一个比原版更好用的RNA velocity分析工具：velocyto GitHub：https://github.com/velocyto-team/velocyto.R readthedoc：http://velocyto.org/velocyto.py/index.html 历史分析参考： pr
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2021-01-12 16:57:00
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单细胞测序 RNA velocity | RNA速率 RNA velocity：the time derivative of the gene expression state—can be directly estimated by distinguishing between unspliced
原创
2023-10-31 14:49:59
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Antisense RNA与靶核酸(如mRNA或有义DNA)链互补的RNA分子，可抑制靶核酸的功能。反义RNA，根据反义RNA的作用机制可将其分
原创
2023-11-07 12:21:53
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RNA editing一、reditools软件下载首先需要安装reditools软件，这是2.0版本的下载链接wget -c https://github.com/tflati/reditools2.0/archive/master.zip解压unzip master.zip然后软件就安装好啦但是我准备安装1.0.3版本，代码如下：wget -c http://sourceforge.net/p
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2024-03-08 08:15:52
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欢迎关注”生信修炼手册”!RNA editing, 即RNA编辑，指的是转录后的RNA发生的碱基插入，缺失，
原创
2022-06-21 09:09:32
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小干扰RNA（Small interfering RNA；siRNA）有时称为短干扰RNA（short interfering RNA）或沉默RNA（silencing RNA），是一个染色...
原创
2023-11-07 12:21:45
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核心概念 Splice Site (SS) 位于外显子与内含子的交界处，能够被剪接体（spliceosome）识别的内含子序列。 分为5'ss (donor site)、3'ss (acceptor site)。 5'ss中的5’指的是5'-intron 3'ss中的3’指的是3'-intron B ...
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2021-08-04 11:10:00
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下行速率一般是从网络上的主机获取数据的速率，各种网络软件的运用，都必须从网路上获取数据。比如浏览器打开百度的网站，就要从百度的服务器上下载数据，这就会产生一定的数据下载速率。 上传速率（度）是指单位时间内，网络数据的上行流量。网络数据传输分为发送数据和接受数据两部分。上传就是向外部发送数据。下载为从
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2019-04-24 23:35:00
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RNA测序（RNA Sequencing，简称RNA-Seq，也被称为全转录物组鸟枪法测序Whole Transcriptome Shotgun Sequencing，简称WTSS），是基于二代测序技术研究转录组学的方法，可以快速获取给定时刻的一个基因组中RNA的种类和数量。RNA-Seq有助于查看基因的不同转录本、转录后修饰、基因融合、突变/SNP和基因表达随时间的变化，或在不同组中基因表达
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2023-07-31 17:27:29
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欢迎关注”生信修炼手册”!研究环状RNA除了高通量测序外，还有一种常见的手段就是环状RNA芯片，两种产品之间
原创
2022-06-21 06:04:14
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一、RMIRMI（Remote Method Invocation，远程方法调用）。通过RMI技术，某一个本地的JVM可以调用存在于另外一个JVM中的对象方法，就好像它仅仅是在调用本地JVM中某个对象方法一样。二、RMI的适用场景RMI是基于JAVA语言的，也就是说在RMI技术框架的描述中，只有Server端使用的是JAVA语言并且Client端也是用的JAVA语言，才能使用RMI技术RMI适用于
欢迎关注”生信修炼手册”!circRNA即环状RNA，顾名思义这种RNA是一个闭合的环状结构，经过反向剪切b
原创
2022-06-21 06:02:17
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1、引脚定义上面的方向是对emmc颗粒而言的DS在hs400和hs400es模式下使用。其中emmc5.1才支持hs400es，对主机的数据读来说，采用的是DS的双沿，主机crc读和cmd读（只有hs400es支持）只是上升沿采样常规的VCC是3.3V电压，VCCQ是1.8V电压在上电或者复位后，只有DATA0用于数据传送，其他数据需要配置能用2、速率及带宽及电压描述每种模式的linux配置详见《
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2024-02-19 10:17:58
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最近有朋友和我交流纳米孔16S测序数据的分析，发现真的没有从头完成过一次这方面的数据分析，然后发现这方面的资料也比较少，于是学习一下，和大家分享。坦白说，牛津纳米孔测序技术在16S多样性研究方面还是有些不足的，只能说勉强够用，主要应用场景是在一些现场快速检测方面，主要是病原菌这种。但是，相信随着测序准确度的提高和分析软件的改进，相信它的应用会越来越多。感谢互联网的便利和分享精神，今天的我们可以方便
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2023-09-07 23:13:35
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质量测序基于 fastqc 快速地对测序数据进行质量评估,得到两个文件，一个是html的网页文件，一个是zip压缩文件。html文件就是我们质量评估的报表。序列测序质量统计此图中的横轴是测序序列第1 个碱基到第151个碱基，纵轴是质量得分，即20表示0.01的错误率，30表示0.001的错误率。图中红线表示中值，图中蓝色的细线是各个位置的平均值的连线1.为什么一个样本会有两张图? ----答：测序
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2023-12-02 06:06:36
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1.测序数据下载SRR2176358
SRR2176359
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SRR2176372
SRR2176373
SRR2176374
SRR21
原创
2023-05-08 16:01:36
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在提取生物总RNA的过程中，被提取的RNA主要包含三类——rRNA，tRNA，和mRNA。 无论是在真核生物细胞中还是在原核生物细胞中，8
原创
2023-10-09 17:41:43
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欢迎关注”生信修炼手册”!在最初的环状RNA研究中，认为环状RNA都是由exon通过反向剪切构成的,称之为e
原创
2022-06-21 06:00:56
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并希望把网速提高上去，以便更舒畅的上网。网速上去了，上网的心情都会好一些，工作的效率都会高一点。所以，无论是企业还是家庭个人，网速永远都不能忽视。 今天，本人收集了几个提高局域网网速的技巧方法，与大家共享。 1、将网卡调至全速  
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2024-04-13 12:40:24
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欢迎关注”生信修炼手册”!在利用RNA_seq数据预测环状RNA时，大多数情况下只能够得到环状RNA的基因组
原创
2022-06-21 06:04:03
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