系统（层次）聚类解决了K-均值聚类的一个最大的问题：聚类的个数需要自己给定。一、系统聚类的定义系统聚类的合并算法通过计算两类数据点间的距离，对最为接近的两类数据点进行组合，并反复迭代这一过程，直到将所有数据 点合成一类，并生成聚类谱系图。我们可以根据这个图来确定聚类的个数。二、具体步骤介绍：系统（层次）聚类的算法流程：将每个对象看作一类，计算两两之间的最小距离；将距离最小的两个类合并成一个新类；重
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2023-11-28 00:49:31
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凝聚层次算法：首先假定每个样本都是一个独立的聚类，如果统计出来的聚类数大于期望的聚类数，则从每个样本出发寻找离自己最近的另一个样本，
与之聚集，形成更大的聚类，同时令总聚类数减少，不断重复以上过程，直到统计出来的聚类数达到期望值为止。
凝聚层次算法的特点：
1.聚类数k必须事先已知。借助某些评
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2023-05-24 17:30:16
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层次聚类分析作者：小明
本文主要针对层次聚类算法做一个详解，并使用代码进行复述，可供大家理解一下什么是层次聚类分析算法哈！算法定义：层次聚类算法的定义为：通过某种可计算方法的相似度测度计算节点（分析对象）之间的相似性，并按相似度由高到低排序，逐步重新连接个节点，得到一个单聚类结果。简单描述就相当于：三角形的重点、中点、及内心这种点也属于不断地聚类结果。思考：当一个无限大的多散点聚类之后，结果是什么
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2024-03-29 10:33:19
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BAFIMINARMTOBA0662877255412996FI6620295468268400MI8772950754564138NA2554687540219869RM4122685642190669TO9964001388696690这是一个距离矩阵。不管是scipy还是fastcluster，都有一个计算距离矩阵的步骤(也可以不用)。距离矩阵是冗余的，因为它是对称的。scipy里面的文档好
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2024-03-04 02:41:09
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前面博文介绍了两种常用基于划分的聚类算法K-means聚类、K-Medoids聚类，还有有序样品聚类。本篇博文介绍基于层次的聚类算法，层次聚类主要有两种类型：合并的层次聚类和分裂的层次聚类。合并的层次聚类是一种自底向上的聚类算法，从最底层（即每个数据点为一类）开始，每一次合并最相似的类，直到全部数据点都合并到一类时或者达到某个终止条件时停止，大部分层次聚类都是采用这种方法处理。分裂的层次聚类是一种
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2023-11-15 17:08:35
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文章目录基本原理绘图层次定义距离 基本原理和Birch聚类相似，层次聚类也是一种依赖树结构实现的聚类方法，其核心概念是相似度。根据相似度，可以将所有样本组织起来，从而构建一棵层次聚类树。其中Birch算法的核心，叫做聚类特征树(Clustering Feature Tree)，简称CF树。CF树由CF构成，每个CF都是三元组，表示为(N, LS, SS)，其中N表示点数；LS表示点的向量和；SS
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2023-12-17 09:16:34
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# Python层次聚类树状图实现指南
作为一名经验丰富的开发者，我很高兴能够教会你如何实现Python层次聚类树状图。下面我将为你提供一个整体的流程，并详细说明每个步骤需要做什么，以及相应的代码实现。
## 整体流程
下面的表格展示了实现Python层次聚类树状图的整体流程。我们将按照这些步骤逐步进行实现。
| 步骤 | 描述 |
| --- | --- |
| 步骤一 | 导入必要的库
原创
2023-07-25 21:00:00
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本篇想和大家介绍下层次聚类，先通过一个简单的例子介绍它的基本理论，然后再用一个实战案例Python代码实现聚类效果。首先要说，聚类属于机器学习的无监督学习，而且也分很多种方法，比如大家熟知的有K-means。层次聚类也是聚类中的一种，也很常用。下面我先简单回顾一下K-means的基本原理，然后慢慢引出层次聚类的定义和分层步骤，这样更有助于大家理解。层次聚类和K-means有什么不同？K-means
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2023-10-09 10:15:53
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谱聚类(SpectalClustering)算法是聚类算法的一种，比起传统的K-Means聚类算法，谱聚类算法的效果更优秀，其计算量也小很多，除了谱聚类和K-Means聚类算法，另外还有密度聚类和层次聚类算法，本节主要讨论谱聚类算法，预备知识：最好有K-Means聚类算法的基础。谱聚类是一种不断发展的聚类算法，在很多情况下都优于传统的聚类算法，它将每个数据点视为一个图节点，从而将聚类问题转化为图分
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2024-02-05 12:08:04
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凝聚聚类算法简述凝聚聚类（agglomerative clustering）指的是许多基于相同原则构建的聚类算法，这一原则是：算法首先声明每个点是自己的簇，然后合并两个最相似的簇，直到满足某种停止准则为止。scikit-learn 中实现的停止准则是簇的个数，因此相似的簇被合并，直到仅剩下指定个数的簇。还有一些链接（linkage）准则，规定如何度量“最相似的簇”。这种度量总是定义在两
有许多聚类算法可供选择，对于所有情况，没有单一的最佳聚类算法。相反，最好探索一系列聚类算法以及每种算法的不同配置。在本教程中，你将发现如何在 Python 中安装和使用顶级聚类算法。完成本教程后，你将知道：聚类是在输入数据的特征空间中查找自然组的无监督问题，对于所有数据集，有许多不同的聚类算法和单一的最佳方法，在 scikit-learn 机器学习库的 Python 中如何实现、适配和使用顶级聚类
引言最近在读西瓜书，查阅了多方资料，恶补了数值代数、统计概率和线代，总算是勉强看懂了西瓜书中的公式推导。但是知道了公式以后还是要学会应用的，几经摸索发现python下的sklearn包把机器学习中经典的算法都封装好了，因此，打算写几篇博客记录一下sklearn包下的常用学习算法的使用，防止自己以后忘了，嘿嘿。1.聚类西瓜书中197页对“聚类”做了详细的解释，以下为摘录：在无监督学习中，训练样本的标
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2023-08-24 13:39:28
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Hierarchical Clustering，一如其字面意思，是层次化的聚类，得出来的是树形结构（计算机科学的树是一棵根在最上的树，:-D）。
Hierarchical vs Flat Clustering平坦型聚类算法的一个共同点，也是缺陷，就是类别数目难以确定。层次聚类从某种意义上说解决了这个问题，不是它能给出类别数目，而是它在 Clustering 的时候不需要知道类别数。其得到的
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2024-06-24 01:06:48
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文章目录相似性测度1.距离测度1.1 欧式距离1.2 街坊距离（Manhattan距离）1.3切式(Chebyshev)距离1.4明氏(Minkowski)距离1.5 马氏(Mahalanobis)距离1.6 Camberra距离2.相似测度2.1角度相似系数（夹角余弦）2.2指数相似系数3.类间距离测度方法3.1最短距离法3.2 最长距离法3.3 中间距离法3.4 重心法3.5平均距离法聚类准
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2023-06-21 21:50:44
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层次聚类算法的主要优点在于我们无需事先知道最终所需集群数量。很遗憾的是，网上并没有很详细的教程讲述如何使用 SciPy 的层次聚类包进行层次聚类。本教程将帮助你学习如何使用 SciPy 的层次聚类模块。命名规则在我们开始之前，我们先设定一下命名规则来帮助理解本篇教程：X - 实验样本(n 乘 m 的数组)n - 样本数量m - 样本特征数量Z - 集群关系数组(包含层次聚类信息)k - 集群数量导
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2024-02-29 15:13:06
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前言K-means 聚类，介绍了 K-means 算法以及一些优化改进的算法，通过此了解聚类分析，接下来我们进一步的介绍聚类分析的其他方法。本篇代码可见：Github一、层次聚类\quad\quad 层次聚类技术是第二类重要的聚类方法。层次聚类方法对给定的数据集进行层次的分解，直到满足某种条件为止，传统的层次聚类算法主要分为两大类算法：凝聚的层次聚类：AGNES算法(AGglomerative N
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2023-08-15 14:48:49
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前言今天试了下用python实现层级聚类，感觉还是有不少问题。转专业的一只小菜鸡，初学代码，写的很简陋，希望各位大牛能指出不足之处。代码输入是一个长度可选的列表。这里用random随机生成，10个数据，并把数据用字母'a'、'b'等依次标记。算法实现中用树结构存储数据。树的每一个节点都是一个数据集，它的左右子树代表该节点包含的两个数据集。计算所有数据相互的距离（x1.value - x2.valu
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2023-09-30 21:58:26
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最近使用MDTraj对分子动力学轨迹进行聚类分析，接触到了python中的聚类实现，故将CSDN上一篇关于聚类的博客搬运至此，以作备忘：scipy cluster库简介scipy.cluster是scipy下的一个做聚类的package, 共包含了两类聚类方法:矢量量化(scipy.cluster.vq:支持vector quantization 和 k-means 聚类方法层次聚类(scipy.
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2023-10-16 06:15:08
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层次聚类和DBSCAN 前面说到K-means聚类算法，K-Means聚类是一种分散性聚类算法，本节主要是基于数据结构的聚类算法——层次聚类和基于密度的聚类算法——DBSCAN两种算法。1.层次聚类 下面这样的结构应该比较常见，这就是一种层次聚类的树结构，层次聚类是通过计算不同类别点的相似度创建一颗有层次的树结构，在这颗树中，树的底层是原始数据点，顶层是一个聚类的根节点。 创建这样一棵树的方
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2023-08-09 13:08:52
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层次聚类步骤：假设有N个待聚类的样本，对于层次聚类来说，基本步骤就是：1、(初始化)把每个样本归为一类，计算每两个类之间的距离，也就是样本与样本之间的相似度；2、按一定规则选取符合距离要求的类别，完成类间合并；3、重新计算新生成的这个类与各个旧类之间的相似度；4、重复2和3直到所有样本点都归为一类，结束。随机森林步骤：从原始训练集中使用Bootstraping方法随机有放回采样选出m个样本，共进行
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2023-09-22 07:53:31
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