# 学习使用R语言在医学研究中的应用
## 简介
R语言因其强大的数据分析和可视化能力,广泛应用于医学统计和生物信息学等领域。本文将指导初学者如何在R语言中使用相关的医学统计包,帮助他们迅速上手。
## 流程概述
以下是实现“R语言医学用什么包”的整个流程:
| 步骤 | 描述 | 所需包 |
| ---- | ---- | ------ |
| 1 | 安装R和RStudio | 无
医学和生信笔记,专注R语言在临床医学中的使用,R语言数据分析和可视化。 文章目录前言2 x 2 两因素析因设计资料的方差分析I x J 两因素析因设计资料的方差分析I x J x K 三因素析因设计资料的方差分析正交设计资料的方差分析 前言这是R语言和医学统计学的第5篇内容。主要是用R语言复现课本中的例子。我使用的课本是孙振球主编的《医学统计学》第4版,封面如下:2 x 2 两因素析因设计资料的方
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2023-10-19 09:38:12
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开篇先感谢 1.个人主页、博客、社区、论坛北大李东风[3]
中科大张伟平[4]
谢益辉(人称谢大大)[5]:统计之都论坛[6]创始人(与之有关的统计之都[7])
统计学资源链接大全[8]:知名 统计系、统计学会、统计组织、统计软件、统计期刊的官网(该老师的主页[9])
斯坦福大学统计系:Trevor Hastie[10]、Jerome H. Friedman[11]、Rob Tibshi
文章目录前言球对称检验使用课本**表12-3**的数据使用课本**例12-3**的数据 前言这是R语言和医学统计学的第11篇内容。主要是用R语言复现课本中的例子。我使用的课本是孙振球主编的《医学统计学》第4版,封面如下:球对称检验今天就解决1个问题!如何使用R语言进行球形检验?球形检验是非常重要的内容,在进行重复测量方差分析之前,都应该先进行球形假设检验!R语言作为专为统计而生的语言,球形检验的
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2023-09-05 23:50:13
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# R语言生物医学实用包
生物医学研究是科学领域中一个非常重要且不断发展的分支。R语言作为一种强大的统计分析工具,为生物医学研究提供了许多实用的包。本文将介绍几个常用的R语言生物医学实用包,并提供一些代码示例。
## 1. Bioconductor
Bioconductor是一个专门为生物数据分析设计的R包集合。它提供了许多用于基因表达分析、蛋白质分析和代谢物分析的工具。以下是Biocond
原创
2024-07-15 18:37:06
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前言这是R语言和医学统计学的第2篇内容。主要是用R语言复现课本中的例子。我使用的课本是孙振球主编的《医学统计学》第4版,封面如下:完全随机设计资料的方差分析使用课本例4-2的数据。首先是构造数据,本次数据自己从书上摘录。。trt<-c(rep("group1",30),rep("group2",30),rep("group3",30),rep("group4",30))
weight<
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2023-08-28 13:22:47
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本文首发于公众号:医学和生信笔记,完美观看体验请至公众号查看本文。医学和生信笔记,专注R语言在临床医学中的使用,R语言数据分析和可视化。 文章目录完全随机设计资料的协方差分析使用rstatix进行优雅的协方差分析 今天继续学习使用R语言进行医学统计学分析,今天要学习的内容是协方差分析,还是使用课本中的例子。我使用的课本是孙振球主编的《医学统计学》第4版,封面如下:完全随机设计资料的协方差分析使用课
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2023-08-08 20:02:09
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作者:黄天元,复旦大学博士在读,目前研究涉及文本挖掘、社交网络分析和机器学习等。希望与大家分享学习经验,推广并加深R语言在业界的应
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2023-12-19 10:53:17
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# R语言中的VIF函数:了解和使用
在数据分析中,多重共线性是一个常见的问题,它会影响回归模型的稳定性和解释能力。为了检测多重共线性,我们通常使用方差膨胀因子(Variance Inflation Factor,简称VIF)。在R语言中,VIF函数非常便利,主要由`car`包提供。本文将介绍VIF的基本概念,如何使用`vif`函数以及一些示例代码来帮助你更好地理解这一工具。
## 什么是方差
R包概述R包是什么为什么学习R包R包的结构R包的工作流程R包的创建预先准备包的创建DESCRIPTION的编写数据文件R函数R文档测试R文件项目文档生成参考资料 R包概述R包是什么R包,类似C、Python中库的概念,指包含特定领域的函数、数据、文档等的集合。通过调用包,可以直接使用包中现成的数据、函数等,使开发方便快捷高效。为什么学习R包R的强大在于包含了各种各样的包,使用包非常有利于便捷开发
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2023-09-23 21:15:39
199阅读
系统聚类 系统聚类,即层次聚类法。先计算样本之间的距离,每次将距离最近的点合并到同一个类。然后,再计算类与类之间的距离,将距离最近的类合并为一个大类。最终经过不停的合并,直到合成了一个类。 正如样本之间的距离可以有不同的定义方法一样(欧氏距离、曼哈顿距离、马氏距离等),类与类之间的距离也有各种定义。例如可以定义类与类之间的距离为两类之间最近样本的距离,或者定义为两类之间最远样本的距离,
# 如何使用R语言绘制医学图表
在数据科学和生物统计领域,R语言是一个广泛使用的工具,可以用来分析数据和生成图表。在这篇文章中,我们将一步步学习如何用R语言绘制基础的医学图表。无论是生物统计数据还是临床试验结果,适当的可视化都能有效地传达信息。
## 流程概述
以下是绘制医学图表的基本步骤:
| 步骤 | 描述 |
| --- | --- |
| 1 | **安装和加载必要的R包** |
原创
2024-10-21 04:09:20
181阅读
**医学统计 R语言实现流程:**
```mermaid
flowchart TD
Start --> 数据导入
数据导入 --> 数据清洗
数据清洗 --> 数据分析
数据分析 --> 结果呈现
结果呈现 --> End
```
**1. 数据导入:**
首先,我们需要导入医学统计所需的数据集。可以使用以下代码:
```R
# 读取csv文件
da
原创
2024-06-06 04:58:20
36阅读
如何使用R语言生成医学PDF
## 流程概述
使用R语言生成医学PDF可以分为以下几个步骤:
1. 安装R和相关库:安装R语言以及需要使用的相关库,如knitr、rmarkdown等。
2. 准备数据和代码:准备需要在PDF中展示的数据和R代码。
3. 创建R Markdown文档:使用R Markdown编写文档内容并添加代码块。
4. 编译生成PDF:将R Markdown文档编译为PD
原创
2023-12-30 11:22:26
55阅读
### 如何实现R语言医学插件
#### 1. 简介
在医学领域中,使用R语言进行数据分析和统计已经成为一种常见的实践。为了方便医学专业人员使用R语言进行医学数据的处理和可视化,开发一个R语言医学插件是非常有必要的。本文将介绍如何实现这样一个医学插件,并提供相关代码示例。
#### 2. 整体流程
下表展示了实现R语言医学插件的整体流程和步骤。
| 步骤 | 描述 |
| --- | -
原创
2023-09-17 06:42:33
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标题:中国中老年人抑郁症状轨迹与认知能力下降率之间的关系:一项为期8年的纵向研究目的: 探讨中国中老年人群抑郁症状轨迹与认知能力下降率的关系。方法: 采用中国健康与退休纵向研究(CHARLS)的人群队列数据。该队列随访8年,并于2011年、2013年、2015年和2018年评估抑郁症状和认知表现。采用基于组的轨迹模型(GBTM)来识别抑郁症状的异质性轨迹。采用线性混
本期开始将推送使用R语言进行医学统计学的相关内容
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2023-06-22 10:45:32
749阅读
本文最后会附上小编用R绘制的一些图。在R中,包 (package) 是函数、数据和预编译码等以一种定义完善的格式组成的集合。一般来说,一个包负责解决某个具体问题,比如:graphics包由一些基本绘图函数构成,为R提供基本绘图功能。R中有两类包:标准包 (standard packages) 和贡献包 (contributed packages)。标准包:在R安装过程中事先已经安装好了,不需要再安
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2024-04-18 13:39:31
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本章介绍什么是函数,MySQL支持何种函数,以及如何使用这些函数。函数与其他大多数计算机语言一样,SQL也支持利用函数来处理数据。函数一般是在数据上执行的,它给数据的转换和处理提供了方便。例如在前一章中用来去掉串尾空格的RTrim()就是一个函数的例子。特点函数没有SQL的可移植性强函数的类型:用于处理文本串(如删除或填充值,转换值为大写或小写)的文本函数。用于在数值数据上进行算术操作(如返回绝对
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2023-08-11 17:55:04
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数据挖掘常用的语言有R语言,python,SQL等,其中R语言最受欢迎。(注:SQL Server包含微软研究院开发的两种数据挖掘算法:Microsoft决策树和Microsoft聚集,此外还支持第三方开发的算法。)R语言是由统计学家开发的,一款开源免费的统计绘图语言,可以提供数学统计分析,允许用户开发的包进行扩展,同时可以进行数据可视化,兼容多种格式的输入输出。在CRAN(Comprehensi
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2023-06-30 17:50:33
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