上次我们分享了：全基因组DNA甲基化实验怎么做：手把手教你做全基因组DNA甲基化测序分析，深受同学们的欢迎。本期，易基因小编给您讲讲简化基因组DNA甲基化实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程等三方面详细介绍。 一、简化基因组DNA甲基化测序（RRBS）技术原理简化基因组甲基化测序 (Reduced Representation Bisulfite S
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2023-08-02 22:09:44
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1、在salt-master端开启# vim /etc/salt/masternodegroups: zxgroup: 'L@admin-master-zxtest,admin-slave-zxtest,api-master-zxtest,api-slave-zxtest,lsf-master-zxtest,lsf-slave-zxtest,service-master-z
原创
2017-09-24 11:45:08
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安装salt-minion新增minion：
【svr205-2】
[root@svr205-2 ~]# yum install salt-minion -y
[root@svr205-2 ~]# vim /etc/salt/minion
master: 10.0.200.21
id: svr205
原创
2015-04-21 10:41:03
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抛错信息如下：TheSaltMasterhasrejectedthisminion'spublickey!Torepairthisissue,deletethepublickeyforthisminionontheSaltMasterandrestartthisminion.处理方法：1在saltmaster上所有节点删除对应minion的minion_id值，/etc/salt/pki/
原创
2019-12-17 10:33:58
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上篇文章发了salt-minion的监控代码 http://6252961.blog.51cto.com/6242961/1710977 ，在监控跑完列出所有的有问题的客户端列表之后，如果手动一个个去修复，很费事，服务器你太多，所以写了这个自动修复的代码，解放双手代码逻辑： &nb
原创
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2015-11-11 19:19:31
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saltstack: windows server 2008 x64 r2 minion 部署
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2013-04-19 09:44:00
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本文出自 “小城运维” 博客，请务必保留此出处http://lixcto.blog.51cto.com/4834175/1430638
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2016-07-14 15:46:50
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K8S（Kubernetes）是一个开源的容器编排平台，用于自动化部署、扩展和管理容器化的应用程序。在K8S中，节点分为主节点（master）和工作节点（minion）。本文将重点介绍如何实现k8s minion 的过程，以便帮助初学者快速上手。
K8S Minion 实现流程：
| 步骤 | 操作
单细胞RNA测序(single-cell RNA-seq，scRNA-seq)数据是非常有特点的数据，具有很高的稀疏性(high sparsity)，具体表现为0非常多(zero inflation)。对于数据的分布给出合理的假设是非常关键的工作，是downstream analysis的基础。显然对于scRNA-seq的reads count数据，最常用的正态分布是不合理的。首先正态分布描述的是
遇到的问题如下：root@Saltstack:/etc/salt# salt-key -LAccepted Keys:Unaccepted Keys:Rejected Keys:root@Saltstack:/etc/salt# salt-master -l debug[DEBUG ] Reading configuration from /etc/salt/master[
原创
2015-04-03 14:35:21
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saltstack因为服务器配置的限制，肯定会出现瓶颈，所以就有了salt-proxy。下面简单介绍一下：1、proxy直接从master复制一模一样的文件，然后再传送到minion上2、Syndic：同步比自己高一级的master文件yum -y install salt-mastervim /etc/salt/matser修改：syndic-master:高级别master的ip地址order
原创
2017-06-19 12:03:52
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很多人会在saltstack和ansible之间纠结一个问题，，到底是saltstack好，还是ansible好，首先，我们先要意识到他们之间的优缺点，saltstack它是基于zeromq消息系统，能够实现高并发（理论上，一台salt-master可并发一千台minion，在短时内可执行完毕），而ansible是基于ssh，每次请求都需要先建立ssh连接，所以效率低下，但是它不需要安装客户端，而
原创
2019-09-10 15:58:29
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客户端操作系统：windows2008R2下载相应的saltstack_minion版本：Salt-Minion-3000-Py2-AMD64-Setup官方链接：https://repo.saltstack.com/#windows在管理员模式下安装，出现下面的信息时，masterIPorHostaname输入saltstackmaster服务器IP，下面的minionname可根据自己的hos
原创
2020-03-12 16:13:18
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BWA–MEM 算法执行局部比对和剪接性。可能会出现 query 序列的多个不同的部位出现各自的最优匹配，导致 reads 有多个最佳匹配位点。
原创
2021-06-09 23:24:16
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Frederick Sanger 是一位1918年出生于美国的生物化学家，曾经两度获得诺贝尔化学奖 。上世纪70年代末，他提出快速测定脱氧核糖核酸（DNA）序列的技术“双脱氧终止法”，也被称作“Sanger法”。早在2001年完成的人类基因组框图，采用的就是该方法。而且因准确率高，直到今天还在广泛使用，也被称为基因检测的金标准。下面我们来看看Sanger法是怎样测得基因序列的。Sanger ...
原创
2022-03-08 14:42:44
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目录0. 基础环境1. 质控trimmomaticfastqc2. 比对 & 比对后处理比对：bwa1）编译安装2）使用方法比对后：samtools/picard/gatk3. 变异识别（SNP/InDel）GATK4最佳实践_1：碱基质量分数校正（BQSR）GATK4最佳实践_2：Mutect2检测体细胞突变1）GATK最佳实践3_VQSR或hard-filtering4. 变异注释A
写在前面，听完生信技能树的生信课之后受益匪浅，因此做一些整理和自己的理解，再次感谢生信技能树一、概述 转录组是RNA转录本的集合，包括了在单个细胞或者大量细胞内的编码和非编码RNA。RNA在中心法则中是基因表达的起始，在一定程度上可以指示基因的表达或者某些LncRNA microRNA调控RNA的表达。因此我们通过了解单个细胞或者整体的RNA水平
高通量测序获取的原始数据是一条条reads，再经过检测和拼接形成完整的基因组序列。这千千万万条序列就相当于我们数据分析实验的材料，如果测序质量比较差，那么得出的结果……，嗯，你懂的。今天小编分享给大家一个常用的测序数据质控工具FastQC，它可以评估这些序列的质量并给我们出具一份报告，便于我们对测序结果有一个整体的把控，为后续的数据处理提供依据。接下来我们就一起探索一下如何使用这个软件查看自己测序
写在前面2012年7月，走出学校，人生第一份工作，有幸在，首批首家进驻广州国际生物岛的企业进行工作。当年以实习生起，就负责年华南第一台Ion Torrent PGM测序仪器平台搭建，维护运行。到现在已经继续搭建Miseq、novaseq平台中。这6年一路见证着测序平台的发展。 2012年PGM，2013年proton，布局NIPT产前诊断、肿瘤panl精准医疗。后来life品牌被Thermo收购
