1000 Genome Project 的目标是发现在人群中频率大于1%的变异位点，
原创
2022-06-21 05:38:48
274阅读
UCSC Genome Browser 使用 登陆系统 然后 管理 custom tracks 修改： 保存session
基因组组装前言基因组组装(Genome assembly)是生物信息学领域的核心问题，基因组组装就是把序列测序产生的读取片段reads经过序列拼接组装，生成基因组的碱基序列。基因组组装软件可根据得到的所有读长组装成基因组。基因组组装这个步骤对于基因组分析是十分关键的，因为目前二代测序技术获得的测序序列一般都较短，需要组装拼接成较长的完整的序列用于进一步分析，例如长序列能提高物种注释分析的准确性。宏
kegg Genome 数据库
原创
2022-06-21 05:23:52
152阅读
题目大意： 给出两个序列，统计一下有多少的二元组（a,b）满足以下条件:a是序列A的连续子序列，b是序列B的连续子序列，且a，b包含的数字完全相同
解题思路：记录序列B每个数字所在的位置，用MIN记录序列a在序列B中的最左端的位置，MAX记录序列a在序列B中最右端的位置，num记录这个子序列有多少个数字，如果满足MAX - MIN + 1 == num就表示满足
#include
#inclu
原创
2023-04-07 10:43:29
34阅读
Description：Recently a top secret mission to Mars has taken place. As a result, scientists managed toNA contains at most...
原创
2023-02-03 10:14:52
122阅读
思路：dfs维护一个拓扑序就好了#include<bits/stdc++.h>
using namespace std;
const int maxn = 250;
vector<int>e[30];
int vis[maxn];
string ans;
void dfs(int x)
{
vis[x]=2;
for (int i = 0;i<e[x].size(
原创
2023-06-09 18:22:46
57阅读
# -*- coding: utf-8 -*-
# @Time : 2018/03/08 10:32
# @Author : cxa
# @File : gethtmlandimg.py
# @Software: PyCharm
import requests
from fake_useragent import UserAgent as UA
from lxml import
转载
2018-03-08 09:54:00
79阅读
2评论
在 UCSC Genome Browser 中进行的操作都会保存在当前的URL （浏览器中输入网址信息的输入框中的文本）中，可以分享给别
IGV 的功能简言之，适用于reads覆盖度的成图。以下复制于： 整合基因组浏览器(IGV)是一种高性能的可视化工具，用来交互式地探索大型综合基因组数据。它支持各种数据类型，包括array-based的和下一代测序的数据和基因注释。IGV这个工具很牛，发了NB： James T. Robinson, Helga Thorvaldsdóttir, Wendy Winckler, Mitchell G
一、VG数据集 机器学习领域的突破突然让计算机获得了以未曾有的高精度识别图像中物体的能力——几乎达到了让人惊恐的程度。现在的问题是机器是否还能更上层楼，学会理解这些图片中所发生的事件。 Visual Genome的新图像数据库有望推动计算机向这一目标挺进，并帮助衡量计算机在理解真实世界这一进程中的进步。教会计算机理解视觉场景是人工智能非常重要的基础。它不仅能产生更多
转载
2018-03-05 18:04:00
286阅读
2评论
Genome2D作
原创
2023-01-05 16:22:51
107阅读
题目大意：给出两条长度均为n的DNA链A和B，你的任务是找出一段最长的区域，使得该区域内的突变位置不超过p%
解题思路：设sum1为两条DNA链前i个不同基因的数量，sum2为两条DNA链前j个不同基因的数量(j > i),因为要满足公式(sum2-sum1) / (j-i) >= p / 100，由公式变形的 sum2 * 100 - p * j >= sum1 * 100 - p * i。再
原创
2023-04-07 10:43:28
65阅读
早都听说了Genymotion好用，今天才抽空把他配置出来，过程算是很曲折啊，不过好在完成了。而且我发现网上的教程都不怎么全，我还是找了好几篇文章才把他完整的配置出来，这篇是我从下载到项目运行成功的所有过程，希望对大家有所帮助。闲话到此结束。首先第一步：注册Genymotion账号，要记下账号密码后面使用。注册地址：http://www.genymotion.com/。第二步：一般情况下教程上会让
期刊简介Genome Research 创刊于1995年，由国际出版商Cold Spring Harbor Laboratory Press出版。期刊文章发表关于所有生物体基因组的结构、功能、生物学和进化研究，长期强调基因组规模分析、染色质结构和功能、表观基因组学、系统遗传学和蛋白质组学；并涉及高通量实验和计算方法的新见解和报告基因。涉及其他核心领域：1. 基因组序列变异综合表征2. 表
更新：又用了一段时间，发现是真的好用，可惜就是服务器上装不上，只能在Mac上用了。 核心代码很少： library(ggbio) # hg19 library(EnsDb.Hsapiens.v75) ensdb <- EnsDb.Hsapiens.v75 options(repr.plot.widt
转载
2021-03-05 17:57:00
725阅读
2评论
B. Making Genome in Berland 题目连接： http://www.codeforces.com/contest/638/problem/B Description Berland scientists face a very important task given the
原创
2021-07-16 13:48:24
106阅读
关键词：农业；基因测序；变异检测；文献简介标题（英文）：Genome-wide imputation using the practical haplotype graph in the heterozygous crop cassava标题（中文）：使用杂合作物木薯中的实用单倍型图进行全基因组插补发表期刊：G3作者单位：康奈尔大学等发表年份：2021文章地址：https://doi.org/10
目录图形泛基因组的构建图泛构建方法获取和合并PAV变异图泛的存储格式线性参考基因组坐标的恢复图泛的可视化图泛的
欢迎关注”生信修炼手册”!对于chip_seq的数据，我们可以通过UCSC, igvtools等基因组浏览器
原创
2022-06-21 09:16:21
382阅读
