文章目录1.使用 filter( ) 和 slice( ) 筛选行2.使用 arrange( ) 排列行3. 使用 select( ) 选择列4.使用 mutate( ) 添加新变量5.使用 summarise( ) 计算统计量6. 使用 group_by( ) 拆分数据框7. 使用传递符 %>% 组合多个操作项目实战 这个包以一种统一的规范更高效地处理数据框。dplyr 包里处理数据框的
转载
2024-10-11 17:11:47
231阅读
# 如何使用R语言msm进行分析
## 简介
在这篇文章中，我将向你介绍如何使用R语言中的msm包进行分析。msm包是一个用于描述和预测马尔可夫链的统计模型的工具包。马尔可夫链是一种随机过程，其中未来的状态仅依赖于当前的状态，而与过去的状态无关。msm包提供了一组函数，可以用来估计、检验和预测马尔可夫链的参数。
## 分析步骤概览
在使用msm包进行分析时，我们可以遵循以下步骤：
1. 数据
原创
2023-08-18 13:00:43
1089阅读
接下来几篇主要围绕卷积具体能在图形渲染中实现什么效果，比如常用的边缘检测滤波器（卷积滤波器），这个滤波器不仅在学习卷积的时候基本都会讲到，而且我看过的国内外shader开发书籍中也都会提到，滤波器构成如下： 三维图形学中边缘的意义我们之前讲过，不明白的可以回过去看下，这里我们在来看下二维图形中
# 用R语言实现马尔可夫多态预测模型
## 1. 引言
马尔可夫模型是统计学中一种非常重要的工具，能够帮助我们理解系统在不同状态之间的转移情况。在许多实际应用中，我们可以利用马尔可夫模型来预测未来的状态。在这篇文章中，我们将使用R语言中的`msm`包来实现马尔可夫多态预测模型。本文将介绍整个实现过程，并提供每一步所需的代码及详细注释。
## 2. 整体流程
在开始之前，我们先明确实现“r语
前言 最近想试一下捣腾一个 R 包出来，故参考了一些教程。现在看到的最好的就是谢益辉大大之前写过的开发R程序包之忍者篇，以及 Hadley 大神（ggplot2 devtools 等一系列包的作者）的 教程。但是前者有一些过时，后者是全英文的，所以我这里记录一下比较简单的过程，给读者们一个参考思路。如果你有一些 R 程序，想塞到去一个自创的 R 包中，那么这篇文章就可能是你想要的。为了方
转载
2023-09-02 15:12:54
589阅读
另外再推荐一个在线绘制venn图的网站（除了广告较多都挺好的）：https://www.meta-chart.com/venn具体包括下面三个包： limma、venneuler、VennDiagram。总的来说，三个包都有着各自的不足。下面会一一进行说明，这里先放上结论：综合方便程度以及函数的多样性而言，VennDiagram > venneuler > limma。limma首先针
转载
2024-01-25 16:49:11
567阅读
qgg包：一款大规模数量遗传和基因组分析的R包一、概述该包基于：假设基因组特征可能会富集影响性状的因果变体。根据以往的研究和不同的信息来源，可以分成几种基因组特征,如基因、染色体或生物途径。1、核心功能拟合线性混合模型 构建基因组关系矩阵 估计遗传参数(遗传性和相关性) 基因预测 单标记关联分析 基因集合富集分析2、qgg利用以下处理大规模数据使用openMP的多核处理 在BLAS库(如OpenB
数据挖掘主要分为4类，即预测、分类、聚类和关联，根据不同的挖掘目的选择相应的算法。R语言博大精深，吸纳了来自各方的挖掘算法包，这些包都是由统计学家或是算法研究人员提供，我们可以站在这些伟人的肩膀上实现算法的应用。下面对常用的数据挖掘包做一个汇总：连续因变量的预测：stats包stats包stats包rpart包RWeka包adabag包adabag包randomForest包e1071包kernl
转载
2023-06-21 18:36:04
222阅读
1. vim 删除一列先使用ctrl + v，移动方向键，选择矩形区域，然后按 d 进行删除如果要在每一列前面加一个“{ ”------>修改列为特殊字符（ctrl + v选好后使用r替换成特殊字符），然后使用:%s替换命令如果要在每一列后面加一个“},” ------> 1. 修改最后一个字符为特殊；2. 使用命令“:%s /,\r/
转载
2024-08-20 20:02:48
68阅读
R语言利用ALL数据集作柱状图和热图#下载数据包
#BiocManager::install(“ALL”)
#BiocManager::install(“Biobase”)#加载数据包
library(“ALL”)
library(“Biobase”)#载入数据集
data(“ALL”)#查看相关消息
ALL‘筛选数据子集，并且将数据存入case1内，条件一：BT列数据在前五行的集合内
转载
2023-08-09 20:55:45
215阅读
导读本文整理了R语言绘图中使用频率较高的程序包，每个程序包都附载相应的参考来源链接（链接里有实现绘图的脚本）和下载链接。另：茗创科技为大家提供免会员极速下载服务，需要相应程序包的小伙伴可以私信茗创科技周翊工程师，微信号MCKJ-zhouyi或17373158786。gganimate：在R中绘制动态图gganimate在CRAN上可通过install.packages('gganimate')来安
转载
2023-11-05 19:59:46
368阅读
2.3.6 导入 SPSS 数据
IBM SPSS数据集可以通过foreign包中的函数read.spss()导入到R中，也可以使用Hmisc
包中的spss.get()函数。函数spss.get()是对read.spss()的一个封装，它可以为你自动设
置后者的许多参数，让整个转换过程更加简单一致，最后得到数据分析人员所期望的结果。
首先，下载并安装Hmisc包（foreign包已被默认安装
转载
2024-02-28 10:47:41
517阅读
转录组edgeR分析差异基因edgeR是一个研究重复计数数据差异表达的Bioconductor软件包。一个过度离散的泊松模型被用于说明生物学可变性和技术可变性。经验贝叶斯方法被用于减轻跨转录本的过度离散程度，改进了推断的可靠性。该方法甚至能够用最小重复水平使用，只要至少一个表型或实验条件是重复的。该软件可能具有测序数据之外的其他应用，例如蛋白质组多肽计数数据。可用性：程序包在遵循LGPL许可证下可
转载
2023-11-03 09:45:11
338阅读
R 2.14.0版本以后，parallel包被作为核心包引入R，这个包主要建立在 multicore 和 snow 包的工作基础之上，包含了这两个包大部分功能函数，以及集成了随机数发生器。实际上对于R来说，并行化可以在不同的层级上实现：比如，在最底层，现在的多核CPU可以实现一些基础的数值运算（比如整数和浮点算数）； 高级一点的，一些扩展BLAS包使用多线程并行处理向量和矩阵的操作，甚至有些R扩展
转载
2023-12-09 12:17:34
152阅读
R语言数据处理学习记录–使用linkET包完成mental test注：本文仅作为自己的学习记录以备复习查阅一 简单介绍一下这个包依旧是来自于GitHub上，作者给出的介绍：linkET的目标是简单而直接地可视化基于’ ggplot2 '的矩阵热图。其实作者已经给出了非常详细的包的使用方法，从Data processing到后面各种图形的绘制都有详细的代码和图片展示，所以这里just给一些无法很方
转载
2023-11-16 19:33:58
530阅读
gbm包wiki中对GBRT的定义gbm包在R中的使用基本建模函数参数选择最适的回归树个数例子 gbm包gbm包是梯度提升回归树（GBRT）在R 中的实现。GBRT，全称为Gradient Boosting Regression Tree, 有时也称为GBDT。wiki中对GBRT的定义Gradient boosting is a machine learning technique for r
转载
2023-07-11 15:17:22
239阅读
ggplot2的优点 ggplot2可以让作图者根据ggplot2的作图语法来控制一下作图中的重要的因素，用起来可以说神通广大 ggplot2的主要元素： 1.data:数据 2,Aesthetic mapping：颜色、形状、点的大小与线的粗细 3,Statistical transformations:将数据做统计转换，比如概率密度，计数等等 4，Coordinate system:坐标轴的调
转载
2024-04-14 21:04:35
56阅读
KNN 算法是 Cover 和 Hart 于1968 年提出一种基于统计的学习方法。所谓K最近邻，就是k个最近的邻居的意思，说的是每个样本都可以用它最接近的k个邻居来代表。等于就是把先数据通过特征空间属性，主要就是计算欧式距离，分为K个相近类别，后面的数据根据自己的属性划分到和自己属性最相似的类别上。我们通过R语言来演示一下近邻分析（KNN），先导入我们的R包和数据，library(class)
转载
2023-11-24 21:21:11
126阅读
R包介绍及开发（初学者基础详解）一、R包概述1.1 R包简介1.2 R包下载1.3 R包安装1.4 R包使用二、创建R包2.1 R包架构及内容2.2 R包开发的环境配置2.2.1 R包开发准备2.2.2 R包构建工具准备2.2.2.1 R包开发工具包 | devtools包2.2.2.2 工具集 | RTools2.3 R包创建流程2.3.1 命名 | 创建R包2.3.1.1 R包命名规则2.3
rpart包可实现回归树。通常分为两步建立回归树：1.生成一棵较大的树 2.通过统计估计删除一些结点来对树进行修剪。
转载
2017-11-26 21:56:00
196阅读
