之前做Spark大数据分析的时候，考虑要做Python的版本升级，对于Python2和Python3的差异做了一个调研，主要对于语法和第三方工具包支持程度进行了比较。基本语法差异核心类差异Python3对Unicode字符的原生支持Python2中使用 ASCII 码作为默认编码方式导致string有两种类型str和unicode，Python3只支持unicode的string。python2和
对Excel中的数据进行分析时，大多数都会采用图表来进行分析，因为相对于表格，图表更直观地展现数据，也能快速看出各数据之间的差异或关系。日常工作中，对数据进行对比分析时，通常会使用柱形图和条形图，但其实，我们也可以根据分析的具体情况来使用其他图表进行对比分析今天就给大家分享几种对比分析比较经典的图表，下面就一起来看看吧！1．去年与今年收入对比分析柱形图柱形图是最常用的图表之一，常用于数据的比较。下
基于 RNA 数据的分析还有很多展示形成，我这里都会一次介绍，以及最后的 SCI 文章中的组图，完成所有分析流程，首先讲下 MA 图形的绘制流程，这里还是非常全面的，仅供参考！MA plotMA-plot （M-versus-A plot），也称为 Bland-Altman plot，主要应用在基因组数据or 转录组的数据展示，主要是对于数据分布情况的可视化。该图将数据转换为M（对数比）和 A（平
1、GSVA/基因集变异分析定义：将分析的功能单元从基因向基因集进行改变，进行基因集（通路）级别的差异分析。2、分析原理：将基因在不同样本间的表达矩阵（列为样本，行为基因名）转化成基因集在样本间的表达矩阵，评估不同的通路在不同样本间是否富集，研究目标基因集在不同样本间的差异、寻找重要的基因集 3、单细胞运用场景a、分析组间细胞功能差异b、分析细胞亚群异质性4、下游分析a、limma通路差
回归，最初是遗传学中的一个名词，是由英国生物学家兼统计学家Galton首先提出。他在研究人类身高时发现高个子回归于人口的平均身高，矮个子从另一个方向回归于人类平均身高。回归分析是研究自变量与因变量之间数量变化关系的一种方法。主要是通过建立因变量Y与自变量X之间的回归模型，衡量X对Y的影响能力，进而来预测Y的发展趋势。相关分析与回归分析的联系：均是研究两个或两个以上变量之间关系的方法。实际工作中，回
1.背景介绍方差分析是一种分析调查或试验结果是否有差异的统计分析方法，也就是检验各组别间是否有差异。本文我们就一起来梳理下方差分析的分析流程。以及实现方法。R语言进行单因素方差分析或者非参数检验，也是非常方便的，简单快捷，仅仅几行代码，即可快速进行组间两两比较。2.基础知识1.数据类型方差分析用于分析定类数据与定量数据之间的关系情况，可以比较2组或多组数据的差异。分析前首先应根据数据类型判断使用的
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2023-08-01 14:27:39
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最近小编收到最多的问题就是想做差异分析，应该选择那种分析方法？数据之间的关系一般分为四种：差异关系、相关关系、影响关系以及其它关系。 一、说明差异研究的目的在于比较两组数据或多组数据之间的差异。差异关系和相关关系有时候会被搞混，它们是不同的，区别是：差异关系中的差异是指不同样本组的某个指标的差异，例如男生和女生的智力差异，涉及到了变量的分组；相关分析是两个变量之间的关系，和样本分组无关，
基因表达差异的显著性分析简称表达差异分析，其目的是比较两个条件(包括种属、表型等)下的基因表达差异，通过一定的统计学方法，从中识别出与条件相关的特异性基因，然后进一步分析这些特异性基因的生物学意义。基因表达差异分析的第一步是要识别在两个条件下有显著性表达差异的基因，简称差异表达基因。那么怎样才能称得上显著性表达差异？通常是指一个基因在两个条件中表达水平的检测值差异具有统计学意义，往往基于一定的统计
目录一、可信1、可信计算基础思想二、可信计算概念1、信任根&信任边界2、传递信任（Transitive Trust）& 信托机构（Trust Authority）1、信托机构三、TPM（Trusted Platform Module）四、可信根五、可信启动关键技术概念介绍（以国产TPCM为例）1、TPCM节点可信框架2、TPCM节点可信链组成3、TPCM度量部件4、TPCM静态度
方差分析指的是不同变量之间互相影响从而导致结果的变化1.单因素方差分析: 案例:50名患者接受降低胆固醇治疗的药物,其中三种治疗条件使用药物相同(20mg一天一次,10mg一天两次,5mg一天四次),剩下的两种方式是(drugE和drugD),代表候选药物 哪种药物治疗降低胆固醇的最多? 1 library(multcomp)
2 attach(cholesterol)
3 # 1
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2023-08-22 16:07:39
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用SPSS的童鞋都知道，我们常用的方差分析(ANOVA)在一般线性模型(General Linear Model，简称GLM)的菜单下。那GLM是何许人也呢？让我们打开万能的wiki，键入General Linear Model。。。看到的居然是一张毫无违和感的Fitting Plot： &
差异表达分析通常作为根据基因表达矩阵进行生物信息学分析的第一步，有助于我们观察基因在不同样本中的表达差异，从而确定要研究的基因和表型之间的联系。常用的基因表达数据来自基因芯片或高通量测序。虽然矩阵看起来差不多，但是由于服从不同的分布，因此在进行差异表达的时候需要用不同的方法。对于一般的生命科学领域科研人员来说，了解
单变量方差分析 方差分析的主要功能就是验证两组样本，或者两组以上的样本均值是否有显著性差异（是否一致）。 这里有两个大点需要注意：①方差分析的原假设是：样本不存在显著性差异（即，均值完全相等）；②两样本数据无交互作用（即，样本数据独立）这一点在双因素方差分析中判断两因素是否独立时用。 原理 方差分析的原理就一个方程：
SS
T
=
SS
M
+
SS
E  
1、独立样本T检验一般仅仅比较两组数据有没有区别，区别的显著性，如比较两组人的身高，体e69da5e6ba9062616964757a686964616f31333365666230重等等，而这两组一般都是独立的，没有联系的，只是比较这两组数据有没有统计学上的区别或差异。2、单因素ANOVA也就是单因素方差分析，是用来研究一个控制变量的不同水平是否对观测变量产生了显著影响。拓展资料：SPSS(St
数据可视化——R语言forestplot包绘制组间差异对比图(森林图forest plot)概述：使用R语言中的forestplot包绘制组间差异对比图。forestplot包本来用于绘制森林图，此处笔者将此用于绘制组间差异对比图，异曲同工，为另一篇博文：数据可视化——R语言ggplot2包绘制组别间指标差异对比图(箱形图及误差条图)提供了另一种实现方案。森林图(forest plot)常用于Me
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2023-06-21 16:30:26
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读文献获取数据文献名称：AKAP95 regulates splicing through scaffoldingRNAs and RNA processing factors查找数据：Data availabilityThe RIP-seq an RNA-seq data have been deposited in the GeneExpression Omnibus database,
写在前面如果你忘记了前面的文章，可以看看加深印象：一、描述性统计分析Excel里可以用【数据分析】功能里的【描述统计】功能来查看数据集常用的统计指标，但这里只能是对数值型的数据进行统计。 pandas里可以用describe方法对整个数据集做一个描述性统计分析，当然这里也只是对数值型数据才可以出结果，非数值型数据不在统计范围内。# 描述性统计分析
df_list.describe()得到
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2023-08-23 13:57:59
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问 1：
在没有重复实验的情况下，用 RPKM 要怎么做检验呢？
答：
如果要用泊松分布做差异分析模型的话，必须要用 reads count 的。只有 RPKM值的话，可以用 RPKM 的公式反推 reads count 数，再做检验。
问 2：
Deseq 是怎么控制 reads 多重比对的？
答：
Deseq 只是一个差异分析的软件，多重比对的分配是在 Deseq 之前的。 De
文章目录介绍环境搭建软件下载结果展示基因数据下载流程基因数据处理利用GEO分析绘制拟火山图 注意，本 系列 有连贯性，每一步都很详细，每一步都很重要，请耐心读完！！ 介绍本系列文主要依据真实论文制图流程，详细说明制图过程，
其中包括：
1. 基因数据下载
2. 制图所需数据格式
3. 火山图制作流程
4. 聚类热图制作流程环境搭建软件下载结果展示基因数据处理 注意删除末行注释基因
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2023-08-31 16:29:08
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TCGA癌症基因差异分析步骤 文章目录TCGA癌症基因差异分析步骤1. 数据库下载2. 将分散的文件转化为矩阵3. 将矩阵id转化为基因名4. 进行差异表达分析 1. 数据库下载进入TCGA数据库官网，根据自己的需求下载各种癌症的数据库，全部勾选好对应的需求之后，下载解释文件（manifest），基因表达量文件（cart），临床数据（clinical），生物多样性数据（biospecimen），样
