跟着果子学生信——自学成才先说一下，这个笔记是跑果子的GEO分析流程，从他发的帖子上粘的代码，自己跑一边，一边跑，一边学习。原文链接：来完成你的生信作业，这是最有诚意的GEO数据库教程https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMzA2MTcwMg==&mid=2650733210&idx=1&sn=76f5609282d92ba2464472
WRF-chem入门已更新，有兴趣可点击查看WRF-chem入门指南WRF简介WRF（Weather Research and Forecasting Model）模式是由美国环境预测中心（NCEP）,美国国家大气研究中心（NCAR）等美国科研机构中心着手开发的一种统一的中尺度天气预报模式。 WRF模式系统具有的可移植，易维护，可扩充，高效率，方便等特点，使其成为改进从云尺度到各种不同天气尺度的重
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2024-04-28 10:29:39
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注： 本文是R语言sf包的核心开发者和维护者——来自德国明斯特大学的地理信息学教授：
Edzer Pebesma 的一篇关于sf包的简介，发表于2018年7月的R语言期刊，主要讲述了sf的定位、功能、开发现状及现存问题和今后展望，sf包是一个非常了不起的工具，在R语言中引入了空间数量分析领域通用的标准规范（simple feature），结合tidyverse工具箱组合
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2023-06-30 18:38:28
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1.单因素方差分析：适用于单因素A有两个水平或以上，研究个水平对因变量的影响正态假设条件：W检验shapiro.test():原假设为数据来自正态分布方差齐性条件：Bartlett检验（主要用于正态分布的数据） bartlett.test(x, g, ...)x是数据向量或列表（list）；g是因子向量，如果x是列表则忽略g。 当使用数据集时，也可以通过formula调用函数&
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2023-06-25 20:40:28
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http://blog.sina.com.cn/s/blog_597fcb450100c3um.html 【转】R与SAS、SPSS的比较 (2009-03-05 20:29:40)
转载 标签： 教育分类： 学习R与SAS、SPSS的比较R语言 R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是
一个关于 R作直方图的小例子 2010-04-27 19:31:36| 分类： R&Bioconductor|举报|字号订阅
首先是一串很简单的数据，有30个元素： 把它逐行打到一个TXT文件中去，命名为ex1.txt，保存在目录E:\Da 105
93
80 109 112
88
加载可能用到的包library(xml2)
library(rvest)
library(reshape2)
library(ggplot2)
library(dplyr)读取数据打开数据来源的链接，鼠标点击右键检查，将内容复制到文本文件中，我这里命名为new1.txtpage"new1.txt")
JokicJokic[[9]]
list(Jokic)
df1colnames(df1)首先看一看
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2023-11-03 12:30:17
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在既往文章中，我们已经介绍了R语言计算人年及可信区间的计算。但是计算的是总的人年发病率的比较情况，假如我们想知道分层发病率的情况呢？拿既往乳腺癌的数据为例子，我们已经知道了有淋巴结肿大和没有淋巴结肿大患者总的生存率的比较，但是如果我们想了解在每个年龄段有淋巴结肿大和没有淋巴结肿大患者生存率有无区别？如下图 我们以R语言survival包演示泊松回归年龄分层发病率统计，继续使用我们的乳腺癌数据（公众
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2023-08-30 19:55:00
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回归分析是科学研究中十分重要的数据分析工具。随着现代统计技术发展，回归分析方法得到了极大改进。混合效应模型（Mixed effect model），或称多水平模型（Multilevel model）/分层模型(Hierarchical Model)/嵌套模型(Nested Model)，无疑是现代回归分析中应用最为广泛的统计模型，代表了现代回归分析主流发展方向。混合效应模型形式灵活可以应对现代科学
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2023-07-11 09:45:08
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作者：圈圈Getting Data In and Out of R（一）读取数据读取数据所需的几种函数：read.table、 read.csv：最常用的读取列表数据函数，可返回数据框形式。readLines：逐行读取文本文件，返回一个字符向量source：读取R代码、脚本dget：读取R代码（读取的是以逆句法分析后以文本文件储存的R对象）load、 unserialize：把
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2023-10-12 11:04:39
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文章目录一、数据调用与预处理二、一元线性回归分析三、多元线性回归分析（一）解释变量的多重共线性检测（二）多元回归1. 多元最小二乘回归2. 逐步回归（三）回归诊断四、模型评价-常用的准则统计量 一、数据调用与预处理本文使用的数据为R语言自带数据集“iris”。iris数据集包含5个变量： 数值变量：Sepal.Length, Sepal.Width, Petal.Length, Petal.Wi
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2023-07-18 11:44:04
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主要作用：可重现一样的结果R语言中set.seed()作用是设定生成随机数的种子，目的是为了让结果具有重复性，重现结果。不设定种子不行吗？当然可以，但是结果就不能复现。如：x<-rnorm(3) #随机生成3个随机数
结果：1.4197419 -0.7460519 0.3603622
x<-rnorm(3) #再来一遍，生成的3个随机数又不一样了
结果：1.0796213 0.55
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2023-06-19 16:17:51
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一.绘制基本散点图(1)使用plot()函数(2)使用ggplot()函数 heightweight是个多列数据集ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn))+geom_point()ggplot(heightweight,aes(x=ageYear,y=heightIn))+geom_point(shape=21)二.使用点形和颜色属性
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2023-06-19 17:25:29
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高级数据管理数值和字符处理函数数学函数函数描述np.abs(x)绝对值np.sqrt(x)平方根np.ceil(x)大于x的最小整数np.floor(x)小于x的最大整数np.trunc(x)向0截取x中的整数部分np.round(x, decimals=2)将x舍入为指定位的小数np.cos(x)/sin(x)/tan(x)余弦/正弦/正切np.arccos(x)/arcsin(x)/acrta
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2024-07-12 18:50:33
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温故而知新6.函数6.5 自定义函数基本使用> ce2fa <- function(ce){
+ fa <- 1.8 * ce + 32
+ return(fa)
+ }
> ce2fa(0)
[1] 32
> ce2fa(0:10)
[1] 32.0 33.8 35.6 37.4 39.2 41.0 42.8 44.6 46.4 48.2 50.0
>
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2023-08-23 14:20:17
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全面的回归分析包括对异常值的分析：离群点、高杠杆值点、强影响点。 离群点：模型效果不佳的观测点。 使用car包中的outlierTest（）函数，可以求得最大标准化残差绝对值Bonferroni调整后的p值，若不显著，则说明数据集中没有离群点，若显著，则必须删除该离群点。 > library(car)
> outlierTest(fit)可见，在这个回归模
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2023-08-13 20:56:44
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（注明：以下文章均在Linux操作系统下执行）一、R语言简介R语言是用于统计分析，图形表示和报告的编程语言和软件环境。R语言由Ross Ihaka和Robert Gentleman在新西兰奥克兰大学创建，目前由R语言开发核心团队开发。R语言的核心是解释计算机语言，其允许分支和循环以及使用函数的模块化编程。R语言允许与以C，C ++，.Net，Python或FORTRAN语言编写的过程集
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2023-07-23 20:22:52
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１ replicationrep 函数能把输入的参数重复数次。另一个相关函数replicate 则能调用表达式数次。大多数情况下它们基本相等，只有当使用随机数时才会出现不同。现在，假定生成均匀分布随机数的runif 函数不是矢量化的，那么rep 函数每次都将重复相同的随机数，而replicate 每次的结果都不相同（由于历史的原因，其参数顺序竟然是从后到前的，这有点烦人）：rep(runif(1)
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2023-07-09 17:00:04
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目录使用R中的ggplot2进行微阵列可视化（红绿热图）1、常用的方法：biclust包1.1 biclust包的安装1.2 导入biclust包1.3 生成一些测试数据1.4 调用drawHeatmap()函数绘制热图2、ggplot2绘制红绿热图2.1 ggplot2、reshape2包的安装1.2 导入ggplot2、reshape2包1.3 生成要绘制微阵列的模拟数据1.3 对数据进行相
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2023-07-18 16:36:05
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文章目录1. 仅知道函数的部分名称,想列出全部2. 列出全部有tab字段的函数,或者访问3. 自动补全4. 更改小数点位数5. 显示错误信息6. 升级R,但不想重装packages?7. 卸载已安装的packages8. library()的逆向操作9. 得到加载package的列表10. 读取Excel数据两种方法补充：读取pdf文件11. 在对原数据进行了删除处理,但是希望调出原数据12.
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2023-07-21 18:29:31
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