VCF格式说明 VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文件,下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件,与SAMtools的结果有点不同VCF文件可以分为两部分看,最上面#号注释的的部分是对一些参数的解释(看英文能懂的话,下面的解释就不用看了),而下面没#号注释的部分则是各个参数对应的具体的值一般先关注以下几列信息,从左到右为:CHROM POS ID
转载 2023-06-19 23:40:49
153阅读
Vcf文件格式是GATK钟爱的表示遗传变异的一种文件格式。 就拿GATK给出的vcf例子说明吧,下面这个文件只表示了一个完整vcf文件的前几个SNP。
转载 2023-07-07 15:59:00
213阅读
  /**     * 获取通讯录     * @param modelMap     * @param id     * @param request     * @return     */  &
VCF
原创 2015-01-19 22:07:43
2749阅读
上上周把手机丢了,可是原先备份的通讯录只有一个.vcf文件,里面含盖了我所有的人信息比如100个人信息他全存进一个.vcf文件了。换了新手机,怎么也导不到新手机里面,原因是新手机只支持一个.vcf文件里存一条通讯录的那种格式,比如100个人信息就得有100个.vcf文件放到内存卡里才能还原。 我用文本方式观察了一下,正好可以用c++处理一下,正好也练一个文件处理方面的基本功。代码如下,...
转载 2011-08-05 17:02:00
73阅读
2评论
今天 想把原来NOKIA上面的通讯录备份到天翼的机子上去..结果 一个是VCF一个是CSV格式的当时我就悲剧了...在网上看了很多方法 最后终于总结出了一个行之有效的方法与大家分享。首先在GMAIL网 注册一个免费用户,然后进入GMAIL邮箱 点开通讯录 把旧手机的电话薄导出到电脑的硬盘上,然后在导入通讯录,导入到通讯录以后,我们就可以导出很多格式,当然也有我们要的CSV格式 选择导出的时候 (笔
转载 精选 2013-06-04 15:31:39
3193阅读
VCF全称为Variant Call Format, 是一种纯文本文件,用来存储变异位点信息,主要包括3个部
原创 2022-06-21 05:39:18
656阅读
//========================================================================//TITLE:// vcf文件分解//AUTHOR:// norains//DATE:// Saturday 4-October-2008//Environment:// NONE//======================================================================== 不知为何,索爱K750再也起不来了,只好去买款NOKIA 5320。所幸的是,之前索爱K750有一部分联系人是存在PC的
转载 2008-10-04 21:39:00
91阅读
2评论
# Java生成VCF文件的方法 ## 1. 整体流程 在Java中生成VCF文件的过程可以分为以下几个步骤: | 步骤 | 描述 | |---|---| | 1 | 创建VCF文件对象 | | 2 | 设置VCF文件的属性和字段 | | 3 | 添加联系人信息 | | 4 | 保存VCF文件 | 下面我们将逐步展开每个步骤,并给出相应的代码示例。 ## 2. 创建VCF文件对象 在J
原创 2023-08-04 10:02:01
228阅读
VCF文件格式VCF是用于描述SNP,INDEL和SV结果的文件,下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件,与SAMtools的结果有点不同VCF文件可以分为两部分看,最上面#号注释的的部分是对一些参数的解释,文件格式信息可以从这些注释中获得,而下面没#号注释的部分则是各个参数对应的具体的值。一般先关注以下几列信息,从左到右为:#CHROM POS ID REF ALT QUAL F
欢迎关注"生信修炼手册"!tabix 可以对NGS分析中常见格式的文件建立索引,从而加快访问速度,不仅支持V
原创 2022-06-21 09:02:05
733阅读
1.在做数据处理时,matlab中经常会将.mat文件中的X和y分别以两个矩阵进行存储,例如wine.mat数据集 如下:多属性X和标签y已经分离 读取.mat代码import scipy.io data = scipy.io.loadmat('wine.mat') print(data) 2.如何将原始的csv文件转换成属性与标签分离的.mat文件呢? 首先看原始csv文件的y是紧跟在X后面的
转载 2023-07-02 21:53:41
96阅读
将Excel文件(xlsx)中的联系人和电话转换成vcard文件(.vcf),并用pyinstaller打包发布效果: 将一个Excel表格和该脚本放入同一个文件夹下,运行脚本,输入感兴趣的联系人所在行序号,直接生成vCard文件步骤:获取同文件夹下的绝对路径(用于pyinstaller打包)读取绝对路径下的xlsx文件数据(要input的:联系人和电话所在列数,以及要输出的数据行数)套用vcf
转载 1月前
77阅读
R, BioconductorfilterVcf: Extract Variants of Interest from a Large VCF File (Paul Shannon)We demonstrate three methods: filtering by genomic region, ...
原创 9月前
59阅读
vcf, 通讯录导出的一种格式。一。生成vcf文件假设要把我们iPhone通讯录里的数据, 生成vcf格式文件。我们能够借助iCloud。 小技巧:通过iCloud导出iPhone通讯录的方法当然, 假设你想在应用中, 利用代码生成, 全然能够。先导出通讯录数据, 再解析, 再生成vcf文件就可以。
原创 2022-01-12 11:13:04
337阅读
学习
转载 2012-12-20 22:23:00
356阅读
2评论
[toc] ## 需求描述 vcf是标准的基因型格式文件,其中包含的信息可多可少。主要在于INFO可无限扩展特征,以及每个样
原创 2023-07-31 01:10:15
303阅读
vcf是一种常见的生物信息学文件格式,用于存储基因组变异数据。它包含了个体基因组的单核苷酸多态性信息,如单核苷酸变异(SNV)、插入/缺失(Indel)等。由于vcf文件通常包含大量的变异数据,使用传统的手工分析方法很难从中提取有用的信息。因此,将vcf文件输入到机器学习模型进行分析和预测,成为了一种有效的策略。 在本文中,我们将探讨如何将vcf文件输入到机器学习模型中,并给出相应的代码示例。我
原创 2023-08-21 04:57:12
198阅读
java实现把csv文件中的数据导入的sqlserver数据库中,由于初学java很多可以通过BufferedReader 流的形式进行流缓存,之后通过readLine方法获取到缓存的内容。 BufferedReader bre = null; try { String file = "D:/test/test.txt";
转载 2023-07-17 17:34:55
34阅读
VCF文件示例(VCFv4.2)##fileformat=VCFv4.2##fileDate=20090805##source=myImputationProgramV3.1##reference=file:///seq/references/1000GenomesPilot-NCBI36.fast...
原创 9月前
81阅读
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5