023-12-21 23:25:15
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R语言实际上是函数的集合，用户可以使用base，stats等包中的基本函数，也可以自己编写函数完成一定的功能。但是初学者往往认为编写R函数十分困难，或者难以理解。这里对如何编写R函数进行简要的介绍。函数是对一些程序语句的封装。换句话说，编写函数，可以减少人们对重复代码书写，从而让R脚本程序更为简洁，高效。同时也增加了可读性。一个函数往往完成一项特定的功能。例如，求标准差sd,求平均值，求生物多样性
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2023-06-25 13:57:15
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数据作为信息的载体，要分析数据中包含的主要信息,即要分析数据的主要特征（即数据的数字特征), 对于数据的数字特征, 包含数据的集中位置、分散程度和数据分布，常用统计项目如下：集中趋势统计量:离散趋势统计量：标准差（sd)、方差（var)、极差（range)、变异系数(CV)、标准误、样本校正平方和（CSS）、样本未校正平方和（USS）分布情况统计量：偏度、峰度示例函数 集中趋
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2024-01-25 15:42:32
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R语言paste函数解析目录R语言paste函数解析paste函数理解sep 和collapse参数与expand.grid函数联合使用实现循环拼接paste函数paste函数的作用就是将R对象转换为字符后连接向量。paste (..., sep = " ", collapse = NULL)
paste0(..., collapse = NULL)参数... 一个或多个R对象，要转换为字符向量。
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2023-05-23 11:04:37
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自定义函数之位置参数
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2023-05-27 23:05:15
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使用平滑曲线，沿着X轴从左向右的顺序依次连接，可以使用spline样条函数线。
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2023-05-30 11:04:44
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plot函数是R语言中画图使用最多的函数，参数也非常之多，简单的总结，之后应该会在学习的过程中不断完善。plot(x, y = NULL ,type = "p", xlim = NULL, ylim = NULL,log = "", main = NULL, sub = NULL, xlab = NULL, ylab = NULL,ann = par("ann"), axes = TRU
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2023-05-23 13:09:31
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tidy（整洁），Tidyr包是由Hadely Wickham创建，这个包提高了整理原始数据的效率，tidyr包的4个常用的函数及其用途如下：gather()——它把多列放在一起，然后转化为key:value对。这个函数会把宽格式的数据转化为长格式。它是reshape包中melt函数的一个替代spread()——它的功能和gather相反，把key:value对转化成不同的列separate()—
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2023-08-19 18:03:13
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