结直肠癌(包括结肠癌和直肠癌):结直肠癌在全球范围内的发病率和死亡率都很高,是男性和女性中常见的恶性肿瘤之一。            
                
         
            
            
            
            # 结直肠癌数据分析可视化
结直肠癌是全球范围内一种常见的癌症,其早期发现和有效治疗对提高生存率至关重要。近年来,数据分析技术的发展为医学研究和疾病管理提供了新的视角。本文将探讨如何使用Python进行结直肠癌的数据分析和可视化,帮助我们更好地理解该疾病的影响及其潜在的趋势。
## 数据收集
首先,我们需要收集关于结直肠癌的数据。通常,这些数据可以从公共数据库获取,如美国国家癌症数据中心(S            
                
         
            
            
            
            该数据集由一组接受手术切除肿瘤的结直肠癌(Colorectal Cancer)患者信息组成。            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
                            2022-10-17 13:56:00
                            
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            本实验数据集来源于Kaggle,原始数据集共有167497条数据,28个变量。该数据集包含来自不同国家的结直肠癌病例的真            
                
         
            
            
            
              中新网深圳8月8日电 (记者 索有为)华大集团8日发布消息称,瑞典乌普萨拉大学近日联合华大集团旗下的华大生命科学研究院、华大基因智惠医学研究院,对逾千例结直肠癌样本进行了全基因组及转录组测序分析,发现了一系列与癌症不同阶段相关的基因,并识别了结直肠癌关键预后因子,为结直肠癌的预防、治疗及预后提供了数据基础,相关研究成果于8月7日发表于全球顶级学术期刊《自然》(Nature),这也是目前全球最大            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
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            中心(BIOPIC)、生命科学学院白凡课题组的研究论文:Mapping...            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        转载
                                                                                    
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            黑米饮食通过调节色氨酸代谢和激活AHR通路缓解结直肠癌发展iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.165● 2024年1月15日,华中农业大学陈振夏、湖北省肿瘤医院魏少忠和梁新军等团队在iMeta在线联合发表了题为 “Black rice diet alleviate            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        转载
                                                                                    
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简介
标准化发病率(SIR)或死亡率(SMR)是观察病例和期望病例的比率。观察到的病例是队列中病例的绝对数量。期望病例是通过将队列中的人-年数与参考人口比率相乘得出的。该比率应按混杂因素进行分层或调整。通常这些因素是年龄组、性别、日历期和可能的癌症类型或其他混杂变量。也可以使用社会经济地位或地区变量。
在参考人口中,第j层的期望比率是λj=dj/nj,其中dj是观察到的病例,nj是观察到的人年。            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
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简介
标准化发病率(SIR)或死亡率(SMR)是观察病例和期望病例的比率。观察到的病例是队列中病例的绝对数量。期望病例是通过将队列中的人-年数与参考人口比率相乘得出的。该比率应按混杂因素进行分层或调整。通常这些因素是年龄组、性别、日历期和可能的癌症类型或其他混杂变量。也可以使用社会经济地位或地区变量。
在参考人口中,第j层的期望比率是λj=dj/nj,其中dj是观察到的病例,nj是观察到的人年。            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
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            简介标准化发病率(SIR)或死亡率(SMR)是观察病例和期望病例的比率。观察到的病例是队列中病例的绝对数量。期望病例是通过将队列中的人-年数与参考人口比率相乘得出的。该比率应按混杂因素进行分层或调整。通常这些因素是年龄组、性别、日历期和可能的癌症类型或其他混杂变量。也可以使用社会经济地位或地区变量。在参考人口中,第j层的期望比率是λj=dj/nj,其中dj是观察到的病例,nj是观察到的人年。现在S            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
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            2024/08/19 ,由香港中文大学(深圳)、深圳未来网络智能研究所 等多家机构联合创建ERUS-10K 数据集,包含77个直肠内超声视频,其中包含10,000个高质量注释帧,涉及内窥镜超声 结直肠癌的分割、检测和侵袭深度评估等多场景。            
                
         
            
            
            
            撰文 |赵齐/陈衍行结直肠癌(Colorectal cancer, CRC)是全球发病率排名第三            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            基因突变检测在临床上主要可以用于疾病的早期筛查、诊断及预后判断。1、多种恶性肿瘤,如恶性黑色素瘤、甲状腺癌、结直肠癌、肺癌等存在不同比例的B-raf基因突变;2、结直肠癌、胰腺癌、肺癌等存在不同比例的K-ras基因突变。3、良性肿瘤的患者若是检出B-raf或K-ras基因突变,提示有肿瘤恶变的可能。4、PIK3CA基因突变检测,对肺癌、乳腺癌、结直肠癌等肿瘤患者的早期筛查、诊断及预后具有重要意义。            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            结直肠癌在全球范围内是发病率第三、致死人数第四的恶性肿瘤(Beattie et al., 2005 ; Carey, 2017            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
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            群体基因组系列文章-1标题(英文):Comprehensive profiling of 1015 patients’ exomes reveals genomic-clinical associations in colorectal cancer标题(中文):对 1015 名患者外显子组的综合分析揭示了结直肠癌的基因组临床关联发表期刊:nature communications作者单位:中山大            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
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            结直肠癌差异基因筛选及功能预测软件安装jdk 环境变量perlGSEACytoscapeR数据下载Cohort  英文名称  中文名称ACC  Adrenocortical carcinoma  肾上腺皮质癌BLCA  Bladder Urothelial Carcinoma  膀胱尿路上皮癌BRCA  Breast invasive carcinoma  乳腺浸润癌CESC  Cervical            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
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              中新网上海6月19日电(陈静 朱恬)晚期结肠癌肝转移患者陈女士经历了1次结肠癌切除手术、28次化疗和1次介入化疗后,遍布肝脏的转移灶已对化疗药物逐渐产生耐药性。她还有救吗?答案是:有!
  记者19日获悉,在上海,肝肿瘤外科专家团队成功探索开展“废弃肝”肝移植联合ALPPS术(联合肝脏分隔和门静脉结扎的二步肝切除术),各方面恢复情况良好的陈女士已顺利出院。
  据悉,肝脏是结直肠癌常见            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
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            泊松建模标准化发病率或死亡率(SIR/SMR),即计算标准化率的间接方法。 SIR 是观察到的和预期的案例的比率。 预期病例数是通过将特定阶层的人口率乘以队列中相应的人年得出的。 我们继续使用我们的女性直肠癌数据  首先我们导入R包和数据library(popEpi)
library(Epi)
library(splines)
bc<-read.csv("E:/r/test/smr            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        转载
                                                                                    
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            解压后,主文件夹lung_colon_image_set包含两个子文件夹:colon_image_sets和lung_image_sets。sets包含三个二级子文件夹:lung_aca子文件夹包含5000张肺腺癌图像,lung_scc子文            
                
         
            
            
            
            数据集包含25,000张彩色图像,分为5个类别,每个类别有5,000张图像。所有图像的尺寸为768 x 768像素,并且采用jpg文件格式。解压后,主文件夹lung_colon_image_set包含两个子文件夹:colon_image_sets和lung_image_sets。子文件夹colon_image_sets包含两个二级子文件夹:colon_aca子文件夹包含5000张结肠腺癌图像,co