Vcf文件格式是GATK钟爱的表示遗传变异的一种文件格式。
就拿GATK给出的vcf例子说明吧，下面这个文件只表示了一个完整vcf文件的前几个SNP。
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2023-07-07 15:59:00
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下载了千人基因组variants数据，是.vcf.gz和.vcf.gz.tbi文件格式，需要在linux上打开，此时我还是一个生信小菜鸡，记录一下vcf文件读取和详细解释。在服务器先解压再打开，gunzip 文件.vcf.gz
cat 文件.vcf
//建议用more或者less打开，对于大文件cat并不适用结果如下，60G+的文件太大了，只好读取一部分：VCF各列意义说明各列之间用tab空白隔开
VCF全称为Variant Call Format, 是一种纯文本文件，用来存储变异位点信息，主要包括3个部
原创
2022-06-21 05:39:18
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VCF文件格式VCF是用于描述SNP，INDEL和SV结果的文件，下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件，与SAMtools的结果有点不同VCF文件可以分为两部分看，最上面#号注释的的部分是对一些参数的解释，文件格式信息可以从这些注释中获得，而下面没#号注释的部分则是各个参数对应的具体的值。一般先关注以下几列信息，从左到右为：#CHROM POS ID REF ALT QUAL F
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2024-01-01 17:20:55
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手动导出实例Android（Android6）系统自带的联系人导出00001.vcf文件实例：BEGIN:VCARDVERSION:2.1N;CHARSET=UTF-8;ENCODING=QUOTED-PRINTABLE:;=E5=BC=A0=E4=B8=89;;;FN;CHARSET=UTF-8;ENCODING=QUOTED-PRINTABLE:=E5=BC=A0=E4=B8=89TEL;CE
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2024-01-06 20:09:47
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VCF文件示例（VCFv4.2）##fileformat=VCFv4.2##fileDate=20090805##source=myImputationProgramV3.1##reference=file:///seq/references/1000GenomesPilot-NCBI36.fast...
原创
2023-11-06 15:33:22
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将Excel文件（xlsx）中的联系人和电话转换成vcard文件（.vcf)，并用pyinstaller打包发布效果： 将一个Excel表格和该脚本放入同一个文件夹下，运行脚本，输入感兴趣的联系人所在行序号，直接生成vCard文件步骤：获取同文件夹下的绝对路径（用于pyinstaller打包）读取绝对路径下的xlsx文件数据（要input的：联系人和电话所在列数，以及要输出的数据行数）套用vcf格
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2024-08-11 22:08:55
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VCF格式说明
VCF是用于描述SNP，INDEL和SV结果的文件，下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件，与SAMtools的结果有点不同VCF文件可以分为两部分看，最上面#号注释的的部分是对一些参数的解释（看英文能懂的话，下面的解释就不用看了），而下面没#号注释的部分则是各个参数对应的具体的值一般先关注以下几列信息，从左到右为：CHROM POS ID
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2023-06-19 23:40:49
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欢迎关注”生信修炼手册”!plink是目前使用的最为广泛的关联分析软件，其定义的ped/map文件系统，及其
原创
2022-06-21 09:23:33
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/** * 获取通讯录 * @param modelMap * @param id * @param request * @return */ &
原创
2015-01-19 22:07:43
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上上周把手机丢了，可是原先备份的通讯录只有一个.vcf文件，里面含盖了我所有的人信息比如100个人信息他全存进一个.vcf文件了。换了新手机，怎么也导不到新手机里面，原因是新手机只支持一个.vcf文件里存一条通讯录的那种格式，比如100个人信息就得有100个.vcf文件放到内存卡里才能还原。 我用文本方式观察了一下，正好可以用c++处理一下，正好也练一个文件处理方面的基本功。代码如下，...
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2011-08-05 17:02:00
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生成某个城市前三后二的电话簿文件
推荐
原创
2022-03-17 17:52:23
1712阅读
前文回顾1. GATK官方教程 / 概述及工作前的布置2. GATK教程 / 体细胞短变异检测 (SNV
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2023-07-19 10:02:43
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今天 想把原来NOKIA上面的通讯录备份到天翼的机子上去..结果 一个是VCF一个是CSV格式的当时我就悲剧了...在网上看了很多方法 最后终于总结出了一个行之有效的方法与大家分享。首先在GMAIL网 注册一个免费用户，然后进入GMAIL邮箱 点开通讯录 把旧手机的电话薄导出到电脑的硬盘上，然后在导入通讯录，导入到通讯录以后，我们就可以导出很多格式，当然也有我们要的CSV格式 选择导出的时候 （笔
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精选
2013-06-04 15:31:39
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//========================================================================//TITLE:// vcf文件分解//AUTHOR:// norains//DATE:// Saturday 4-October-2008//Environment:// NONE//======================================================================== 不知为何，索爱K750再也起不来了，只好去买款NOKIA 5320。所幸的是，之前索爱K750有一部分联系人是存在PC的
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2008-10-04 21:39:00
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# Java生成VCF文件的方法
## 1. 整体流程
在Java中生成VCF文件的过程可以分为以下几个步骤：
| 步骤 | 描述 |
|---|---|
| 1 | 创建VCF文件对象 |
| 2 | 设置VCF文件的属性和字段 |
| 3 | 添加联系人信息 |
| 4 | 保存VCF文件 |
下面我们将逐步展开每个步骤，并给出相应的代码示例。
## 2. 创建VCF文件对象
在J
原创
2023-08-04 10:02:01
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RFC及RFC编辑者： RFC(Request For Comments)-意即“请求注解”，包含了关于Internet的几乎所有重要的文字资料。如果你想成为网络方面的专家，那么RFC无疑是最重要也是最经常需要用到的资料之一，所以RFC享有网络知识圣经之美誉。通常，当某家机构或团体开发出了一套标准或提出对某种标准的设想，想要征询外界的意见时，就会在Internet上发放一份RFC，对这一问题感兴
http://www.imc.org/pdi/vcard-21.txt
vCard 规范容许公开交换个人数据交换 (Personal Data Interchange PDI) 信息，在传统纸质商业名片可找到这些信息。规范定义电子名片（或叫vCard）的格式。
vCard 规范可作为各种应用或系统之间的交换格式。定义的格式与传送的方法无关。传送交换可能是文件
原创
2010-10-24 17:27:00
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## 自定义电话号码在Python中的显示名称
在Python中，我们经常需要处理各种数据格式，其中之一就是vcf（vCard File）格式文件，也就是通常我们所说的联系人信息文件。在这种格式中，每个联系人的信息都包含了电话号码、姓名等信息。有时候我们希望能够自定义电话号码的显示名称，使得联系人信息更加清晰明了。本文将介绍如何在Python中处理vcf格式文件，并自定义电话号码的显示名称。
原创
2024-05-13 04:41:02
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欢迎关注"生信修炼手册"！tabix 可以对NGS分析中常见格式的文件建立索引，从而加快访问速度，不仅支持V
原创
2022-06-21 09:02:05
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