欢迎关注”生信修炼手册”!在mirdeep软件的分析结果中，会提供miRNA前体的二级结构，这个结果实际上是
原创
2022-06-21 06:24:53
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摘要CircRNA作为非编码RNA研究领域的新宠，现今有许多CircRNA预测工具，如findcirc，MapSplice，CIRCexplorer，circRNAfinder和CIRI。来自于丹麦奥尔胡斯大学（AarhusUniversity）的研究人员利用普通的RNA-Seq数据比较了这5种常用的环状RNA预测软件。下表为5种工具的算法对比。首先，研究人员用5个软件分别对同一个rRNA-dep
原创
2021-03-26 08:08:11
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欢迎关注”生信修炼手册”!目前利用RNA_seq数据预测环状RNA的软件非常多，为了方便研究人员更好的选择合
原创
2022-06-21 06:23:27
224阅读
本次竞赛依托百度研究院RNA结构预测算法优势，探索AI技术在生物计算领域的技术应用。
原创
2022-02-21 15:29:34
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基于PaddleHelix完成RNA结构预测竞赛的前置基础知识 一、化学与遗传学——从孟德尔的豌豆说起 显性基因与隐性基因 弱化学键 弱键和强键决定大分子的结构 核酸承载遗传信息——肺炎双球菌的转...
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2020-12-26 10:51:00
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基于PaddleHelix完成RNA结构预测竞赛的前置基础知识一、化学与遗传学——从孟
原创
2023-03-17 19:10:46
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一个比原版更好用的RNA velocity分析工具：velocyto GitHub：https://github.com/velocyto-team/velocyto.R readthedoc：http://velocyto.org/velocyto.py/index.html 历史分析参考： pr
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2021-01-12 16:57:00
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单细胞测序 RNA velocity | RNA速率 RNA velocity：the time derivative of the gene expression state—can be directly estimated by distinguishing between unspliced
原创
2023-10-31 14:49:59
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Antisense RNA与靶核酸(如mRNA或有义DNA)链互补的RNA分子，可抑制靶核酸的功能。反义RNA，根据反义RNA的作用机制可将其分
原创
2023-11-07 12:21:53
139阅读
在前面的文章中，我们介绍了RNAmmer这款rRNA预测软件，这个软件只有大学和科研机构的用户可以免费使用。
原创
2022-06-21 05:50:31
285阅读
RNA editing一、reditools软件下载首先需要安装reditools软件，这是2.0版本的下载链接wget -c https://github.com/tflati/reditools2.0/archive/master.zip解压unzip master.zip然后软件就安装好啦但是我准备安装1.0.3版本，代码如下：wget -c http://sourceforge.net/p
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2024-03-08 08:15:52
343阅读
核糖体RNA, 缩写为rRNA, 是细胞内含量最多的一类RNA, 能够与蛋白质结合形成核糖体，完成氨基酸的合
原创
2022-06-21 05:50:18
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与经验性方法相似的另一种办法是结构规律提取方法，这是更一般的方法。该方法从蛋白质结构数据库中提取关于蛋白质结构形成的一般性规则，指导建立未知结构的蛋白质的模型。有许多提取结构规律的方法，如通过视觉观察的方法，基于统计分析和序列多重比对的方法，利用人工神经网络提取规律的方法。同源模型化方法通过同源序列分析或者模式匹配预测蛋白质的空间结构或者结构单元(如锌指结构、螺旋-转角-螺旋结构、DNA结合区域等
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2024-02-04 09:16:06
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欢迎关注”生信修炼手册”!RNA editing, 即RNA编辑，指的是转录后的RNA发生的碱基插入，缺失，
原创
2022-06-21 09:09:32
402阅读
小干扰RNA（Small interfering RNA；siRNA）有时称为短干扰RNA（short interfering RNA）或沉默RNA（silencing RNA），是一个染色...
原创
2023-11-07 12:21:45
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定义核磁共振波谱法（Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy, NMR ）NMR是研究原子核对射频辐射(Radio-frequency Radiation)的吸收，它是对各种有机和无机物的成分、结构进行定性分析的最强有力的工具之一，有时亦可进行定量分析。简史核磁共振现象于1946年由E.M.珀塞耳和F.布洛赫等人发现。目前核磁共振迅速发展成测定有机化合物结构的
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2024-08-23 11:51:20
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核心概念 Splice Site (SS) 位于外显子与内含子的交界处，能够被剪接体（spliceosome）识别的内含子序列。 分为5'ss (donor site)、3'ss (acceptor site)。 5'ss中的5’指的是5'-intron 3'ss中的3’指的是3'-intron B ...
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2021-08-04 11:10:00
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plant small RNA target mimicry prediction 这里mimicry怎么翻译暂时还不知道 工具的在线链接 ht...
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2022-03-18 10:13:54
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