层次聚类算法分为合并算法和分裂算法。合并算法会在每一步减少聚类中心的数量，聚类产生的结果来自前一步的两个聚类的合并；分裂算法与合并算法原理相反，在每一步增加聚类的数量，每一步聚类产生的结果都将是前一步聚类中心分裂得到的。合并算法现将每个样品自成一类，然后根据类间距离的不同，合并距离小于阈值的类。我用了基于最短距离算法的层次聚类算法，最短距离算法认为，只要两个类的最小距离小于阈值，就将
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2023-09-05 18:18:46
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层次聚类算法的主要优点在于我们无需事先知道最终所需集群数量。很遗憾的是，网上并没有很详细的教程讲述如何使用 SciPy 的层次聚类包进行层次聚类。本教程将帮助你学习如何使用 SciPy 的层次聚类模块。命名规则在我们开始之前，我们先设定一下命名规则来帮助理解本篇教程：X - 实验样本(n 乘 m 的数组)n - 样本数量m - 样本特征数量Z - 集群关系数组(包含层次聚类信息)k - 集群数量导
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2024-02-29 15:13:06
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层次聚类(hierarchical clustering)基于簇间的相似度在不同层次上分析数据，从而形成树形的聚类结构，层次聚类一般有两种划分策略：自底向上的聚合（agglomerative）策略和自顶向下的分拆（divisive）策略，本文对层次聚类算法原理进行了详细总结。目录1. 层次聚类算法原理2. 簇间相似度的计算方法3. 层次聚类算法的复杂度计算4. 层次聚类算法的优化方法5. 层次聚类
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2024-01-10 21:45:31
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写在前面：健忘星人自学笔记，仅供参考简单易懂的阅读资料 层次聚类-概念全解 - 万勇's
前面的文章我们分别介绍了 K-means , 密度聚类，谱聚类，其中谱聚类的难度比较大，要求有一定的矩阵学习基础，今天不妨轻松一下，学习一个较为简单的“层次聚类”。正文：一、层次聚类基本原理层次的聚类方法（Hierarchical Clustering），从字面上理解，其
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2023-12-08 10:00:59
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层次聚类层次聚类的概念：层次聚类是一种很直观的算法。顾名思义就是要一层一层地进行聚类。层次法（Hierarchicalmethods）先计算样本之间的距离。每次将距离最近的点合并到同一个类。然后，再 计算类与类之间的距离，将距离最近的类合并为一个大类。不停的合并，直到合成了一个类。其中类与类 的距离的计算方法有：最短距离法，最长距离法，中间距离法，类平均法等。比如最短距离法，将类与类 的距离定义为
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2024-05-15 08:15:42
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# Python层次聚类实现教程
作为一名经验丰富的开发者，我很高兴能够帮助刚入行的小白们学习如何使用Python实现层次聚类。层次聚类是一种常用的聚类方法，它将数据点逐步合并成更大的簇，直到达到某个终止条件。在本文中，我将详细介绍层次聚类的实现步骤，并提供相应的Python代码示例。
## 层次聚类实现流程
首先，我们来看一下实现层次聚类的整体流程。以下是层次聚类的主要步骤：
| 步骤
原创
2024-07-30 03:39:40
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起步层次聚类（hierarchical clustering）是聚类算法中的一种，通过计算不同类别的相似度组成新的类创建一个层次的嵌套的树。基本结构如图所示：层次聚类算法介绍假设有n个待聚类的样本，对于层次聚类算法，它的步骤是：步骤一：（初始化）将每个样本都视为一个聚类；步骤二：计算各个聚类之间的相似度；步骤三：寻找最近的两个聚类，将他们归为一类；步骤四：重复步骤二，步骤三；直到所有样本归为一类整
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2023-11-03 19:02:53
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博客上看到的，叫做层次聚类，但是《医学统计学》上叫系统聚类（chapter21）思想很简单，想象成一颗倒立的树，叶节点为样本本身，根据样本之间的距离（相似系数），将最近的两样本合并到一个根节点，计算新的根节点与其他样本的距离（类间相似系数），距离最小的合为新的根节点。以此类推对于样本X=（x1，x2，，，xm），共n个样品，m个特征，我们可以考虑两种情形聚类R型聚类：m个特征之间的聚类，可以理解为
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2023-12-05 18:34:42
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引言最近在读西瓜书，查阅了多方资料，恶补了数值代数、统计概率和线代，总算是勉强看懂了西瓜书中的公式推导。但是知道了公式以后还是要学会应用的，几经摸索发现python下的sklearn包把机器学习中经典的算法都封装好了，因此，打算写几篇博客记录一下sklearn包下的常用学习算法的使用，防止自己以后忘了，嘿嘿。1.聚类西瓜书中197页对“聚类”做了详细的解释，以下为摘录：在无监督学习中，训练样本的标
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2023-08-24 13:39:28
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1. 层次聚类1.1 层次聚类的原理及分类1）层次法（Hierarchicalmethods）：先计算样本之间的距离。每次将距离最近的点合并到同一个类。然后，再计算类与类之间的距离，将距离最近的类合并为一个大类。不停的合并，直到合成了一个类。其中类与类的距离的计算方法有：最短距离法，最长距离法，中间距离法，类平均法等。比如最短距离法，将类与类的距离定义为类与类之间样本的最短距离。层次聚类算法根据层
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2023-10-26 16:11:58
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目录1.作者介绍2．层次聚类算法介绍2.1 层次聚类算法原理2.2 层次聚类算法步骤2.3 层次聚类算法分类3．层次聚类算法实现(代码如下)3.1 相关包导入3.2 生成测试数据集3.3 层次聚类实现&画出树状图3.4 获取聚类结果3.5完整代码3.6 对比不同方法聚类效果4.参考链接 1.作者介绍杨金花，女，西安工程大学电子信息学院，21级硕士研究生 研究方向：基于学习方法的运动目标检
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2023-06-13 21:30:51
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1.简介层次聚类(Hierarchical Clustering)通过计算各类别中数据之间的相似度，最终创建一棵有层次的嵌套聚类树。起核心思想是基于各"簇"之间的相似度，在不同层次上分析数据，得到最终的树形聚类结构。2.agglomerative与divisive自底向上聚合（agglomerative）策略和自顶向下分拆（divisive）策略是层次聚类中常见的两种划分策略。算法的基本步骤为 1
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2024-01-03 12:46:56
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层次聚类 原理 有一个讲得很清楚的博客： "博客地址" 主要用于：没有groundtruth，且不知道要分几类的情况 用scipy模块实现聚类 参考函数说明： "pdist" "squareform" "linkage" "fcluster" 1. scipy.spatial.distance.pd
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2018-03-15 17:28:00
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目录一、层次聚类1、层次聚类的原理及分类2、层次聚类的流程3、层次聚类的优缺点二、python实现1、sklearn实现2、scipy实现树状图分类判断一、层次聚类1、层次聚类的原理及分类1）层次法（Hierarchicalmethods）先计算样本之间的距离。每次将距离最近的点合并到同一个类。然后，再计算类与类之间的距离，将距离最近的类合并为一个大类。不停的合并，直到合成了一个类。其中类与类的距
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2024-08-03 16:31:30
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不管是GMM，还是k-means，都面临一个问题，就是k的个数如何选取？比如在bag-of-words模型中，用k-means训练码书，那么应该选取多少个码字呢？为了不在这个参数的选取上花费太多时间，可以考虑层次聚类。 假设有N个待聚类的样本，对于层次聚类来说，基本步骤就是： 1、（初始化）把每个样本归为一类，计算每两个类之间
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2024-01-22 11:27:01
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# 手动实现层次聚类的流程与步骤
层次聚类是一种常用的聚类分析方法，主要用于从数据中探测将其分为不同组的方法。在这篇文章中，我将逐步教你如何用 Python 手动实现层次聚类。我们先来了解一下实现的流程。
## 实现流程
| 步骤 | 描述 |
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最近使用MDTraj对分子动力学轨迹进行聚类分析，接触到了python中的聚类实现，故将CSDN上一篇关于聚类的博客搬运至此，以作备忘：scipy cluster库简介scipy.cluster是scipy下的一个做聚类的package, 共包含了两类聚类方法:矢量量化(scipy.cluster.vq:支持vector quantization 和 k-means 聚类方法层次聚类(scipy.
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2023-10-16 06:15:08
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前言今天试了下用python实现层级聚类，感觉还是有不少问题。转专业的一只小菜鸡，初学代码，写的很简陋，希望各位大牛能指出不足之处。代码输入是一个长度可选的列表。这里用random随机生成，10个数据，并把数据用字母'a'、'b'等依次标记。算法实现中用树结构存储数据。树的每一个节点都是一个数据集，它的左右子树代表该节点包含的两个数据集。计算所有数据相互的距离（x1.value - x2.valu
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2023-09-30 21:58:26
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前言K-means 聚类，介绍了 K-means 算法以及一些优化改进的算法，通过此了解聚类分析，接下来我们进一步的介绍聚类分析的其他方法。本篇代码可见：Github一、层次聚类\quad\quad 层次聚类技术是第二类重要的聚类方法。层次聚类方法对给定的数据集进行层次的分解，直到满足某种条件为止，传统的层次聚类算法主要分为两大类算法：凝聚的层次聚类：AGNES算法(AGglomerative N
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2023-08-15 14:48:49
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层次聚类步骤：假设有N个待聚类的样本，对于层次聚类来说，基本步骤就是：1、(初始化)把每个样本归为一类，计算每两个类之间的距离，也就是样本与样本之间的相似度；2、按一定规则选取符合距离要求的类别，完成类间合并；3、重新计算新生成的这个类与各个旧类之间的相似度；4、重复2和3直到所有样本点都归为一类，结束。随机森林步骤：从原始训练集中使用Bootstraping方法随机有放回采样选出m个样本，共进行
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2023-09-22 07:53:31
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