目录预读内容分子的表示分子指纹FingerpointSMILESInChIKeyGraph药物与靶标的相互作用预测读写分子操作分子修改分子处理2D分子指纹和相似性 RDKit 是一个常用的生物化学信息python工具包。它提供了大量对化学分子2D或3D的计算操作,可生成用于机器学习的分子描述符,以及提供其他更强大的功能; RDKit的安装可以使用Conda完成:conda install -c
转载 2024-07-01 00:24:15
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# 使用RDKit进行化学信息学分析 在化学信息学领域,RDKit是一个非常知名的开源工具库,它为分子结构的表示、化学性质的计算及数据处理提供了强大的功能。然而,在安装成功后,许多用户可能会遇到在Python环境中无法正常使用的问题。本文将探讨RDKit的使用及其常见问题,并给出相应的解决方案和代码示例。 ## RDKit安装及使用 首先,我们需要确保RDKit的安装成功。通常我们使用con
原创 11月前
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# 如何用Python下载安装RDKit **引言** RDKit是一个用于化学信息学和计算化学的开源软件工具,它为化学研究人员提供了强大的化学分子处理和分析功能。对于刚入行的开发者来说,安装RDKit可能有些困难。本文将为你提供一个详细的安装步骤以及相关的代码示例,帮助你顺利完成这项任务。 ## 整体流程 以下是安装RDKit的基本步骤: | 步骤 | 操作
原创 9月前
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1.1 Python语言简介Python 是一种面向对象、解释型计算机程序设计语言,由荷兰人Guido van Rossum 于1989年底发明,第一个公开发行版发行于1991年,Python 源代码同样遵循 GPL(GNU GGeneral Public License)协议。Python 语法简洁而清晰,具有丰富和强大的类库。它常被昵称为胶水语言,能够把用其他语言制作的各种模块(尤其是C/C+
转载 2023-09-28 14:21:52
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## 用RDKit进行药物分析的入门指南 ![RDKit Logo]( RDKit 是一个用于化学信息学的开源软件包,它提供了一系列功能强大的工具,用于药物设计、化学信息处理和分析等。然而,在使用RDKit时,有时会遇到 "No module named IPython rdkit" 的错误。本文将介绍 RDKit 的基本概念和用法,并提供解决 "No module named IPython
原创 2023-09-02 05:56:13
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一、介绍requests是Python的一个HTTP客户端库,跟urllib,urllib2类似,不过requests的优势在于使用简单,相同一个功能,用requests实现起来代码量要少很多。毕竟官方文档都很直白的说:python的标准库urllib2提供了大部分需要的HTTP功能,但是API太逆天了,一个简单的功能就需要一大堆代码。所以,使用requests方便的多。二、下载安装注:没有配置好
转载 2023-07-03 23:23:02
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笔者很早就有在Markdown编辑器中引入化学结构式绘制的想法。本着不自己造轮子的想法,我在GitHub上找到了一个成熟的JavaScript化学式绘制器RDKit.js,也尝试了用JavaScript去调用它。首先电脑上需要安装node.js以及包管理器npm。安装完成后命令行运行:npm i @rdkit/rdkit -g全局安装RDKit.js包。安装后再node.js的安装目录下找到nod
原创 2024-05-21 19:57:41
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化学分子溶解度预测模型(Rdkit构建)
原创 精选 2021-06-17 09:55:16
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目录一、软件安装二、七种基本数据类型的变量定义三、tuple定义的两种方式四、定义一个元素的元组五、定义空元组的两种方式六、tuple类型的两个操作方法的使用(data.count和data.index)一、软件安装1、下载完成后双击执行 python-3.9.0-amd64.exe 程序,进入安装界面。2、自定义安装路径选项下的 “Add Python  3.9  to PA
安装python之前,可以看一下python2与python3的区别:点击链接 Window 平台安装 Python:Python下载地址:https://www.python.org/downloads/windows/ Python3:Python2:以下教程Python2为例:环境变量配置方法一:在环境变量中添加Python目录:win+R 输入cmd回车进入命令窗口: 在命令提
文章目录前言 一、安装python运行环境  1.官网https://www.python.org下载安装包.exe  2.安装python 二、python模块下载  1.配置pip环境变量  2.下载python模块 二、python模块下载 三、第一个python脚本运行 四、相关命令 总结前言之前刷博客看到一个很好玩的python脚本,正好今日闲来无事打算跑起来看看效果,然后开始找pyth
转载 2023-07-04 17:20:41
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 怎么能快速地掌握Python?这是和朋友闲聊时谈起的问题。Python包含的内容很多,加上各种标准库、拓展库,乱花渐欲迷人眼。我一直希望写一个快速的、容易上手的Python教程,而且言语简洁,循序渐进,让没有背景的读者也可以从基础开始学习。我将在每一篇中专注
转载 2021-07-18 13:38:21
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Python基础教程(入门教程),30分钟玩转Python编程!这是一篇针对初学者的 Python 基础教程,只要你认真阅读,花费 30 分钟即可快速了解 Python。这篇 Python 入门教程讲解的知识点包括:Python 编程环境的搭建、Python 基本操作入门、Python 数据类型、Python 语句和函数。Python环境下载和配置根据 Windows 版本(64位/32位)从 P
转载 2023-09-12 22:18:51
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主题:Python基础教程作者:阿木又 ?亲爱的朋友们,欢迎来到“ESRG技录橙”。 目录安装 Python基础语法1.输出2.注释3.变量4.运算符5.数据类型6.控制流程7.函数 Python 是一种高级编程语言,具有简单、易学、可读性强等特点,被广泛应用于 Web 开发、数据科学、人工智能等领域。本文将介绍 Python 的基础语法、数据类型、流程控制和函数、模块、文件操作内容
转载 2023-08-05 22:03:13
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Python3 错误和异常作为 Python 初学者,在刚学习 Python 编程时,经常会看到一些报错信息,在前面我们没有提及,这章节我们会专门介绍。Python 有两种错误很容易辨认:语法错误和异常。Python assert(断言)用于判断一个表达式,在表达式条件为 false 的时候触发异常。语法错误Python 的语法错误或者称之为解析错,是初学者经常碰到的,如下实例>>&g
列表方法list.append(x):把一个元素添加到列表的结尾,相当于 a[len(a):] = [x]。list.extend(L):通过添加指定列表的所有元素来扩充列表,相当于 a[len(a):] = L。list.insert(i, x):在指定位置插入一个元素。第一个参数是准备插入到其前面的那个元素的索引,例如 a.insert(0, x) 会插入到整个列表之前,而 a.insert(
转载 2024-05-18 07:00:59
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给大家整理的这套python学习路线图,按照此教程一步步的学习来,肯定会对python有更深刻的认识。或许可以喜欢上python这个易学,精简,开源的语言。此套教程,不但有视频教程,还有源码分享,让大家能真正打开python的大门,进入这个领域。现在互联网巨头,都已经转投到人工智能领域,而人工智能最好的编程语言就是python,未来前景显而易见。黑马程序员是国内最早开设人工智能的机构。一、首先先推
原创 2017-07-21 16:10:26
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python的安装与使用 python是面向对象的脚本语言 优点:简单易学、免费开源、可移植性强 技术领域:数据科学、机器学习、web开发 广泛作为变成教学语言所使用一、python安装和运行 64为win10系统为例: python官网找到64为win10对应的安装包下载并安装:https://www.python.org/downloads/release/python-3105/运行安装程序
文章目录一、下载安装二、python下载安装三、上配置python四、配置镜像源让你下载嗖嗖的快4.1)内部配置4.2)手动添加镜像源4.3)永久配置镜像源五、插件安装(比如汉化?)5.1)自动补码第一款5.2 )自动补码第二款5.2)汉化5.3)其它插件六、美女背景七、自定义开头八、即将开始写代码了!九、python入门十、py
这个项目主要包括两部分内容:一是各种算法的基本原理讲解,二是各种算法的代码实现。传送门在此:https://github.com/TheAlgorithms/Python算法的基本原理讲解部分,包括排序算法、搜索算法、插值算法、跳跃搜索算法、快速选择算法、禁忌搜索算法、加密算法等。这部分内容,主要介绍各种不同算法的原理,其中不少介绍还给出了动态示意图,以更初学者能够更直观的理解。搬运几个示例:鸡尾
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