前言本人还是学生嗷，最近呢，想修炼一下自己的作图能力，写下学习笔记，督促自己学习，也希望能帮到别人，欢迎点赞关注，欢迎评论鼓励hhh，当然也欢迎批评指正~~（封面纯属为了好看，与内容无关）申明下使用的版本，Windows，R4.0.3。1.图形创建与保存（1）使用语句，打开一个图形文件，作图，关闭文件。getwd()#看下工作目录在哪
setwd("D:/R_demo")#设置工作目录，方便获取数
转载
2023-07-13 23:02:18
161阅读
# R语言cumulative events图实现步骤
## 概述
在本文中，我们将讨论如何使用R语言创建cumulative events图。该图形可以用于显示事件发生的累积次数随时间的变化情况。我们将通过以下步骤完成这个任务：
1. 准备工作：导入所需的库和数据
2. 数据处理：根据需要对数据进行预处理
3. 创建cumulative events图：使用R中的绘图函数创建图形
4. 添加
原创
2023-09-21 07:43:20
199阅读
最近我们被客户要求撰写关于DLNM的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文提供了运行分布滞后非线性模型的示例，同时描述了预测变量和结果之间的非线性和滞后效应，这种相互关系被定义为暴露-滞后-反应关联。视频：R语言中的分布滞后非线性模型（DLNM）
R语言中的分布滞后非线性模型（DLNM）与发病率，死亡率和空气污染示例 数据数据集包含1987-2000年期间每日死亡率（CVD、呼吸道），天气（
转载
2024-06-18 16:46:28
75阅读
R语言 rr值 森林图 r语言seq
转载
2022-08-30 13:23:00
187阅读
最近我们被客户要求撰写关于分布滞后非线性模型（DLNM）的研究报告，包括一些图形和统计输出。本文提供了运行分布滞后非线性模型的示例，同时描述了预测变量和结果之间的非线性和滞后效应，这种相互关系被定义为暴露-滞后-反应关联。
R语言中的分布滞后非线性模型（DLNM）与发病率，死亡率和空气污染示例 数据数据集包含1987-2000年期间每日死亡率（CVD、呼吸道），天气（温度，相对湿度）和污染数
转载
2023-08-25 16:15:44
216阅读
# R语言与回归分析（RR）
## 引言
R语言是一个强大的统计计算和图形绘制工具，广泛应用于数据分析和回归分析（Regression Analysis）。回归分析是一种统计方法，用于研究因变量与一个或多个自变量之间的关系。在本文中，我们将探讨R语言中的回归分析，通过一些代码示例和类图，帮助读者理解这一重要概念。
## 1. 回归分析概述
回归分析的主要目的是建立自变量与因变量之间的数学关
原创
2024-09-10 06:37:32
143阅读
在实践中，数字并不总是像它们在理论上那样好理解，因为实际产生的数据往往小数较多。因此通常有必要对数字进行四舍五入，以使它们更具可读性。 本文介绍 R 提供的几个类似功能函数，进行对比学习。数据四舍五入两个数据相除结果可能包括很多小数，一般需要进行四舍五入。四舍五入可以有多种方式实现，大多数语言都类似函数，R也一样。你可以向上或向下四舍五入，也可以四舍五入到最接近的整数或预定的数字。因此需要几个不同
转载
2023-10-05 15:24:43
250阅读
# R语言中的Meta分析及其RR值计算
Meta分析是一种统计分析方法，用于合并和分析多项独立研究结果。它能够提高研究结果的有效性和可信度，尤其是在医学和社会科学领域中。本文将重点介绍如何使用R语言进行Meta分析，并计算风险比（RR值）。
## 什么是RR值？
RR值，全称风险比（Risk Ratio），是用来衡量暴露组与非暴露组事件发生风险的比率。例如，在研究某种药物对疾病预防效果时，
原创
2024-09-11 04:58:26
469阅读
# RR计算与R语言：一个简单的入门指南
RR（风险比，Risk Ratio）是一种流行病学中用来衡量暴露与结局之间关系的统计量。简单来说，RR可以帮助我们了解某种暴露（比如吸烟）对某种疾病（如肺癌）发生的影响。本文将通过R语言介绍如何计算RR，并附上代码示例，帮助读者更好地理解这一概念。
## RR的基本概念
风险比 (RR) 是比较两组风险的比例。这两个组通常是指暴露组和非暴露组。RR的
原创
2024-09-01 05:24:56
315阅读
传统时间序列主要针对平稳序列进行建模，因为趋势性（如长期趋势，季节趋势）在前期建模过程中已经剔除，我们需要深入挖掘剔除趋势性后的部分之间的线性影响关系。故本案例采用R语言自带的数据集“Nile”：包含了1898年到1958年间，每年尼罗河水位的数据集。library (PerformanceAnalytics)
library(tseries)
library(forecast)
library(
转载
2023-08-02 15:01:24
179阅读
1.什么是三维PCA？ 人眼一般能感知的空间为二维和三维。高维数据可视化的重要目标就是将高维数据呈现于二维或三维空间中。高维数据变换就是使用降维度的方法，使用线性或非线性变换把高维数据投影到低维空间，去掉冗余属性，但同时尽可能地保留高维空间的重要信息和特征。 主成分分析法，也被称为主分量分析法，是很常用的一种数据降维方法。主成分分析法采用一个线性变换将数据变换到一个新的坐标系统，使得任何数据点投
转载
2023-10-20 17:24:31
473阅读
热图可以聚合大量的数据，并可以用一种渐进色来优雅地表现，可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言 pheatmap 包从头开始绘制各种漂亮的热图。参数像积木，拼凑出你最喜欢的热图即可，如下图： 基因和样本都可以单独聚类，排序，聚类再分组，行列注释，配色调整，
转载
2023-06-21 14:44:18
1328阅读
# R语言做PCoA图
## 介绍
主坐标分析（Principal Coordinate Analysis，简称PCoA）是一种多元统计分析方法，用于研究样本之间的相似性或差异性。通过计算样本间的欧氏距离矩阵，然后将其转换为低维度的坐标，从而可视化样本之间的关系。在本文中，我们将学习如何使用R语言进行PCoA分析，并生成相应的图表。
## 数据准备
我们首先需要准备一个包含样本数据的数据集
原创
2023-08-13 07:29:02
379阅读
# 使用R语言绘制热图
热图（Heatmap）是一种非常直观的数据可视化方法，常用于展示数据的强度或频率等模式。它通过颜色的鲜艳程度来表现数据点的大小，通常用于生物信息学、市场分析、社会科学等领域。在这篇文章中，我们将介绍如何使用R语言绘制热图，并提供完整的代码示例。
## 热图的基本原理
热图的基本原理是将二维矩阵中的数据值用不同的颜色来表示，通常情况下，较高的数值用色彩较深的颜色表示，较
# 使用R语言做光谱图的步骤和代码示例
## 简介
在本文中，我将向您介绍如何使用R语言来创建光谱图。光谱图是用于显示物体在不同波长下的辐射能量的图形。通过这个教程，您将学会使用R语言的一些常见函数来处理和绘制光谱数据。
## 整体流程
下面是创建光谱图的整体流程。我们将逐步进行，确保您了解每个步骤的目的和所需的代码。
| 步骤 | 描述 |
| --- | --- |
| 步骤一：加载数据
原创
2023-08-27 12:22:33
542阅读
R语言处理缺失数据的5个常用包1.常用缺失数据处理包2. MICE 包2.1基本介绍2.2 实例展示3.Amelia包3.1基本介绍3.2实例展示4.missForest包4.1基本介绍4.2实例展示5.Hmisc包5.1基本介绍5.2实例展示6.mi包6.1基本介绍6.2实例展示 1.常用缺失数据处理包1.MICE 2.Amelia 3.missForest 4.Hmisc 5.mi书籍推荐：
R语言绘制带聚类树的堆叠柱形图聚类树与柱形图结合，即可反映样本或分组间的相似性，又能展示样本内的元素组成信息。例如下图是一个在扩增子测序微生物群落分析中常见的统计图类型，在测序公司给的报告中通常都有这么一张图。聚类树表示了各样本或分组之间，物种丰度组成的相似性或相异程度；柱形图就是常见的物种堆叠柱形图，常用于表示代表性的门纲目科属等丰度，如下图中即展示了各样本中丰度排名前10的细菌门的丰度信息。很
转载
2023-06-25 13:18:06
479阅读
GSEA文件准备setwd("F:\\GEO\\GEO芯片数据/")
##下载好的载入
load('GSE35896_eSet.Rdata')
a=gset[[1]]
##取出第一个元素赋值给一个对象a
dat=exprs(a)
#a现在是一个对象，取a这个对象通过看说明书知道要用exprs这个函数，该函数得到表达矩阵
#现在 得到的dat就是一个表达矩阵，只不过基因的ID是探针名
dim
转载
2023-06-25 13:04:35
223阅读
R语言数据分析系列之三
—— by comaple.zhang
上次讲了vector这次讲matrix，array，dataframe，ts数据结构matrix 矩阵R语言中矩阵可以理解为是由两个及两个以上的向量组成。矩阵创建从向量创建> x <- sample(1:100,16)
> x
[1] 14 43 89 3 96 58 61 75 33 66 24
转载
2023-10-25 18:58:27
133阅读
本博文基于win10 64位操作系统进行的安装操作 R、R Studio的安装配置一、R的安装1、下载：1、官网：2、百度网盘2、安装步骤二、R Studio的安装配置1、官网：2.安装步骤 一、R的安装1、下载：1、官网：1.点击 https://cran.r-project.org/ 进入后，点击Mirrors，选择其中一个站点China: 2.选择你自己电脑对应的系统去安装(此处以W
