NCBI(National Center for Biotechnology Information,美国国家生物技术信息中心)除了维护GenBank核酸序列数据库外,还提供数据分析和检索资源。NCBI资源包括Entrez、Entrez编程组件、MyNCBI、PubMed、PudMed Central、PubReader、Gene、the NCBI Taxonomy Browser、B
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2024-04-16 22:25:33
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简介SRA数据库是美国国立卫生研究院(NIH)的高通量测序数据的主要归档,是国际核苷酸序列数据库协作(INSDC)的一部分,其中包括NCBI序列读取存档(SRA),欧洲生物信息学研究所(EBI)和DNA数据库 日本(DDBJ)。 提交给三个组织中的任何一个的数据都是共享的。SRA数据库数据来自高通量测序平台(Roche 454 GSSystem®,Illumina GenomeAnal
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2023-07-29 20:33:32
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文章目录介绍查询某个物种的全部核酸序列和蛋白序列查看某个物种的其他信息(蛋白结构,基因,测序数据,相关文献等)Taxonomy 的相关数据下载**gi_taxid 标识的数据****taxcat 标识的数据**以尼安德特人(taxid:63221)为例介绍Taxonomy : NCBI公共序列数据库中所有生物的策划分类和命名法。目前
原创
2022-03-08 14:13:42
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O.Sativa选用MSU或者RAPDB这两个数据库的genome和gtf文件,介绍一下MSU的ID,RAPDB的同理。The Rice Annotation Project (RAP)(https://rapdb.dna.affrc.go.jp/index.html)和Rice Genome Annotation Project (RGAP7,MSU)(http://rice.plantbiol
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2024-08-12 11:03:50
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NCBI网站是最常用的生物信息数据库之一,集成了pubmed,genebank等子
原创
2022-06-21 09:23:23
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本篇文章把上传数据(扩增子测序)的步骤尽可能详细的整理出来,希望能对各位科研工作者有所帮助。其它类型数据上传讲解将依次在后续推文中奉上,大家持续关注哦!1.注册及登录账号1)注册一个NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)网页:按照提示填写账号、密码、邮箱等信息。2)登录账号,点击左上角的NCBI大图标回到NCBI的主页,然后点击图中Submit按钮进入提交数据页面。
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2024-03-27 15:09:15
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SQL语言是 非过程化 的语言,易学习在关系DB中,任何二元关系模式的最高范式必定是 BC
原创
2023-02-13 20:19:45
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# 如何使用Python实现数据库数据集
在如今的数据驱动时代,管理和操作数据库已经成为开发者的重要任务。对于刚入行的小白来说,如何使用Python与数据库进行交互是一个非常重要的技能。本文将为你详细介绍如何实现“Python数据库数据集”。
## 流程概览
为了让你了解整个过程,我们可以把它分为以下几个步骤:
| 步骤 | 描述 |
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# MySQL 数据库与数据集
MySQL是一种广泛使用的关系型数据库管理系统,因其高效、可靠以及开放源代码的特性而被众多企业和开发者所青睐。本文将探讨MySQL数据库中的数据集的管理,并提供相应的代码示例。
## MySQL 数据库简介
MySQL以表格的形式存储数据,数据集则是由多张相关表格构成的。一个数据库可以包含多个数据集,通常用于组织和分类数据,以便进行高效的查询和操作。
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速来围观!——三种NCBI常见数据库在微生物测序分析中,常常需要对未知的核酸或蛋白序列进行物种,功能或类别注释。注释方法种类较多,其中最常用的是与一些标准数据库进行相似性搜索,也就是序列比对。因此,数据库的优劣对注释结果至关重要。本期小编为大家带来的是NCBI上的三个重要的数据库—NR/NT,Taxonomy和RefSeq。NR/NT 数据库NR(Non-Redundant Prote
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2023-09-26 11:00:30
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最近看了nosql相关文档,概括的了解到其几大类别,他的出现主要是在处理大量数据,降低数据延迟。与传统具有关系模型的关系型数据库相比,nosql弃用该数据模型,有面向聚合的聚合数据模型以及聚合无知的。 其中聚合是指把一组相互关联的对象视为一个整体单元来操作,包括有键值数据库、文档数据库、列族数据库,通常通过原子操作更新聚合的指, 在集群中操作该类型的数据库,可以将必要数据一起处理,且放入同一个
鸢尾花卉数据集(Iris data)。此样本数据是机器学习和统计分析最经典的数据集,包含山鸢尾、变色鸢尾和维吉尼亚鸢尾各自的花萼和花瓣的长度和宽度。总共有150个数据集,每类有50个样本。用Python加载样本数据集时,可以使用Scikit Learn的数据集函数,使用方式如下:from sklearn import datasets
iris = datasets.load_iris()
pri
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2023-10-31 21:03:12
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服务器端:(oracle服务器端字符集)数据库字符集在创建数据库时指定,在创建后通常不能更改。在创建数据库时,可以指定字符集(CHARACTER SET)和国家字符集(NATIONAL CHARACTER SET)。 1. 字符集: (1)用来存储CHAR, VARCHAR2, CLOB, LONG等类型数据 (2)用来标
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2024-07-29 18:32:56
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# Go语言与数据库的奇妙结合
Go语言,或称为Golang,是一种编译型、并发性极强的编程语言,因其高效性和简洁性受到开发者的广泛青睐。在这篇文章中,我们将探讨Go语言如何与数据库进行交互,并提供一个代码示例来帮助您更好地理解这一过程。
## 数据库连接
在Go语言中,连接数据库往往使用`database/sql`包。首先,我们需要安装数据库驱动,比如对于MySQL,可以使用`go-sql
数据库管理和开发工具更多,不知道选哪个下载比较好,本篇文章介绍一个拥有强大功能的工具DBeaver,跟小编一起去看看吧。虽然有很多 SQL Client 可以操作数据库,但若仔细观察会发现能满足跨平台、支持众多主流数据库系统、以图形化接口操作数据、提供多种汇入输出方式且以独立应用程序运作的选择还真没几个,所以很多程序员都倾向于选择Navicat。今天就和大家分享另一款基于Java 开发,免费开源的
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2023-12-01 11:50:50
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数据库
原创
2022-09-03 00:18:58
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汉字比较 是字母的比较bai > ai 因为 b > aselect iif(N’百’ > N’爱’,1,0) => 1select iif(N’才’ > N’爱’,1,0). => 0
原创
2023-02-13 20:19:30
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1、查看数据库字符集数据库服务器字符集select * from nls_database_parameters,其来源于props$,是表示数据库的字符集。 客户端字符集环境select * from nls_instance_parameters,其来源于v$parameter, 表示客户端的字符集的设置,可能是参数文件,环境变量或者是注册表 会话字符集环境 select *
原创
2015-02-28 09:28:12
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MongoDB数据库复制集一、复制集概述;二、复制集原理;三、案例:搭建Mongodb实现应用复制集;一、复制集概述:组成:Mongodb复制集(副本集replicaset)由一组Mongod实例(进程)组成,包含一个Primary节点和多个Secondary节点,MongodbDriver(客户端)的所有数据都写入Primary,Secondary通过oplog来同步Primary的数据,保证主
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2019-08-26 21:15:44
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数据库集簇的逻辑结构数据库集簇(database cluster)是指由单个PostgreSQL服务器实例管理的数据库集合。(解读:数据库集
原创
2022-07-26 16:53:13
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