正如我们所提到的那样,并行计算只有在每次迭代都是独立的情况下才可行,这样最终结果才不会依赖运行顺序。然而,并非所有任务都像这样理想。因此,并行计算可能会受到影响。那么怎样才能使算法快速运行,并且可以轻松地与 R 实现交互呢?答案是通过 Rcpp 用 C++ 语言编写算法(http://www.rcp
原创 2019-02-11 14:38:00
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参考图书:《Rcpp:R 与 C++ 的无缝整合》Rcpp 的主要目的在于使得开发 R 语言的 C++ 相关拓展变得更加容易、更少出错。我们首先从斐波那契数列问题开始探索 Rcpp。该问题是一个递归问题,首两项为 0 和 1,而后面每一项为前两项之和。C++ 实现,直接根据定义进行实现:int fibonacci(const int x) { if (x == 0) return(0);
转载 2023-09-27 21:41:05
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安装BiocManager::install("org.Hs.eg.db")时出现的报错。 解决方案:重新安装Rcpp即可: install.packages("Rcpp") BiocManager::install("org.Hs.eg.db") ...
转载 2021-07-24 17:36:00
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当我们使用R进行论文模拟时,通常会涉及到许多的循环。一般比较容易的提速方法是将我们的for循环改写为apply族的方法进行向量化运算,但这个方法速度提升的有限,在真实模拟时,如果要与其他算法进行速度的比较,除非自己的算法非常出色,否则还是很难与一些成熟包中的算法相庭抗礼。这时想要再次进行提速,有多种方法,常见的几种是将代码改写为Fortran代码,改写为C++代码抑或改写为C代码。由于Rcpp包的
转载 2023-10-11 23:16:47
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Select在Socket编程中还是比较重要的,可是对于初学Socket的人来说都不太爱用Select写程序,他们只是习惯写诸如 connect、accept、recv或recvfrom这样的阻塞程序(所谓阻塞方式block,顾名思义,就是进程或是线程执行到这些函数时必须等  待某个事件的发生,如果事件没有发生,进程或线程就被阻塞,函数不能立即返回)。 可是使用Select就可以完
Rcpp only works with the GNU toolchain. http://www.murdoch-sutherland.com/Rtools/index.html 注意:只能用Rtools的gcc编译 环境配置 path: 我的电脑:%SystemRoot%\system32;%SystemRoot%;%SystemRoot%\System32\Wbem;D:\lua
原创 2012-11-12 13:42:24
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提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档 文章目录前言一、创建项目二、部分文件准备1.解决NAMESPACE文件空白的问题2.Description文档检查修改3.生成函数的Help文档三、创建总结 前言提示:这里可以添加本文要记录的大概内容:Rcpp包是一个打通R语言和C++语言的通信组件包,可以把C++代码与R程序连接在一起,且不用关心C++中那套繁琐的编译、链接、接口
今年六月,Springer useR系列新出了一本,Seamless R and C++ Integration with Rcpp, 这可能是唯一的一本Rcpp完整教程。Rcpp几乎可以认为是R语言的一个里程碑,而其最大的特点就是那本书标题里的那个词“Seamless”。R本身 自带了C语言接口,但并不是那么好用,尤其是涉及内存管理的时候,而Rcpp成功的解决了这个问题,实现了“无缝链接”。
指数加权波动率是一种波动率的度量,它使最近的观察结果有更高权重。我们将使用以下公式计算指数加权波动率:
原创 2021-05-19 22:49:08
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指数加权波动率是一种波动率的度量,它使最近的观察结果有更高权重。我们将使用以下公式计算指数加权波动率:
原创 2021-05-12 14:11:15
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Rcpp扩展包可以很容易地将C++代码连接到R程序中,并且支持在C++中使用类似于R的数据类型。Rcpp包提供了C++类,这些类极大地促进了使用R提供的.Call接口在R包中连接C或C++代码。Rcpp可以很容易地把C++代码与R程序连接在一起,可以从R中直接调用C++代码而不需要用户关心那些繁琐的编译、链接、接口问题。可以在R数据类型和C++数据类型之间容易地转换。Rcpp支持把C++代码写在R
R语言中使用RCPP并行计算指数加权波动率
原创 2022-11-10 23:58:58
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本文是我看《Rcpp:R与C的无缝整合》一书的一些收获,有不准确的地方,请指出也请见谅!一、为什么使用C++代码?在运行速度方面,C++代码的运行运行速度比R快的多。所以想在R中调用C++函数,如何调用?桥梁就是RcppRcpp是一个R包。二、如何在R中调用/使用C++函数,以达到提高运行速度的目标呢?一种编译、链接和载入的方法是使用inline包中的cxxfunction函数:首先,我们需要有
在最近的一篇文章中,我描述了一个Metropolis-in-Gibbs采样器,用于估计贝叶斯逻辑回归模型的参数。这篇文章就此问题进行了研究,以展示Rcpp如何帮助克服这一瓶颈。 TLDR:只需用C ++编写log-posterior而不是矢量化R函数,我们就可以大大减少运行时间。我模拟了与上一篇文章类似的...
原创 2021-05-12 14:15:20
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在最近的一篇文章中,我描述了一个Metropolis-in-Gibbs采样器,用于估计贝叶斯逻辑回归模型的参数。这篇文章就此问题进行了研究,以展示Rcpp如何帮助克服这一瓶颈。 TLDR:只需用C ++编写log-posterior而不是矢量化R函数,我们就可以大大减少运行时间。我模拟了与上一篇文章类似的...
原创 2021-05-12 14:15:18
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在最近的一篇文章中,我描述了一个Metropolis-in-Gibbs采样器,用于估计贝叶斯逻辑回归模型的参数。 这篇文章就此问题进行了研究,以展示Rcpp如何帮助克服这一瓶颈。  TLDR:只需用C ++编写log-posterior而不是矢量化R函数,我们就可以大大减少运行时间。  我模拟了与上一篇文章类似的模型中的数据:  &nbs
原创 2022-11-10 23:00:43
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最近因为项目要用到,所以在想办法把R语言用到C++中. 网上查了看到有一个Rcpp的工具.所以在这里总结一下.现在能想到的几种在C++中调用R语言的方法如下:1. 使用RcppR高级编程技巧及Rcpp的介绍Rcpp的前世今生Rcpp快速入门Rcpp简明入门Exposing C++ functions and classes with Rcpp modulesRcpp: Seamless R and
Linux Linux:开源的红帽操作系统 在计算机领域,操作系统是软件系统中最为重要的组成部分之一。而Linux操作系统以其开源的特点,以及其灵活性和安全性而闻名于世。在众多Linux发行版本中,红帽(Red Hat)无疑是最为知名和受欢迎的一个。本文将以“Linux Linux”为关键词,探讨红帽操作系统在Linux领域中的重要性和影响。 首先,我们需要了解什么是Linux操作系统。Lin
原创 2024-02-02 14:05:31
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Linux操作系统的介绍和发展历史
原创 2023-04-30 21:04:56
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Linux中,一切皆文件(网络设备除外)。硬件设备也“是”文件,通过文件来使用设备。目录(文件夹)也是一种文件。
原创 2022-11-18 00:57:13
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