Abstract 这篇综述的目的是提供关于最近基于深度学习的分割方法对脑部MRI(磁共振成像)定量分析的概述。首先我们看一下最新用来分割脑部解剖结构和脑部损伤的深度学习框架。接下来总结和讨论了深度学习方法的表现,速度,和特性。最后给出了当前状况的关键性评价,并且确定了可能的未来发展和趋势。Background 脑功能成像一般选择MRI,有几个原因:MRI生成的医学图像对软组织有高对比度和空间分别率
# Python在医学分词中的应用 随着医学信息化的不断发展,医学文本数据的处理和分析变得越来越重要。在处理医学文本时,分词是一项必不可少的任务。分词的目的是将连续的文本序列切分成有意义的词语,为后续的文本分析和挖掘提供基础。 在Python中,有一些强大的工具可以用来进行医学分词,如jieba分词、snownlp等。本文将以jieba分词为例,介绍Python在医学分词中的应用。 ## j
原创 2024-05-02 03:47:39
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序言,VTK介绍:VTK 全称为 The Visualization Toolkit (可视化工具),是一个开源、跨平台、自由获取、支持并行计算的图形应用函数;拥有3D 渲染的最新工具、提供3D交互模式以及2D绘图等。VTK 包含一个C++类库,目前提供了众多语言接口,例如 Java、Python、TCL;在三维函数库OpenGL 的基础上采用面向对象设计方法发展起来图形学基本概念和数据结构,是V
作者:梦飞翔 编辑:学姐引自Unetr: Transformers for 3d medical image segmentation1.序言本文将以Nvidia团队最近提出的一种新的医学图像分割网络作为切入点,结合所用开源数据集,为各位同学提供一份从下载数据集到搭建网络训练医学任务的完整攻略,希望可以为各位医工交叉领域的同学提供一条捷径,力争少走弯路。2.开源数据集获取与使用本节将以论文作者使用
这里说医学图像数据读取及预处理方法医学图像分割这个方向,再具体一点比如腹部器官分割或者肝脏肿
原创 2024-08-02 12:23:51
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本文作者:阿元论文名称:《SOLO v2: Dynamic, Faster and Stronger》论文链接:arxiv.org/abs/2003.1015参考代码:http://github.com/WXinlong/SOLO (v1已开源~)综述SOLO v2遵循了SOLO的优雅、简单的设计,并且针对mask的检测效果和运行效率做了两个改进:(1)mask learning:能够更好地学习到
虽然深度学习模型已经成为医学图像分割的主要方法,但它们通常无法推广到涉及新解剖结构、图像模态或标签的unseen分割任务。给定一个新的分割任务,研究人员通常必须训练或微调模型,这很耗时,并对临床研究人员构成了巨大障碍,因为他们往往缺乏训练神经网络的资源和知识。作者提出UniverSeg,这是一种在没有额外训练的情况下解决unseen医学分割任务的方法。给定新分割任务的"query图像-标签pair
Swin-Unet: Unet-like Pure Transformer for Medical Image Segmentation论文:https://arxiv.org/abs/2105.05537代码:https://github.com/HuCaoFighting/Swin-Unet首个基于纯Transformer的U-Net形的医学图像分割网络,其中利用Swin Transforme
    一个年过古稀的老中医讲的故事。     说是若干年前,曾任周恩来总理的保健医生、后来做了全国人大的副委员长的吴阶平先生,某一日就教于我国航天事业的奠基人、两弹一星的元勋钱学森先生关于医学分类的问题。钱老谦虚过后,提出如下理论:我个人的看法,医学应该由四大类组成。首先是预防医学,其次是治疗医学,然后是康复医学,最后,钱老说,还应该
原创 2011-06-28 22:54:56
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今天将分享医学量化挑战中不确定性的完整实现过程,为了方便大家学习理解整个流程,将整个流程步骤进行了整理,并给出详细的步骤结果。感兴趣的朋友赶紧动手试一试吧。
原创 2022-07-21 10:44:02
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算法实现:基于Trie树结构实现高效的词图扫描,生成句子中汉字所有可能成词情况所构成的有向无环图(DAG) 采用了动态规划查找最大概率路径, 找出基于词频的最大切分组合 对于未登录词,采用了基于汉字成词能力的HMM模型,使用了Viterbi算法支持三种分词模式:    a,精确模式,试图将句子最精确地切开,适合文本分析;  &n
转载 2023-09-09 22:12:45
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nnFormer在多个数据集上的分割性能显著,本节内容旨
原创 2023-06-14 21:35:24
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基于形态学的图像分割在形态学中,可以利用顶帽变换和底帽变换加上二值化阈值,来进行图像的分割。设计思路顶帽变换和底帽变换图像相减与开操作和闭操作相结合,可产生所谓的顶帽变换和底帽变换。 灰度级图像 f 的顶帽变换定义为 f 减去其开操作。 灰度级图像f的底帽变换定义为其闭操作减去f。这些变换的主要应用之一是:用一个结构元通过开操作或闭操作从一幅图像中删除物体; 然后,差操作得到一幅仅保留已删除分量的
创建日期: 2020-03-03 16:35:29定了图像语义分割这个方向大概有半年多了,具体研究课题方向是基于深度学习的医学图像分割。这里作一个简要的阶段性小结。一、医学图像的突出特征总体上来说,医学图像相比于自然图像(通过可见光成像)有以下四点区别:1、医学图像的模态(格式)更加多样化,如X-ray、CT、MRI以及超声等等,当然也包括一些常见的RGB图像(如眼底视网膜图像)。不同模态图像反应
一、血管造影技术1.1、数字减影血管造影(DSA) 相比于其他常规造影技术成像的图像,整体血管结构更加清晰、直观,背景噪声较少,对于一些精细血管都能较为准确的显示。特别适用于大血管的检查,对冠状动脉也是最好的成像方法之一。1.2、基于超声的经颅多普勒成像(TCD) 能够测量相当重要的血液动力学信息。1.3、磁共振血管造影(MRA) 图像清晰,血管的细微结构显示好、空间分辨率高,但是细小血管的灰度与
今天要讲的模型属于深度学习(准确地说应该是卷积神经网络)在医学图像领域的应用,主要参考了一篇2015年的paper《U-Net: Convolutional Networks for Biomedical Image Segmentation》,正好通过这篇paper的学习来了解一下深度学习到底在图像问题领域是怎样运作的。我之前接触过简单的深度学习在图像领域的应用,就是对于手写数字1-9的识别,本
数据集格式:labelme格式(不包含mask文件,仅仅包含jpg图片和对应的json文件)图片数量(jpg文件个数):4099标注数量(json文件个数):4099标注类别数:2标注类别名称:["Kidney","Tumor"]数据集编号:mbd.pub/o/bread/Z5yalZtp每个类别标注的框数:Kidney count = 7551Tumor count = 4488使用标注工具:l
原创 10月前
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数据集格式:labelme格式(不包含mask文件,仅仅包含jpg图片和对应的json文件)图片数量(jpg文件个数):359标注数量(json文件个数):359标注类别数:1标注类别名称:["kidney stone"]数据集编号:mbd.pub/o/bread/Z5yalZtt每个类别标注的框数:kidney stone count = 512使用标注工具:labelme=5.5.0标注规则:
原创 10月前
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tensorflow版使用uNet进行医学图像分割(Skin数据集)深度学习、计算机视觉学习笔记、医学图像分割、uNet、Skin皮肤数据集 tensorflow版使用uNet进行医学图像分割(Skin数据集)实验环境skin皮肤数据集一、uNet模型二、实验过程1. 加载skin皮肤数据集2. 定义uNet模型3. 训练4. 预测5. 结果可视化三、总结 实验环境python、tensorflo
 留给Transformer + U-Net 组合命名的缩写不多了... 本来是打算继续肝CVPR 2021的垂直方向大盘点工作,之前已经推送了Transformer、目标检测、语义分割和OCR的盘点。但这几天看到越来越多的视觉Transformer工作,特别是Transformer在医学图像上的应用。 实际上这波热潮,从年初就开始了,比如非常具有代表性的:Trans
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