目录预读内容分子的表示分子指纹FingerpointSMILESInChIKeyGraph药物与靶标的相互作用预测读写分子操作分子修改分子处理2D分子指纹和相似性 RDKit 是一个常用的生物化学信息python工具包。它提供了大量对化学分子2D或3D的计算操作，可生成用于机器学习的分子描述符，以及提供其他更强大的功能； RDKit的安装可以使用Conda完成：conda install -c
一、介绍requests是Python的一个HTTP客户端库，跟urllib，urllib2类似，不过requests的优势在于使用简单，相同一个功能，用requests实现起来代码量要少很多。毕竟官方文档都很直白的说：python的标准库urllib2提供了大部分需要的HTTP功能，但是API太逆天了，一个简单的功能就需要一大堆代码。所以，使用requests方便的多。二、下载安装注：没有配置好
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2023-07-03 23:23:02
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## 用RDKit进行药物分析的入门指南
![RDKit Logo](
RDKit 是一个用于化学信息学的开源软件包，它提供了一系列功能强大的工具，用于药物设计、化学信息处理和分析等。然而，在使用RDKit时，有时会遇到 "No module named IPython rdkit" 的错误。本文将介绍 RDKit 的基本概念和用法，并提供解决 "No module named IPython
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2023-09-02 05:56:13
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笔者很早就有在Markdown编辑器中引入化学结构式绘制的想法。本着不自己造轮子的想法，我在GitHub上找到了一个成熟的JavaScript化学式绘制器RDKit.js，也尝试了用JavaScript去调用它。首先电脑上需要安装node.js以及包管理器npm。安装完成后命令行运行：npm i @rdkit/rdkit -g全局安装RDKit.js包。安装后再node.js的安装目录下找到nod
1.1 Python语言简介Python 是一种面向对象、解释型计算机程序设计语言，由荷兰人Guido van Rossum 于1989年底发明，第一个公开发行版发行于1991年，Python 源代码同样遵循 GPL(GNU GGeneral Public License)协议。Python 语法简洁而清晰，具有丰富和强大的类库。它常被昵称为胶水语言，能够把用其他语言制作的各种模块（尤其是C/C+
U盘安装Ubuntu 16.04 教程（安装全过程，不包含下载）官网：cn.ubuntu/下载连接：位：http://releases.ubuntu/16.04/ubuntu-16.04-desktop-amd.iso32位：http://releases.ubuntu/16.04/ubuntu-16.04-desktop-i386.iso
Vim 安装及其基本操作1.更新安装源sudo apt-get update2.安装vimsudo apt-get install vim基本操作1、esc返回normal界面。2、 按i进入编辑界面。3、按：进入命令界面。:q，提示用户该文件被修改后没有保存，然后Vi并不退出，继续等待用户命令。:q!，强制退出，vim放弃所作修改而直接推到shell下。:wq，保存且退出。4、在vim
quagga安装刚开始接触，关于quagga中的基础知识，后续补充。安装过程1.首先下载quagga源码，这里我选择的是1.2.4版本。下载后，解压到相应文件夹，进入该文件夹。$ cd quagga-1.2.4接下来三步走： configure make make install$ ./configure --enable-vtysh --enable-user=root --enable-gro
ubuntu16.04.1下安装KDE环境首先，打开终端，输入sudo apt-get install kubuntu-desktop终端提示要下载280MB左右的文件，遇到提示时全部选“Y”，接下来是长时间的等待（取决于你的带宽情况，毕竟要下载280MB左右的文件）。接下来自动配置。。。安装好后，注销一下，在登陆窗的“会话”中选择KDE，登陆后就是变成KDE了。（如果想回到ubuntu的话，可以
其实很简单： sudo apt-get install vim遇见Y/n按y见按回车就OK了
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2023-07-08 15:20:23
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Ubuntu安装wine一般使用两种方式，源码编译或者从网络源安装。 源码编译安装相对比较稳定，速度快、效率高，但是需要时间编译，相比一分钟的源安装，几十分钟的编译确实很长。源安装是别人已经帮你编译好的了，但是安装 以后出现各钟奇怪问题的几率较高。一般来说是这样，所以还是编译安装比较好。 编译安装最让人头痛的是解决包的依赖性问题。安装wine你需要安装下面的包，只要你的ubuntu能够
文章目录安装vim配置vimvim的三种模式使用1.vim 打开文件2.普通模式 —> 插入模式3.普通模式下的命令4.命令模式的命令5.查看文件内容 查看文件内容时尽量不要用vim6.异常终止了再次打开时会报错 安装vim使用命令$ sudo apt-get install vim 来安装vim，安装后的vim需要进行一些配置，不然使用起来会有些不方便，比如不会自动缩进。配置vim使用命令
1. 下载安装包： https://www.anaconda.com/products/distribution#Downloads 通过 scp ~/Downloads/--- g8: ~/ 把下载在本地的安装包上传到服务器g8节点2. 在当前路径下，执行命
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2023-07-24 11:06:18
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Ubuntu 18.04， 安装方式目前孤知道的Ubuntu下安装软件方式有3种（命令）：1.make2.apt/apt-get3.dpkg 方式1基于软件源码安装，需要经历配置（可选）、编译、安装，获取源码可以直接从软件官网下载，或者，使用wget命令下载；方式2可以安装Ubuntu的软件源（sources）中的软件，在配置文件/etc/apt/sources.list中有定
目录一、安装CUDA二、安装cudnn三、安装Anaconda四、安装tensorflow-gpu五、参考链接 一、安装CUDA1、前往官网下载符合自己系统版本的CUDA（CUDA版本根据自己需求选择，我这里下载的CUDA10.0版本）2，打开终端进入到CUDA安装文件所在文件夹，赋予其可执行权利sudo chmod +x cuda_10.0.130_410.48_linux.run3、安装C
前言：apt-get在安装大多数包时是没有问题的，但有些时候用apt-get命令安装包出现错误提示如：the following packages have unmet dependencies（下列软件包存在未满足的依赖关系），通常可以采取更新软件源的方法，这样一般可以解决大多数软件包安装问题，但是有些疑难的包依赖问题仅凭这个方法是解决不了的就需要使用aptitude深入解决了。平台环境：ubu
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2023-09-16 14:29:01
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安装VirtualBox 选择安装位置 默认勾选所有，下一步 不用管警告，选择Yes 等待安装完成。VirtualBox创建虚拟电脑安装好VirtualBox后，点击管理—>选择全局设定 把默认虚拟位置配置好，这里创建到D:\VirtualBoxVMS 点击“新建” 输入名称为Ubuntu20.04_64，选择系统类型为Linux，版本为Ubuntu(64-bit)，点击下一步 设置内存大小
文章目录主要内容安装并设置 mysql安装 mysql设置 mysql首次登录数据库配置远程访问修改配置文件mysql 授予权限重启 mysql测试远程访问建立访问连接workbench 访问workbench 增删查改参考 主要内容本文主要是实现在虚拟机 Ubuntu 18.04 成功安装 MySQL 5.7，并实现远程访问功能，以 windows 下的 workbench 作为客户端访问虚拟
1.点击新建虚拟机2.点击下一步3.选择稍后安装操作系统4.客户机操作系统选择Linux，版本根据自己下载的ISO映像选择,我的是Ubuntu 64位5.虚拟机名称可以自己填，此处就根据上一步骤的选项默认为Ubuntu 64位。位置自定义。6.单个文件的优点是在磁盘内容相对稳定时，其访问速度相对会快一点，但是如果虚拟磁盘增长很快，或容量变化很大，可能会产生大量碎片，性能下降会很明显。另一个缺点是如
文章目录一 安装拼音1.1 安装依赖1.2 安装与设置二、安装国内版firefox2.1 安装包下载2.2 安装2.3 登录账户同步标签三、安装WPS3.1 下载WPS3.2 安装WPS3.3 运行WPS 一 安装拼音1.1 安装依赖为防止安装汉语包时候报错要先打开终端安装依赖sudo apt-get install -f#安装依赖1.2 安装与设置右上角电源位置，打开“system setin
