Ensemble IDEnsemble ID 是Ensembl 数据库使用的ID标识符，用于标识不同的分子特征，如基因，转录本，外显子，蛋白。大多数据库都有一套自己的ID命名。ID 主要是为消除歧义，在特征注释或数据库更新时也能保持一致。不像人为命名的分子名字，如基因名字那样可能发生改变。就类似于我们的身份证号, 名字方便于平常的交流使用，ID是独一无二的。ID 格式Ensemble ID 个格式
基因融合指的是两个或者多个基因的部分序列结合到一起形成了一种新的基因。随着高通量测序的发展，我们可以利用二代测序的数据来鉴定出发生在不同疾病当中的融合基因，所以也就出现了很多来寻找融合基因的数据库。今天就来给大家介绍几个融合基因查询的数据库。 TumorFusions(https://www.tumorfusions.org/)提到高通量测序的数据，肯定是绕不开TCGA的数据库。那么庞大的测序量
假设我们想搜具有某种功能的一类基因，比如具有激酶活性的基因，我们应给怎么办呢？gene ontology（http://www.geneontology.org/）,可以大致翻译为基因注释的数据库就可以帮上忙了。个人理解对于本体（ontology）的解释就是最终认识，即对于以前的不明了和不方便的基因的注释来联系起来，最终让生物学家方便的搞科研。下面摘抄了在生物统计学家园网站上的三个帖子
Ensemble（ ensembl.org网站是常用真核生物参考基因组来源之一 ）能够对人类基因自动进行注释，包括人类，小鼠，斑马鱼，猪和大鼠等，也包括来自HAVANA的人工注释信息。Ensembl是一项生物信息学研究计划，旨在开发种能够对真核生物基因组进行自动注释(automatic annotation)并加以维护的软件系统。该计划由英国Sanger研究所Wellcome基
Ensemble 对于学习生物信息学的我们来说应该是如数家珍了，但是我们平时常用到的操作一般是去查基因，下载基因组，这些都是通过网页端来完成：http://uswest.ensembl.org/index.html上面网页展示的就像大家进入某宝商店中的商品展示图，而真正的货物是存放在仓库的。Ensemble 则是将其“货物”是存
原创
2022-03-08 16:04:56
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真核生物基因组中的重复序列及其特点按照真核生物的DNA序列在基因组中的重复程度，大致上可以分为单一序列和重复序列两大类。1.单一序列单一序列（unique sequence ）是复性最慢的部分，一般由单一拷贝基因或仅重复数次的基因组成，也可称为单拷贝序列（single copy sequence ）。原核生物的大多数基因在单倍体中都是单拷贝的。单一序列最重要的功能是编码蛋白质，除极少数蛋
美国国家健康与营养调查（ NHANES, National Health and Nutrition Examination Survey）是一项基于人群的横断面调查，旨在收集有关美国家庭人口健康和营养的信息。 地址为：https://wwwn.cdc.gov/nchs/nhanes/Default.aspx 数据库有5个信息栏：DEMO：人口统计学DIET: 饮食EXAM: 检查 LAB: 实验
数据库技术概述数据（Data）早期计算机系统主要用于科学计算，数据主要指数值型数据现代的计算机系统数据是广义的，包括数字、文字、视频、音频等语义：一个数据可以代表不同的属性数据库（Database，DB）数据库是存放数据的仓库，是大量数据的集合数据库中数据的特点：永久存储、有组织、可共享数据库管理系统（DBMS）数据库管理系统是一个能够科学地组织和存储数据，高效的获取和维护数据的系统软件，是位于用
原创
2021-01-02 16:10:24
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1. 数据库介绍1.1 什么是数据库 顾名思义: 数据库就是存储数据的仓库. 其本质是一个文件系统，数据库按照特定的格式将数据存储到文件中，使用者可以对数据库中的数据进行增加，修改，删除及...
原创
2022-07-04 07:18:37
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数据库技术概述数据（Data）早期计算机系统主要用于科学计算，数据主要指数值型数据现代的计算机系统数据是广义
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2021-06-28 14:34:15
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什么是数据库？(DataBase，简称DB) 数据库是一个可以在一台机器上独立工作的，并且可以给我们提供高效、便捷的方式对数据进行增删改查的一种工具 数据库即存放数据的仓库，只不过这个仓库是在计算机存储设备上，而且数据是按一定的格式存放的，过去人们将数据存放在文件柜里，现在数据量庞大，已经不再适用 ...
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2021-07-30 13:45:00
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数据库介绍 1.1 数据库介绍 1.1.1 什么是数据库？ 简单的说，数据库（因为Database）就是一个存放数据的仓库，这个仓库是按照一定的数据结构（数据结构是指数据的组织形式或数据之间的联系）来组织、存储的，我们可以通过数据库提供的多种方式来管理数据库里的数据。 更简单形象的理解，数据库和我们 ...
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2021-07-23 16:34:00
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数据库是“按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库”。关于数据库的定义有好几种说法，但个人觉得它是一个长期存储在计算机内的、有组织的、有共享的、统一管理的数据集合，满足人们某种需要。
数据库的历史可以追溯到五十年前，那时的数据管理非常简单。通过大量的分类、比较和表格绘制的机器运行数百万穿孔卡片来进
原创
2012-06-01 16:50:55
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什么是数据库？数据库(Database)顾名思义，就是存入数据的仓库。准确的说是按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库。它产生于距今六十多年前，随着信息技术和市场的发展，特别是二十世纪九十年代以后，数据管理不再仅仅是存储和管理数据，而转变成用户所需要的各种数据管理的方式。数据库有很多种类型，从最简单的存储有各种数据的表格到能够进行海量数据存储的大型数据库系统都在各个方面得到了广泛的应用。在信息化
原创
2016-10-31 15:33:34
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数据库技术概述数据（Data）早期计算机系统主要用于科学计算，数据主要指数值型数据现代的计算机系统数据是广义
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2021-06-28 13:32:47
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1. 数据库介绍1.1 什么是数据库顾名思义: 数据库就是存储数据的仓库.其本质是一个文件系统，数据库按照特
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2021-06-18 13:53:00
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数据库介绍1.数据库管理系统我们常说的“数据库”软件，确切的说应该叫：数据库管理系统。 数据库管理系统（DataBase Management System，DBMS）：指一种操作数据库、管理数 据库的大型软件。 作用：用于数据库的建立、使用和维护数据库。2.数据库数据库（database）：就是 存储数据的容器，其本质是一个文件系统，按照特定的格式将数据存储起来。用户可以对数据库中的数据进行增加
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2022-12-27 12:33:57
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MySql与数据库的简单介绍1. 什么是数据库？数据库（Database）是按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库，简而言之就是存储数据的仓库。2. 数据库的分类：常见的有层次式数据库、网络式数据库、关系型数据库。其中关系型数据库占据着市场的主流。其中关系型数据库是建立在关系模型基础上的数据库。3.常见的关系型数据库:SqlServer
Oracle
MySql
DB2
...4.MySql介绍
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2023-07-31 11:10:40
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mysql基础操作入门数据库的介绍下面是相关数据库操作：创建用户并分权限 数据库的介绍数据库是什么，怎么玩？简单介绍一下~ 1.数据库（Database）是按照数据结构来组织、存储和管理数据的仓库(db和dbms) 2.数据库的分类：即关系型数据库和非关系型数据库。而我们今天来说的Mysql就是典型的关系型数据库 关系型数据库:oracle、mysql、sql server等 非关系型数据库：r
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2023-08-08 12:33:09
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前期我们详细的介绍了，第一范式到第四范式的具体形式，如下：数据库的逻辑设计示例：设关系模式R（学
原创
2022-06-29 18:17:19
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