一篇让你完全够用TS的指南
大家好，我叫小杜杜，是一个喜欢动手敲代码的小菜鸟，我认为代码应该亲自敲一遍，才能更好的熟记于心，作为一个程序员，我们与自己的小伙伴共同开发、维护于一个项目，需要保持代码的整洁、清晰，使组内的任意一位小伙伴都能快速理解每一代码模块，因此制定了各种各样的规则，去约束我们写代码，只有这样才能我们的代码更加具有可读性、可维护性和健壮性我们用什么去管理自己的项目，
1.R 程序下载： http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/ 下载相应版本，直接默认安装即可。 安装完成之后就有了基础的R系统，其中包括一些基础的功能如总结数据、绘图等。但是R真正有用的地方在于有许多附加的程序包，它们能将基础功能扩展至不同领域。从清洗数据、绘图到分析数据、创建交互式应用等一切事物。 2. 安装程序包 打开R程序，在提示符后面输入： a <-
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2024-02-06 20:52:32
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&nbs
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2024-05-05 09:34:34
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R语言是开源的，同时可以运行在各种平台上（Linux、Windows、MacOS等）。R的许多软件包是由R语言、 LaTeX、Java及最常用C语言和Fortran撰写。本篇为大家介绍的是R语言日期格式数据。#日期型数据 在R中自带的日期形式为：as.Date();以数值形式存储； 对于规则的格式，则不需要用format指定格式；如果输入的格式不规则，可以通过format指定的格式读入； 标准格式
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2023-08-31 15:03:28
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本文主要向大家介绍了MySQL数据库之教你如何用R包TCGA-Assembler下载TCGA数据 ，通过具体的内容向大家展现，希望对大家学习MySQL数据库有所帮助。今天师兄发给我一个TCGA网址，让我想办法把胰腺癌的所有RNA-Seq数据下载下来，可是界面是这样的：这么多样本有各自的测序数据，甲基化数据，突变数据和临床数据等，不可能一个个去点开下载，那么批量下载就可以借助R的一个包TCGA-As
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2024-01-12 11:47:57
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Lasso回归又称为套索回归，是Robert Tibshirani于1996年提出的一种新的变量选择技术。Lasso是一种收缩估计方法，其基本思想是在回归系数的绝对值之和小于一个常数的约束条件下，使残差平方和最小化，从而能够产生某些严格等于0的回归系数，进一步得到可以解释的模型。R语言中有多个包可以实现Lasso回归，这里使用lars包实现。1.利用lars函数实现lasso回归并可视化显示x =
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2023-09-26 17:54:02
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前言 最近想试一下捣腾一个 R 包出来，故参考了一些教程。现在看到的最好的就是谢益辉大大之前写过的开发R程序包之忍者篇，以及 Hadley 大神（ggplot2 devtools 等一系列包的作者）的 教程。但是前者有一些过时，后者是全英文的，所以我这里记录一下比较简单的过程，给读者们一个参考思路。如果你有一些 R 程序，想塞到去一个自创的 R 包中，那么这篇文章就可能是你想要的。为了方
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2023-09-02 15:12:54
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（课程视频链接：https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?p=1）1.R语言 R语言是S语言的一种实现。R是一个全面的统计研究平台，提供了各式各样的数据分析技术，拥有顶尖的绘图功能。 R
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2023-10-30 21:30:41
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决策树模型
是一种简单易用的非参数分类器。它不需要对数据有任何的先验假设，计算速度较快，结果容易解释，而且稳健性强，不怕噪声数据和缺失数据。决策树模型的基本计算步骤如下：先从n个自变量中挑选一个，寻找最佳分割点，将数据划分为两组。针对分组后数据，将上述步骤重复下去，直到满足某种条件。
在决策树建模中需要解决的重要问题有三个：
如何选择自变量 如何选择分割点 确定停止划分的条件在 R语言 中
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2023-08-07 10:10:14
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R包glmnet是通过惩罚最大似然法拟合广义线性和类似模型的软件包。1. 加载包和数据#install.packages("glmnet", repos = "https://cran.us.r-project.org")
library(glmnet)
ls("package:glmnet")
# x = matrix(rnorm(100 * 20), 100, 20)*10
# y = r
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2023-10-30 21:31:38
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注：以下内容是我个人翻译自Rstudio官网的Shiny教程http://shiny.rstudio.com/articles/basics.html水平有限，敬请谅解在开始之前，先简单介绍一下Shiny框架，以下内容引用于百度百科：‘Shiny是R中的一种Web开发框架，使得R的使用者不必太了解css、js只需要了解一些html的知识就可以快速完成web开发，且shiny包集成了bo
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2023-10-30 21:34:27
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使用readr进行数据导入导入数据的方法有很多，相信大家也已经有了自己习惯的方法，所以本节的内容只是给大家提供一个选择。所谓技多不压身！本节较多理论性的东西，大家也可以酌情跳过！7.1 简介本章将学习如何将纯文本格式的矩形文件读入 R。虽然本章内容只是数据导入的冰山一角，但其中的原则完全适用于其他类型的数据。本章末尾将提供 一些有用的 R 包，以处理其他类型的数据。7.2 入门readr 的多数函
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2024-08-16 10:06:18
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shiny包学习笔记（一）认识shiny第一个例子（01_hello）认识shiny APP的构成用户界面 （ui）服务器功能 （server）shinyApp函数 认识shinyshiny是一个R的软件包，它使得直接从R构建交互式web app更加简单。 shiny包中有11个例子，可以非常形象直观地解释shiny的工作方式。第一个例子（01_hello）认识shiny APP的构成shiny
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2023-08-06 20:02:21
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1. stringr介绍stringr包被定义为一致的、简单易用的字符串工具集。所有的函数和参数定义都具有一致性，比如，用相同的方法进行NA处理和0长度的向量处理。字符串处理虽然不是R语言中最主要的功能，却也是必不可少的，数据清洗、可视化等的操作都会用到。对于R语言本身的base包提供的字符串基础函数，随着时间的积累，已经变得很多地方不一致，不规范的命名，不标准的参数定义，很难看一眼就上手使用。字
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2023-10-17 08:48:18
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DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析，主要也是用于RNA-Seq数据，同样也可以处理类似的ChIP-Seq,shRNA以及质谱数据。这两个都属于R包，其相同点在于都是对count data数据进行处理，都是基于负二项分布模型。因此会发现，用两者处理同一组数据，最后在相同阈值下筛选出的大部分基因都是一样的，但是有一部分不同应该是由于其估计离散度的不同方法所导致的。 ### DESeq2
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2023-12-11 12:46:12
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上一篇博客（R中两种常用并行方法——1. parallel）中已经介绍了R中常见的一种并行包：parallel，其有着简单便捷等优势，其实缺点也是非常明显，就是很不稳定。很多时候我们将大量的计算任务挂到服务器上进行运行时，更看重的是其稳定性。这时就要介绍R中的另一个并行利器——snowfall，这也是在平时做模拟时用的最多的一种方法。针对上篇中的简单例子首先是一个最简单的并行的例子，这个例子不需要
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2023-11-29 09:55:27
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本文集锦了R语言学习中需要用到的知识。可以作为入门了解之用，细节部分本文不做详解R语言介绍2、Rstools及package管理目前常用安装包的方式用三种：分为CRAN中的包/生物信息学相关包/GitHub里面的包#CRAN中的包
#install.packages() 安装包
#生物信息学相关Bioconductor
#install.packages('BiocManger')
#BiocMa
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2023-08-12 15:04:31
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R包的安装R语言的特点就是有众多的第三方扩展包，扩展包涉及到各行各业的数据分析内容。包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合，包括R程序，运行该程序的其他语言(例如C语言)，解释这个程序功能、方法的帮助文档，例子、测试数据等。R自带了一系列默认包，包括base、datasets、utils、graDevices、graphics、stats以及methods。这些包提供了很多的默
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2023-06-20 14:26:00
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文章目录包检查可用R语言的包1. 获取包含R包的库位置2. 获取已安装的所有软件包列表3. 获取当前在R环境中加载的所有包4. 安装一个新的软件包有两种方法安装：5. 加载包到当前R环境6. 卸载包包R语言的包是R函数，编译代码和样本数据的集合。 它们存储在R语言环境中名为“library”的目录下。默认情况下，R语言在安装期间安装一组软件包。 随后添加更多包，当它们用于某些特定目的时。 当我们启
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2023-05-18 22:26:36
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[更新~] Python网络爬虫与文本数据分析dplyr简介dplyr是R语言的数据分析包，很像python中的pandas，能对dataframe类型的数据做很方便的数据处理和分析操作。最初我也很奇怪dplyr这个奇怪的名字，我查到其中一种解释d代表dataframeplyr是英文钳子plier的谐音library(tidyverse)## ── Attaching packages ─────
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2024-08-02 22:36:37
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