# R语言中计数命令及其可视化 R语言一种非常强大统计分析和数据可视化工具。它不仅提供了丰富统计分析功能,还能通过多种方式将结果可视化,使得数据分析理解和呈现更加直观。本文将介绍R语言中计数相关命令,并通过示例展示如何生成饼状图和旅行图。 ## 计数命令介绍 在R语言中,常用计数命令主要有`table()`、`count()`(来自`dplyr`包)和`xtabs()`等。其
真的实践出真知啊,很多小细节问题,平时自己作图时候也没有注意过,更没有思考过。最近小伙伴找作图,在小伙伴仔细琢磨下,也是发现了平时没有注意小问题,这里提示下,希望对你学习有帮助。示例数据我们使用批量箱线图(复现《nature communications》图表(二):一劳永逸,R语言一键画表达量箱线图并添加显著性),数据代码在我们QQ群文件,这里不再说明。首先还是按照之前帖子我们作图
 前言刚开始接触R语言时,会听到各种R语言使用技巧,其中最重要一条就是不要用循环,效率特别低,要用向量计算代替循环计算。那么,这是为什么呢?原因在于R循环操作for和while,都是基于R语言本身来实现,而向量操作基于底层C语言函数实现,从性能上来看,就会有比较明显差距了。那么如何使用C函数来实现向量计算呢,就是要用到apply家族函数,包括apply, sapply
转载 2024-02-28 09:43:50
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在数据分析中,R语言被广泛应用于对数据进行统计分析和可视化。在处理表格数据时,经常会遇到需要对某些类别进行计数问题。本文将详细探讨在R语言中如何实现表格计数,包括不同版本特性对比、迁移指南、兼容性处理、实战案例、性能优化和生态扩展等方面。 ### 版本对比 在R语言不同版本中,新特性和功能增加逐渐改变了表格数据计数方式。下面的表格总结了各版本之间主要特性差异: | 版本
原创 7月前
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# R语言中计算肾功能实践 随着现代医学发展,监测肾功能已成为临床决策重要环节。肾功能评估通常通过一些生化指标来进行,例如血清肌酐(SCr),而这些指标的计算在R语言中非常方便。本文将通过实例介绍如何使用R语言来计算肾功能,并展示相关类图和状态图,帮助读者更好地理解这一过程。 ## 肾功能评价基本概念 在临床实践中,肾功能通常通过估算肾小球滤过率(eGFR)来评估。eGFR
原创 2024-09-14 07:00:50
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1.回归模型评估度量回归模型表现度量方式: RMSE:均方误差平方根 校正R^2:对 原始R^2改进 Cp:在训练集RSS上加上惩罚 AIC和BIC:基于最大似然值,对参数进行惩罚2.分类模型评估度量分类指对给定观测样本预测其所属类别,而且类别空间已知,它是有监督学习。> library(dplyr) > library(randomForest) > libra
# R语言中计算dw值公式 在统计学和经济学中,Durbin-Watson(简称DW)统计量一种衡量时间序列数据中是否存在自相关性指标。它取值范围为0到4之间,其中0表示存在正自相关性,4表示存在负自相关性,而2表示不存在自相关性。 DW统计量计算公式如下: ``` dw = sum((e_t - e_{t-1})^2) / sum(e_t^2) ``` 其中,e_t表示时间序列
原创 2023-10-20 07:04:51
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# 在R语言中计算SNP哈德温伯格平衡 在遗传统计学中,哈德温伯格平衡一个重要概念,用于评估群体中遗传变异状态。计算知识涉及到SNP(单核苷酸多态性)基因型频率。本文将指导您如何使用R语言进行哈德温伯格平衡计算。 ## 流程概述 下面进行该计算基本步骤: | 步骤 | 描述 | |------|------| | 1 | 导入必要包和数据 | | 2 | 计算基因
原创 10月前
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6 Control structure oin R6.1 Introductionif, else: 测试逻辑条件;for: 执行固定次数循环;while: 执行条件为真时循环;repeat: 用于执行无限循环结构;break: 终止并结束循环;next: 跳过循环中迭代;return: 从函数中推出;6.2 If-Elseif-else不同表达方式if(<condition>
R语言中, 绘图边框一共有3个区域
转载 2023-05-26 22:52:13
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R语言小白学习笔记11—字符串操作笔记链接学习笔记11—字符串操作11.1 paste11.2 把格式数据写成串(sprintf)11.3 提取文本11.4 正则表达式总结 笔记链接学习笔记1—R语言基础.学习笔记2—高级数据结构.学习笔记3—R语言读取数据.学习笔记4—统计图.学习笔记5—编写R语言函数和简单控制循环语句.学习笔记6—分组操作.学习笔记7—高效分组操作:dplyr.学习笔记
R语言构建蛋白质网络并实现GN算法目录R语言构建蛋白质网络并实现GN算法1.蛋白质网络构建2.生物网络模块发现方法3.模块发现方法实现和图形展示1) 基于点连接模块发现:cluster_fast_greedy该方法通过直接优化模块度来发现模块。2) GN算法:edge.betweenness.community3) 随机游走:walktrap.community4)Newman快速算法:le
转载 2024-04-26 17:37:47
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在生物信息学领域,计算氨基酸序列距离分析蛋白质之间相似性重要方法。这类计算不仅有助于识别同源蛋白,还能揭示进化关系,并为 biomarkers 发现提供线索。本文将详细记录在 R 语言中实现氨基酸序列距离计算整个过程,包括协议背景、抓包方法、报文结构、交互过程、字段解析和逆向案例。 ### 协议背景 氨基酸序列比较可以追溯到 20 世纪 70 年代,当时技术主要依赖手动比对。在随
原创 7月前
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c()函数:将括号中元素连接起来,并不创建向量paste()函数:连接括号中元素例如c(1, 2:4),结果为1 2 3 4 paste(1, 2:4),结果为“1 2” “1 3” “1 4” c(2, "and"),结果为“2” “and” paste(2, "and"),结果为“2 and”补充:R语言中paste函数参数sep和collapse详解R语言用于拼接字符串函数主要有两个
转载 2023-07-10 12:38:50
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一、独立性检验 根据频数信息判断两类因子彼此相关或相互独立假设检验。
转载 2023-05-24 21:25:40
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# R语言中Proj文件实现指南 ## 一、概述 R语言一个强大统计计算和图形绘制工具,广泛应用于数据分析和数据可视化。在R语言中,Proj文件与项目管理相关重要组成部分。Proj文件通常用于记录和管理项目中各种数据和代码。 ### 二、实现流程 为了更好地理解如何在R语言中处理Proj文件,下面情境基本流程: | 步骤 | 说明
原创 8月前
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R语言卸载已经安装包packages目录R语言卸载已经安装包packagesR语言解决什么问题R语言卸载已经安装包packagesR语言解决什么问题R 一个有着统计分析功能及强大作图功能软件系统,由奥克兰大学统计学系Ross Ihaka 和 Robert Gentleman 共同创立。由于R 受Becker, Chambers & Wilks 创立S 和Suss
  循环函数可以遍历数组或集合中每个成员,可以将结构复杂循环语句用简单函数形式表达出来,可以减少代码量并提高可读性。集算器和R语言都支持循环函数,下面将对比两者用法上异同。1、生成数据  生成1到10之间奇数。  集算器:x=to(1,10).step(2)  代码中,to(1,10)生成了1到10之间连续整数,st
1.1 机器学习分类监督学习:线性回归或逻辑回归,非监督学习:K-均值聚类, 即在数据点集中找出“聚类”。 另一种常用技术叫做主成分分析(PCA) , 用于降维,算法评估方法也不尽相同。 最常用方法将均方根误差(RMSE) 值降到最小, 这一数值用于评价测试集预测结果是否准确。 RMSE评价法会在第7章进行更深入解释。 另一种常用评估方法AUC, 即ROC曲线下面积。&nbs
文章目录综括==apply函数==利用apply函数实现利用循环实现定义一个结果数据框定义for循环利用R特性三种方法消耗时间比较==lapply函数====sapply函数==vapply函数==mapply函数====tapply函数==rapply函数eapply函数 综括apply函数 apply函数最常用代替for循环函数。apply函数可以对矩阵、数据框、数组(二维、多维)
转载 2023-07-06 16:47:22
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