R语言介绍1.R学习书籍介绍入门的话,个人使用R in action ,市场上也有蛮多教材,我觉得这本还是不错,内容多,涵盖统计分析作图多个方面,比较全面。也是学习笔记主要参考书,比如本篇hhh。 有英文、中文翻译纸质版,现在出到第二版,电子版已经出到第三版了,买纸质版比较贵,个人觉得更方便,还能强迫自己不copy代码,全部自己写hhh。R in action Third Edition.
探索性数据分析(EDA)数据项目的第一步。我们将创建一个代码模板来实现这一功能。简介EDA由单变量(1个变量)和双变量(2个变量)分析组成。在这篇文章中,我们将回顾一些我们在案例分析中使用功能:  ●  第1步:取得并了解数据;  ●  第2步:分析分类变量;  ●  第3步:分析数值变量; &
转载 2023-08-08 15:49:17
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# R语言中Proj文件实现指南 ## 一、概述 R语言一个强大统计计算和图形绘制工具,广泛应用于数据分析和数据可视化。在R语言中,Proj文件与项目管理相关重要组成部分。Proj文件通常用于记录和管理项目中各种数据和代码。 ### 二、实现流程 为了更好地理解如何在R语言中处理Proj文件,下面情境基本流程: | 步骤 | 说明
原创 8月前
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R语言构建蛋白质网络并实现GN算法目录R语言构建蛋白质网络并实现GN算法1.蛋白质网络构建2.生物网络模块发现方法3.模块发现方法实现和图形展示1) 基于点连接模块发现:cluster_fast_greedy该方法通过直接优化模块度来发现模块。2) GN算法:edge.betweenness.community3) 随机游走:walktrap.community4)Newman快速算法:le
转载 2024-04-26 17:37:47
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ggplot2用于绘图R语言扩展包。图形组件通过“+”符号, 以图层(layer)方式来完成图形语法叠加,构成最终绘图, 每个图层中图形组件可以分别设定数据、映射或其他相关参数, 因此组件之间具有相对独立性,可以单独对图层进行修改。一、ggplot2基本语法 元素 描述 Data(数据)  用于绘图数据,只能数据框(data.fra
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4. 因子        因子提供一种简单而又紧凑形式来处理分类数据。因子用level来表示所有可能取值。对于数据集中取值个数固定分类数据,因子特别有用,图形函数和汇总函数就充分利用了因子这种优点。        R软件内部以数值编码方式来存储因子值,这
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文章目录综括==apply函数==利用apply函数实现利用循环实现定义一个结果数据框定义for循环利用R特性三种方法消耗时间比较==lapply函数====sapply函数==vapply函数==mapply函数====tapply函数==rapply函数eapply函数 综括apply函数 apply函数最常用代替for循环函数。apply函数可以对矩阵、数据框、数组(二维、多维)
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apply() 函数算是R语言中很基础一个函数,同时还有 sapply()  lapply()  tapply() 函数精简了 apply() 函数用法。apply() 函数一个很R语言函数,可以起到很好替代冗余for循环作用,R语言中循环操作for和while都是基于R语言本身来实现,而向量操作基于底层C语言函数实现,所以使用apply()函数家族进行
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2.5.1程序控制结构程序控制结构应用if条件语句、循环语句等控制程序走向。程序控制结构又称为流程控制。条件语句包括if,swithc语句,可用复合表达式而且可用ifelse,switch语句根据条件表达式值,选择执行语句组。循环语句有for、while、repeat语句,并且可用组合break和next语句方法。一、条件语句1.if语句if条件语句仅在满足条件表达式时执行。条件表达式运
----------------------------------R语言学习与科研应用,科研作图,数据统计挖掘分析,变量为我们提供了我们程序可以操作命名存储。 R语言中变量可以存储原子向量,原子向量组或许多Robject组合。 有效变量名称由字母,数字和点或下划线字符组成。 变量名以字母或不以数字后跟点开头。变量名 合法性 原因var_name2. 有效 有字母,数字,点和下划线VA
c()函数:将括号中元素连接起来,并不创建向量paste()函数:连接括号中元素例如c(1, 2:4),结果为1 2 3 4 paste(1, 2:4),结果为“1 2” “1 3” “1 4” c(2, "and"),结果为“2” “and” paste(2, "and"),结果为“2 and”补充:R语言中paste函数参数sep和collapse详解R语言用于拼接字符串函数主要有两个
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R语言数据集一、向量向量介绍:向量可以保存六种数据类型:逻辑,整数,双精度,复杂,字符和原始向量创建data_1 <- c(1,3,4,6) data_2 <- c("aa", "dd") data_3 <- c(1,4,3,"cc") # 数据类型将会转化成字符串类型,数值类型将转化为字符串向量访问data <- c(1,3,4,6) data[1] # 输出1 da
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3.1 使用图形使用代码保存图形:保存为PDF—pdf(filename),其它格式:win.metafile( ), png( ),jpeg( ),bmp( ),tiff( ),xfig( ),postcript( )打开新图形窗口方法:第一种方法:dev.new( ) statements to create graph 1 dev.new( ) statements to create
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limma 包normalizeBetweenArrays和其他数据矫正方法2.normalizeBetweenArrays只能在同一个数据集里面用来去除样本差异,不同数据集需要用limma  removeBatchEffect函数 去除批次效应数据矫正前.png可以看到,肿瘤样品表达量整体就比正常对照样品表达量高出一大截,这样数据进行后续分析,就会出现大量上调
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mega 2560板子在3d打印机中相当于大脑,控制这所有的3d打印配件来完成复杂打印工作,但mega2560不能直接使用,需要上传(upload)固件(firmware)才可以使用。 1、下载固件——Marlin由于Marlin固件强大功能和简单易用,所以这里暂时只介绍Marlin固件。Marlin原版下载地址(很多参数都需要自己配置):我自己配置Marlin固件大部分参数已经改好:htt
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这里总结一下,今天老师上课内容。我觉得跟着老师,我能学到好多东西。我要消化。我突然觉得自己很卑微,因为有那么多东西需要学习。但是 复习侧重点在:什么自己知道?什么自己不知道?缺什么补什么?R基础知识整理(查漏补缺)S1:identicalidentical(a,i) #既检验数值又检验数据类型 i==m== 仅仅是数值比较;identical 则同时包括数值和属性比较;S2: s
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工作空间函数名称功能getwd()/dir.create()显示/创建当前目录setwd("dir")设置当前目录savehistory("file")/loadhistory("file")保存/读取历史命令save.image("file")/load("file")保存/读取工作空间输入输出执行脚本 source("file") 文本输出 sink("file") e.g sink("out
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R基本运算a = c(1,2,3,4) b = c(3,4,5,6) print(a + b) print(a ^ b) # a ** b print(a %% b) # 整除取余 print(a %/% b) # 整除 v <- a # 向左赋值 b -> w # 向右赋值 ls() # 列出所有变量 print( 1 %in% v) # 相当于 in print
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聊一聊R基本绘图参数 砍柴问樵夫 R语言除了具有优秀数据处理能力外,对于数据展现也具有极其灵活和强大作用。 R语言绘图函数主要包括:低级绘图函数,高级绘图函数,扩展绘图包函数。 基本绘图参数。 我们浏览一下R语言中基本图形参数。 pch:点符号,指定绘制点时使用符号。x<-rep(1:5,times=6) y<-rep(1:6,each=5) pl
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# 如何在R语言中回退文件 ## 概述 在R语言中,回退文件通常是指撤销对文件修改,并将文件恢复到之前版本。这对于开发者来说是一项非常重要技能。本文将向刚入行小白开发者介绍如何在R语言中回退文件步骤和相关代码实现,并提供详细注释。 ## 流程 下面R语言中回退文件整个流程。可以用表格形式展示,如下所示: | 步骤 | 描述 | | --- | --- | | 步骤 1 |
原创 2023-10-28 14:36:53
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