一、介绍requests是Python的一个HTTP客户端,跟urllib,urllib2类似,不过requests的优势在于使用简单,相同一个功能,用requests实现起来代码量要少很多。毕竟官方文档都很直白的说:python的标准urllib2提供了大部分需要的HTTP功能,但是API太逆天了,一个简单的功能就需要一大堆代码。所以,使用requests方便的多。二、下载安装注:没有配置好
转载 2023-07-03 23:23:02
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目录预读内容分子的表示分子指纹FingerpointSMILESInChIKeyGraph药物与靶标的相互作用预测读写分子操作分子修改分子处理2D分子指纹和相似性 RDKit 是一个常用的生物化学信息python工具包。它提供了大量对化学分子2D或3D的计算操作,可生成用于机器学习的分子描述符,以及提供其他更强大的功能; RDKit安装可以使用Conda完成:conda install -c
转载 2024-07-01 00:24:15
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# 如何用Python下载安装RDKit **引言** RDKit是一个用于化学信息学和计算化学的开源软件工具,它为化学研究人员提供了强大的化学分子处理和分析功能。对于刚入行的开发者来说,安装RDKit可能有些困难。本文将为你提供一个详细的安装步骤以及相关的代码示例,帮助你顺利完成这项任务。 ## 整体流程 以下是安装RDKit的基本步骤: | 步骤 | 操作
原创 9月前
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# 使用RDKit进行化学信息学分析 在化学信息学领域,RDKit是一个非常知名的开源工具,它为分子结构的表示、化学性质的计算及数据处理提供了强大的功能。然而,在安装成功后,许多用户可能会遇到在Python环境中无法正常使用的问题。本文将探讨RDKit的使用及其常见问题,并给出相应的解决方案和代码示例。 ## RDKit安装及使用 首先,我们需要确保RDKit安装成功。通常我们使用con
原创 11月前
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1.1 Python语言简介Python 是一种面向对象、解释型计算机程序设计语言,由荷兰人Guido van Rossum 于1989年底发明,第一个公开发行版发行于1991年,Python 源代码同样遵循 GPL(GNU GGeneral Public License)协议。Python 语法简洁而清晰,具有丰富和强大的类。它常被昵称为胶水语言,能够把用其他语言制作的各种模块(尤其是C/C+
转载 2023-09-28 14:21:52
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## 用RDKit进行药物分析的入门指南 ![RDKit Logo]( RDKit 是一个用于化学信息学的开源软件包,它提供了一系列功能强大的工具,用于药物设计、化学信息处理和分析等。然而,在使用RDKit时,有时会遇到 "No module named IPython rdkit" 的错误。本文将介绍 RDKit 的基本概念和用法,并提供解决 "No module named IPython
原创 2023-09-02 05:56:13
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笔者很早就有在Markdown编辑器中引入化学结构式绘制的想法。本着不自己造轮子的想法,我在GitHub上找到了一个成熟的JavaScript化学式绘制器RDKit.js,也尝试了用JavaScript去调用它。首先电脑上需要安装node.js以及包管理器npm。安装完成后命令行运行:npm i @rdkit/rdkit -g全局安装RDKit.js包。安装后再node.js的安装目录下找到nod
原创 2024-05-21 19:57:41
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前言:在使用pycharm学习python的时候,经常需要第三方,没有第三方程序就会报错,pycharm也会提醒你要安装所需要的安装第三方的时候往往就出现了问题,如图; 下面我将谈谈一些我遇到的问题及解决经验。1.检查pip是否为最新版本pip不是最新版本时,会直接导致你安装第三方失败。解决方法:第一,看是否直接在 pycharm的setting里面Project下的Project I
转载 2023-08-10 22:09:59
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本次主要记录在学习python过程中,学习了安装第三方的三种方法,以及在新建一个project项目时,选择已安装好的第三方。首先,先记录python学习中安装第三方的第一种方法:通过pycharm中的setting进行安装,如图所示:1、选择file-->settings                &n
转载 2023-05-17 21:11:56
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Python 是一门优雅的语言,简洁的语法,强大的功能。当然丰富的第三方,更能加速开发。那么问题来了,如何安装这些第三方(包)呢?安装第三方的方式其实不多。下面就介绍一些技巧。源码安装很多第三方都是开源的,几乎都可以在github 或者 pypi上找到源码。找到源码格式大概都是 zip 、 tar.zip、 tar.bz2格式的压缩包。解压这些包,进入解压好的文件夹,通常会看见一个 set
学习目的:         爬虫有请求(request、selenium)、解析、存储(MongoDB、Redis)、工具,此节学习安装常用安装正式步骤Step1:urllib和re这两个安装Python中,会默认安装,下面代码示例调用:>>> import urllib >&
转载 2023-08-10 06:39:42
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Python安装方法Python的解释器CPython是开源的,我们可以下载查看其源代码,同时,Python语言的各种也都是开源的。利用Python语言编程,可用的有很多,在Python官方的索引PyPI页面(http://pypi.python.org)可以看到,截止目前(2017年2月)已经有99737个了。这些覆盖了信息技术各个方面,Python的编程就是调用各种编程,全
转载 2023-08-21 15:46:23
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标签:各位志同道合的同仁请点击上方关注本教程是基于Python语言的深入学习。本次主要介绍MySql数据软件的安装。不限制语言语法,对MySql数据安装有疑惑的各位同仁都可以查看一下。数据的应用在软件开发领域是重重之重。大量数据和配置被保存在数据中以被使用。如果想开发一套软件系统与数据是分不开的。发展到现在,各类数据应需求而生:关系型与非关系型、单机与分布式、文件型内存型等等。对于关系
方法一:需要在网络条件下安装win+R进入运行框输入命令cmd点击确定进入普通下载:pip install 模块名字例如:输入pip install pygame        pip install numpypip install xlwt-----xlwt代表需要安装所需包和等列出安装版本:pip list 和pip freeze
转载 2023-07-03 22:53:38
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来说先说爬虫的原理:爬虫本质上是模拟人浏览信息的过程,只不过他通过计算机来达到快速抓取筛选信息的目的所以我们想要写一个爬虫,最基本的就是要将我们需要抓取信息的网页原原本本的抓取下来。这个时候就要用到请求了。requests安装requests本质上就是模拟了我们用浏览器打开一个网页,发起请求是的动作。它能够迅速的把请求的html源文件保存到本地安装的方式非常简单:我们用PIP工具在命令行里
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python3.7安装学术版cplex解析器下载地址https://pan.baidu.com/s/1tNpbzAU0fLi29MMX3EbwPQ?pwd=wt12 提取码:wt12 关于windows的.exe1.直接点击执行即可关于linux的.bin1.在当前用户目录下创建目录cplexmkdir cplex2.上传cplex_studio2210.linux_x86_64.bi
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因预处理医学图像数据需要用到以下的Python SimpleITK;Anaconda;PIL (Python Imaging Library),故重新安装Python和第三方。 一、安装Python去官网:https://www.python.org/downloads/ 下载相应版本。 双击下载的安装包,安装过程需要注意修改添加程序到环境变量。 二、 Anaconda科学计算包Pytho
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在用Python开发时(Windows环境),会碰到需要安装某个版本的第三方,为了以后查找、安装方便,总结如下:一、打开cmd二、将cmd当前目录切换到Downloads,命令为cd Downloads三、在文章开头链接地址下载所需第三方,以SciPy为例:0.18.1是版本号;cp27、cp35分别对应Python2.7、Python3.5;win32、win_amd64对应操作系统是32
PIL(Python Imaging Library)是Python中一个强大的图像处理,但目前其只支持到Python2.7pillow是PIL的一个分支,虽是分支但是其与PIL同样也具有很强的图像处理Python3.7.0 如何安装pillow此安装方法在windows7环境下完成:>>>win+r调出运行窗口,键入cmd弹出命令窗口>>>此处需要键入命
简介最近在看GCN的内容, 里面会用到关于一些网络结构. 在处理数据的时候就会使用到NetworkX这个, 在这里简单介绍一下相关的内容. 自己也是用到多少就记录多少, 会不断进行补充的.参考资料图的一些操作创建一个图我们首先创建一个空的图, 没有nodes和edges.import networkx as nx G = nx.Graph()添加节点与添加边接着我们向上面的图中添加node和ed
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