1、程序的三大流程在程序开发中，一共有三种流程方式：顺序 —— 从上向下，顺序执行代码；分支 —— 根据条件判断，决定执行代码的 分支；循环 —— 让 特定代码 重复 执行；2、 while 循环基本使用循环的作用就是让 指定的代码 重复的执行；while 循环最常用的应用场景是 让执行的代码 按照 指定的次数 重复 执行；需求：打印 5 遍 Hello Python思考：如果要求打印 100 遍
目录一、理论模型1.概念作用 2.理论模型二、服务通信自定义srv1.流程2.实现1.定义srv文件 2.编辑配置文件三.服务通信自定义srv调用B(Python)1.需求 流程2.服务端2.客户端一、理论模型1.概念作用 请求响应模式的，是一种应答机制。也即: 一个节点A向另一个节点B发送请求，B接收处理请求并产生响应结果返回给A。比如如下场景:机器人巡逻过程中，控
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2024-01-03 13:49:08
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一. 聚类的性能评测1. 导入digits数据集,分割训练集和测试集这个数据集是随便导入的,也可以选择其他数据集 标签 target 有10个分类2. 导入聚类算法,训练,预测导入聚类算法,将样本集划分为10个聚类 此时数据有标签类别，评测的时候可以用聚类划分和真实的类别之间的吻合程度训练预测 K-means还提供了预测机制，预测基于前面的训练，把测试集样本依次带入，查看这个些样本分别落在哪一个聚
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2024-10-24 20:46:14
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Linux系统分为两种：1.RedHat系列：Redhat、期的文章。进入R 服务：运行：library(‘Seurat’)如果提示没有这个包。执行安装命令：install.packages(“Seurat”)
原创
2022-12-08 15:46:13
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一、类定义、创建对象 Scala和Java一样，用class关键字来创建类，eg:class Student{
var score:Int=0
} 利用javap -private Student命令可以看到上述Scala文件对应的字节码文件内容为： &n
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2024-09-01 21:44:57
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目录1. 加载数据集，创建Seurat对象 2. 数据预处理a. QC（质量控制）b. 数据标准化c. 高变基因（特征选择）d. 归一化e. 数据降维（PCA） 3. 单细胞聚类 4. 非线性降维 5. 细胞类型标识分配给集群 6. 结果保存为.rds文件1. 加载数据集，创建Seurat对象数据下载地址：https://cf.10xgenomic
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2023-07-28 10:53:37
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这样的一种情况： 使用Loader去load一个swf: var fileURL:String = “assets/test.swf”
var swfLoader:Loader = new Loader();
swfLoader.contentLoaderInfo.addEventListener(Event.COMPLETE, swfLoaded);
swfLoader.load
实现单细胞seurat包数据分析的步骤如下：
步骤 | 描述
------------- | -------------
1 | 安装Seurat包和相关依赖
2 | 导入单细胞数据
3 | 数据质控和预处理
4 | 单细胞数据聚类
5 | 数据可视化和分析
6 | 结果解释和进一步分析
下面我将逐步解释每个步骤需要做什么，并给出相应的代码。
## 第一步：安装Seurat包和
原创
2024-01-22 07:06:32
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# 使用Seurat R语言修改默认编码格式的步骤
## 简介
在Seurat R语言中，修改默认编码格式是一个常见的需求，特别是在处理单细胞转录组数据时。本文将引导你完成修改默认编码格式的步骤，并提供相关代码和注释说明。
## 流程概览
下面是修改Seurat R语言默认编码格式的步骤概览：
| 步骤 | 描述 |
| --- | --- |
| 步骤一 | 安装所需的R包 |
| 步骤
原创
2024-01-17 07:43:26
28阅读
商业智能提供的解决方案能够从多种数据源获取数据并且能够把各种数据转化成同一格式数据进行存储，最终达到让用户可以快速访问解读数据，为用户分析和制定决定提供有效的数据支持。可以人为的把商业智能分为以下几层：数据源层：公司日常工作中会存在多种格式的数据，如文本文档，excel文件，access数据库文件，SQL Server数据库文件等。数据转换层：由于数据源存在多样化，为了方便分析，需要对它们进行一定
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2024-02-29 10:28:50
393阅读
一、涉及的新概念参考（reference）：将跨个体，跨技术，跨模式产生的不同的单细胞数据整合后的数据集 。也就是将不同来源的数据集组合到同一空间（reference）中。 从广义上讲，在概念上类似于基因组DNA序列的参考装配。查询（query）：单个实验产生的数据集转化学习（transfer learning）：产生一个于参考数据集（reference）上进行训练的模型，可以将信息再重新...
原创
2022-03-08 14:34:50
1968阅读
单细胞流程跑了不少，但依旧看不懂结果，是该好好补补了。 有些人可能会误会，觉得单细胞的RNA-seq数据很好分析，跟分析常规的RNA-seq应该没什么区别。今天的这篇文章2015年3月发表在Nature Genetics Review上，专门说明了一下单细胞RNA测序数据在数据分析和计算上的挑战（虽然已经过去1年多了，这里指出的问题和挑战仍然是不过时的，至于这些问题和挑战现在是不是完美解
安装Seurat包 安装Seurat包 install.packages('Seurat', type = "binary") install.packages('Seurat') library('Seurat') packageVersion("Seurat") 相关包下载 install.pa
原创
2023-10-31 14:52:56
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基于R语言进行栅格数据统计及Raster包简介写在前面：日常数据处理中常需要对单个栅格图层进行统计，包括计算其均值、最值和总和等等。使用R语言可方面快速地实现该需求，主要借助的package为Raster包。library(raster)
x = raster('data/data.tif')
cellStats(x,stat='mean')x表示待计算的栅格；stat表示需要统计的内容，包括su
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2024-05-22 17:38:05
55阅读
斯坦福大学Satija lab的 Seurat v3.1 guidline于近日更新啦！其中包括许多个性我们也可以看到由于细胞周期不同...
原创
2023-05-02 22:23:12
346阅读
在linux中用同一个版本的R 同时安装 Seurat 2 和 Seurat 3Seurat 作为单细胞分析中的重量级R包，有多好用用，用过的人都知道。Seurat 分析流程基本涵盖了单细胞分析中的所有常见分析方法，包括filtering，tSNE，UMAP降维及画图等。还有一个重量级功能就是矫正不同实验之间的批次效应。然而Seurat 2和Seurat 3的矫正方法完全不一样，得到的
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2023-08-25 14:03:27
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在使用seurat进行单细胞分析的时候，大多数的教程都是用计数矩阵作为数据输入，但是我发现一些新手朋友对于不同数据库来源(的数据或者想要去复现、借鉴一个感兴趣的文章中的下机数据时，不知道怎么把数据处理成Seurat可以读入的计数矩阵，所以本篇文章就详细介绍单细胞数据的上游分析。上游分析主要涉及的步骤就两个：比对和质控。我们可以先从10X平台官网了解一些软件和方法。“Software Analysis”的界面提供了3种工具：Cell Ranger：比对质控需要用到的软件。
NA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基...
原创
2023-05-02 22:34:34
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技能目标:掌握if语句
掌握while循环语句
掌握for循环语句
掌握python 循环控制前言Python流程控制是python编程中非常重要的一部分,它用于控制程序的执行流程。python提供了
多种流程控制语句,包括if语句、whi1e循环、for循环、break和continue语句等。这种流程控制在
各个语言中都是大同小异的。一：if语句if语句用于根据条件执行不同的代码块。cond
文章目录1. 流程控制概述顺序结构分支结构循环结构 1. 流程控制概述流程就是程序在运行时的顺序，我们要想改变它的顺序，就需要用到流程控制了。简单的说就是控制代码的执行顺序。顺序结构python 的流程结构主要有三种，顺序、分支、循环。顺序结构较为简单，就是从上到下的运行代码，我们所编写的代码都是这样的流程分支结构我们要想计算机有人一样的思想，就必须要有对条件的判断功能，对根据条件做出不同的流程
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2023-11-13 10:03:52
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