kegg compound 数据库存储了在生命活动中发挥作用的各种小分子，生物大分子和其他类型的化学物质，采用C number 进行标识，比如C00047, 代表L-赖氨酸。除了名称等信息外，还存储了该物质的化学结构和其他相关信息；对于所有compound 的分类详见 Brite 数据库http://www.genome.jp/kegg-bin/get_htext?br08
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2022-06-21 05:21:53
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# Exploring Biological Pathways with Biopython and KEGG Database
Biological pathways are essential for understanding the complex interactions within living organisms. The Kyoto Encyclopedia of Genes
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2024-05-08 07:57:01
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复合糖作为糖类与蛋白质或者脂质结合的产物 ，在生物中分布广泛，具有重要的功能。GLYCAN 数据库收录了实验验证过的复合糖的信息，主要是结构信息。每条记录用G number 标识，比如 G00197。对于复合糖而言，搞清楚其结构只是最基础的研究，我们更加关注其在生命活动中的意义。kegg 将复合糖相关的基因，代谢途径, 疾病等信息关联在一起，通过pathway的形式进行展示。 在pathw
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2022-06-21 05:22:59
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已知KEGG数据库中ko_map.tab文件，K——>ko： 目标文件：map——>K 代码示例： #! /usr/bin/perl -w use strict; my %seq; open IN, "ko_map.tab" or die $!; while(<IN>){ chomp; my ($k
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2022-06-01 10:53:03
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我们经常会使用KEGG数据库来研究基因的功能，而在KEGG 数据库中，直接存储分子功能的就是KEGG Orthology 数据库。KEGG Orthology 简称KO,该数据库中的每一条记录用K number 唯一标识。基于同源基因具有相似功能的假设，把基因的功能进行了扩充。对于某个物种中功能研究的很清楚的基因，在不同的物种间搜寻该基因的同源基因，将这些同源基因定义为一个orthology, 用
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2022-06-21 05:22:14
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KEGG数据库称之为基因组百科全书，是一个包含gene, pathway等多个子数
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2022-06-21 09:24:31
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根据相似性原理，序列相似，功能相似，所有功能注释无非是用比对工具将输入序列比对到数据库序列，再
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2022-09-01 11:36:22
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1、KEGG简介KEGG 数据库于 1995 年由 Kanehisa Laboratories 推出 0.1 版，目前发展为一个综合性数据库，其中最核心的为 KEGG PATHWAY 和 KEGG ORTHOLOGY 数据库。在 KEGG ORTHOLOGY 数据库中，将行使相同功能的基因聚在一起，称为 Ortholog Groups (KO entries)，每个 KO 包含多个基因信息，并在一
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2024-03-05 21:03:50
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文章目录一、介绍二、KEGG的数据库构成三、KEGG PATHWAY 数据库1. 参考通路图 (map)2. 物种特异性通路 (org)3. 直系同源物通路 (ko)4. 酶通路 (ec)5. 反应通路 (reaction)四、KEGG ORTHOLOGY（KO）数据库一、介绍在进行生物学实验或者生物信息的学习中，都会听说KEGG富集分析，
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2022-03-08 14:38:08
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欢迎关注”生信修炼手册”!KEGG称之为京都基因组百科全书，作为一个综合型的数据库，和NCBI类似，它也是有
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2022-09-05 13:37:34
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