NCBI（National Center for Biotechnology Information，美国国家生物技术信息中心）除了维护GenBank核酸序列数据库外，还提供数据分析和检索资源。NCBI资源包括Entrez、Entrez编程组件、MyNCBI、PubMed、PudMed Central、PubReader、Gene、the NCBI Taxonomy Browser、B
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2024-04-16 22:25:33
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简介SRA数据库是美国国立卫生研究院（NIH）的高通量测序数据的主要归档，是国际核苷酸序列数据库协作（INSDC）的一部分，其中包括NCBI序列读取存档（SRA），欧洲生物信息学研究所（EBI）和DNA数据库 日本（DDBJ）。 提交给三个组织中的任何一个的数据都是共享的。SRA数据库数据来自高通量测序平台（Roche 454 GSSystem®，Illumina GenomeAnal
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2023-07-29 20:33:32
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文章目录介绍查询某个物种的全部核酸序列和蛋白序列查看某个物种的其他信息（蛋白结构，基因，测序数据，相关文献等）Taxonomy 的相关数据下载**gi_taxid 标识的数据****taxcat 标识的数据**以尼安德特人（taxid：63221）为例介绍Taxonomy : NCBI公共序列数据库中所有生物的策划分类和命名法。目前
原创
2022-03-08 14:13:42
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NCBI网站是最常用的生物信息数据库之一，集成了pubmed,genebank等子
原创
2022-06-21 09:23:23
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O.Sativa选用MSU或者RAPDB这两个数据库的genome和gtf文件，介绍一下MSU的ID，RAPDB的同理。The Rice Annotation Project (RAP)（https://rapdb.dna.affrc.go.jp/index.html）和Rice Genome Annotation Project （RGAP7，MSU）（http://rice.plantbiol
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2024-08-12 11:03:50
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1.准备本地数据库文件 NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗余蛋白库，是所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列。Taxonomy物种分类数据库，包括大于7万余个物种的名字和系谱，这些物种都至少在遗传数据库中有一条核酸或蛋
原创
2022-06-10 22:50:31
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因为很多原因需要备份/导出手机QQ的聊天记录。最近因为腾讯推出了TIM，大部分用户转用TIM，在手机上几年的聊天记录很难转移，因为腾讯不开放聊天记录转移的方案。 最近在酷安网看到一个 “QQ聊天记录导出” 和“微信聊天记录导出”的软件，看了一下他备份的包就是普通的zip备份了QQ应用数据的databases文件夹。(/data/data/com.tencent.mobileqq/data
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2011-04-14 14:10:00
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本篇文章把上传数据（扩增子测序）的步骤尽可能详细的整理出来，希望能对各位科研工作者有所帮助。其它类型数据上传讲解将依次在后续推文中奉上，大家持续关注哦！1.注册及登录账号1）注册一个NCBI（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/）网页：按照提示填写账号、密码、邮箱等信息。2）登录账号，点击左上角的NCBI大图标回到NCBI的主页，然后点击图中Submit按钮进入提交数据页面。
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2024-03-27 15:09:15
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前几天数据库服务器，突然掉了，造成其提供数据的两个web也中断服务。现象： 1、电脑运行缓慢，几乎不能操纵 2、此数据源支持的web程序已down，暴露出来的Error：获得连接超时。 3、本地连接数据库没有问题，但是本地的Web程序居然获得不了数据连接 4、CPU利用率、内存占用并不高系统出现当机的可能性很多，造成了确定原因很困难。只能地毯式搜索。 1、系统已经进行了全面的
速来围观！——三种NCBI常见数据库在微生物测序分析中，常常需要对未知的核酸或蛋白序列进行物种,功能或类别注释。注释方法种类较多，其中最常用的是与一些标准数据库进行相似性搜索，也就是序列比对。因此，数据库的优劣对注释结果至关重要。本期小编为大家带来的是NCBI上的三个重要的数据库—NR/NT，Taxonomy和RefSeq。NR/NT 数据库NR(Non-Redundant Prote
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2023-09-26 11:00:30
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今天打开网站时，突然报这个错误，平时都好好的 Cannot open database "JMECC" requested by the login. The login failed. Login failed for user 'NT AUTHORITY\IUSR'. 我的连接字符串是这样的，用
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2016-01-27 15:53:00
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这些年大数据概念已经成为IT界的热门，我们经常也会在新闻和报纸中看到。大数据概念中最为关键的技术就是数据库管理系统，伴随着hadoop和MapReduce技术的流行，大数据的数据库中Hive和Spark等新型数据库脱颖而出；而另一个技术流派是基于传统的并行数据库技术演化而来的大规模并行处理（MPP）数据库比如GreenPlum和HAWQ也在最近几年突飞猛进，这两种流派都有对应的比较知
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2023-08-16 17:28:31
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对比表性能对比：价格对比： 重要区别一、性能高、安全性高、可靠性高参数优化阿里云聚集国内顶尖的数据库专家，所有 RDS 实例的参数都是经过多年的生产实践优化而得。在 RDS 实例的生命周期内，DBA 持续对其进行优化，确保 RDS 一直基于最佳实践在运行。SQL 优化建议针对用户的应用场景特点，RDS 会锁定效率低下的 SQL 语句并提出优化建议，以便用户优化业务代码。高端硬件投入RDS
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2024-01-02 21:17:53
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hadoop简介Apache Hadoop软件库是一个框架，允许使用简单的编程模型跨计算机集群分布式处理大型数据集。它旨在从单个服务器扩展到数千台计算机，每台计算机都提供本地计算和存储。该库本身不是依靠硬件来提供高可用性，而是设计用于检测和处理应用层的故障，从而在计算机集群之上提供高可用性服务，每个计算机都可能容易出现故障。
hadoop的思想之源来源于Google在大数据方面的三篇论文
GFS
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2023-09-13 15:29:17
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Date: 2016-01-27
Title: 图形数据库-1
Published: true
Type: post
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Category: GraphDB图形数据库(GraphDB)如果您对此文章感兴趣，欢迎发邮件至## 何谓图形数据库在我们生存的实际世界当中，到处都存在着"关系"。世界当中没有独立存在的事物，在我们身边充斥着大量的，相互交织的各种关系。如果需要处理这些相互交织的关
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2023-09-08 18:57:04
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1、taxonomy之简介生物分类学是研究生物系统的一种强有力的组织原则。遗传、共同遗传的同源性以及在确定功能时保护序列和结构，这些都是生物学的中心思想，直接关系到任何一组生物体的进化史。因此，分类法在许多NCBI工具和数据库中扮演着重要的交联角色。NCBI分类法数据库是对GenBank中表示的所有生物体的名称和分类进行整理的集合。当向GenBank提交新的序列时，将检查提交的序列中是否有新的生物
文章目录 前言一、图数据库区别于其他数据库的核心是什么？二、图数据库能解决哪些问题？
1.图的优势2.目前的图的实现方式及优劣3.图的技术趋势及优势小结总结 前言《图数据库知识点》系列有20讲，每一讲中会重点分享一个图数据库知识点（好吧，其实每个知识点从图思维方式延展开来的话，都会关联很多其它的知识点，因此它其实是个知识的子图、子网）。通过把20个知识点串联起来，大家会对图数据库有个脉络化
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2024-08-27 13:36:12
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一、什么是数据库简单来说，数据库就是存放计算机数据的仓库，这个仓库按照一定的数据结构来对数据 进行组织和存储，可以通过数据库提供的多种方法来管理其中的数据。二、关系型数据库关系型数据库模型是把复杂的数据结构归结为简单的二元关系（即二维表格形式）。在关系型数据库中，对数据的操作几乎全部建立在一个或多个关系表格上，通过这些关联的表格分类、合并、连接或选取等运算来实现数据的管理。 代表产品：oracle
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2023-12-10 12:43:47
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简述电子表格与数据库在技术思想和方法上的区别Excel：处理的工具。对于数据格式没有强的要求，安全级别很低，运算灵活，本操作。数据库：SQL Server/Oracle等。数据格式有非常严格的要求，安全级别很高(C级以上)，运算能力有限(按字段/列，记录/行进行有限操作)区别：1. 数据端和客户端的位置(逻辑位置)Excel的数据和客户界面是集成都在本地 / 数据库的数据和客户界面的位置是分离的(
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2024-07-26 07:58:24
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