R包介绍及开发（初学者基础详解）一、R包概述1.1 R包简介1.2 R包下载1.3 R包安装1.4 R包使用二、创建R包2.1 R包架构及内容2.2 R包开发的环境配置2.2.1 R包开发准备2.2.2 R包构建工具准备2.2.2.1 R包开发工具包 | devtools包2.2.2.2 工具集 | RTools2.3 R包创建流程2.3.1 命名 | 创建R包2.3.1.1 R包命名规则2.3
# R语言中的ggsurvplot安装与使用
## 引言
在生存分析中，R语言是一个绝佳的工具，而`ggsurvplot`是R语言中用于绘制生存曲线的强大函数。本文将详细介绍如何安装`ggsurvplot`，并通过一个实例演示如何使用它绘制生存曲线。此外，我们将插入饼状图和状态图以展示相关数据。
## 1. ggsurvplot的安装
在使用`ggsurvplot`之前，我们需要先确保安装
原创
2024-08-19 06:23:49
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一、选题背景 现如今，音乐伴随着我们的生活。已经成为了我们的生活习惯一部分，听音乐的场景有很多，例如做作业、上班出勤的路上、午休小寝时……为此我们都会对最近新出的流行歌曲和热度飙升比较快的歌曲感兴趣。为此我选这个主题作为课题。二、爬虫方案设计名称：QQ音乐流行、飙升排行榜数据爬取内容：通过访问QQ音乐的web官网，爬取相对应榜单的信息。最后保存下来做可视化分析。设计方案思路： 首先，用requ
# R语言中的ggsurvplot函数参数详解
在生存分析中，我们经常需要绘制生存曲线来评估不同组之间的生存率差异。其中，R语言的`survival`包提供了`ggsurvplot`函数，可以方便地绘制生存曲线图。本文将详细介绍`ggsurvplot`函数的常用参数，以帮助读者更好地使用该函数进行生存曲线的可视化分析。
## 安装和加载所需的包
在开始之前，请先确保已经安装并加载了`surv
原创
2023-07-20 22:18:20
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最近用R语言画图，plot 函数是用的最多的函数，而他的参数非常繁多，由此总结一下，以供后续方便查阅。plot(x, y = NULL, type = "p", xlim = NULL, ylim = NULL, log = "", main = NULL, sub = NULL, xlab = NULL, ylab = NULL,
ann = par("ann"), axes = TRUE,
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2023-10-25 22:03:58
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1 什么是ggplot2ggplot2是用于绘图的R语言扩展包，其理念根植于《Grammar of Graphics》一书。它将绘图视为一种映射，即从数学空间映射到图形元素空间。例如将不同的数值映射到不同的色彩或透明度。该绘图包的特点在于并不去定义具体的图形（如直方图，散点图），而是定义各种底层组件（如线条、方块）来合成复杂的图形，这使它能以非常简洁的函数构建各类图形，而且默认条件下的绘图品质就能
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2023-12-24 09:35:05
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预期行为图:)实际行为错误消息：“符号”类型的对象不可子集化重现问题的步骤library(survminer)#> Le chargement a nécessité le package : ggplot2#> Le chargement a nécessité le package : ggpubr#> Warning: le package 'ggpubr' a été compilé avec la version R 3.4.3#> Le ch
原创
2021-05-12 14:11:22
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预期行为图:)实际行为错误消息：“符号”类型的对象不可子集化重现问题的步骤library(survminer)#> Le chargement a nécessité le package : ggplot2#> Le chargement a nécessité le package : ggpubr#> Warning: le package 'ggpubr' a été compilé avec la version R 3.4.3#> Le ch
原创
2021-05-19 22:50:03
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前言 最近想试一下捣腾一个 R 包出来，故参考了一些教程。现在看到的最好的就是谢益辉大大之前写过的开发R程序包之忍者篇，以及 Hadley 大神（ggplot2 devtools 等一系列包的作者）的 教程。但是前者有一些过时，后者是全英文的，所以我这里记录一下比较简单的过程，给读者们一个参考思路。如果你有一些 R 程序，想塞到去一个自创的 R 包中，那么这篇文章就可能是你想要的。为了方
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2023-09-02 15:12:54
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使用readr进行数据导入导入数据的方法有很多，相信大家也已经有了自己习惯的方法，所以本节的内容只是给大家提供一个选择。所谓技多不压身！本节较多理论性的东西，大家也可以酌情跳过！7.1 简介本章将学习如何将纯文本格式的矩形文件读入 R。虽然本章内容只是数据导入的冰山一角，但其中的原则完全适用于其他类型的数据。本章末尾将提供 一些有用的 R 包，以处理其他类型的数据。7.2 入门readr 的多数函
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2024-08-16 10:06:18
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[更新~] Python网络爬虫与文本数据分析dplyr简介dplyr是R语言的数据分析包，很像python中的pandas，能对dataframe类型的数据做很方便的数据处理和分析操作。最初我也很奇怪dplyr这个奇怪的名字，我查到其中一种解释d代表dataframeplyr是英文钳子plier的谐音library(tidyverse)## ── Attaching packages ─────
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2024-08-02 22:36:37
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本文集锦了R语言学习中需要用到的知识。可以作为入门了解之用，细节部分本文不做详解R语言介绍2、Rstools及package管理目前常用安装包的方式用三种：分为CRAN中的包/生物信息学相关包/GitHub里面的包#CRAN中的包
#install.packages() 安装包
#生物信息学相关Bioconductor
#install.packages('BiocManger')
#BiocMa
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2023-08-12 15:04:31
226阅读
目录引言1、数据构造2、筛选2.1 dplyr::filter基本语法：案例2.2 sqldf:sqldf关键字select、from、where、where3、排序3.1 dplyr::arrange3.2 sqldf:sqldf关键字：order by4、选择列4.1dplyr::select4.2 sqldf::select5、创建新的变量5.1 dplyr::mutate5.2 sqld
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2023-08-18 14:48:10
147阅读
1. stringr介绍stringr包被定义为一致的、简单易用的字符串工具集。所有的函数和参数定义都具有一致性，比如，用相同的方法进行NA处理和0长度的向量处理。字符串处理虽然不是R语言中最主要的功能，却也是必不可少的，数据清洗、可视化等的操作都会用到。对于R语言本身的base包提供的字符串基础函数，随着时间的积累，已经变得很多地方不一致，不规范的命名，不标准的参数定义，很难看一眼就上手使用。字
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2023-10-17 08:48:18
194阅读
文章目录包检查可用R语言的包1. 获取包含R包的库位置2. 获取已安装的所有软件包列表3. 获取当前在R环境中加载的所有包4. 安装一个新的软件包有两种方法安装：5. 加载包到当前R环境6. 卸载包包R语言的包是R函数，编译代码和样本数据的集合。 它们存储在R语言环境中名为“library”的目录下。默认情况下，R语言在安装期间安装一组软件包。 随后添加更多包，当它们用于某些特定目的时。 当我们启
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2023-05-18 22:26:36
204阅读
上一篇博客（R中两种常用并行方法——1. parallel）中已经介绍了R中常见的一种并行包：parallel，其有着简单便捷等优势，其实缺点也是非常明显，就是很不稳定。很多时候我们将大量的计算任务挂到服务器上进行运行时，更看重的是其稳定性。这时就要介绍R中的另一个并行利器——snowfall，这也是在平时做模拟时用的最多的一种方法。针对上篇中的简单例子首先是一个最简单的并行的例子，这个例子不需要
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2023-11-29 09:55:27
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DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析，主要也是用于RNA-Seq数据，同样也可以处理类似的ChIP-Seq,shRNA以及质谱数据。这两个都属于R包，其相同点在于都是对count data数据进行处理，都是基于负二项分布模型。因此会发现，用两者处理同一组数据，最后在相同阈值下筛选出的大部分基因都是一样的，但是有一部分不同应该是由于其估计离散度的不同方法所导致的。 ### DESeq2
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2023-12-11 12:46:12
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R包的安装R语言的特点就是有众多的第三方扩展包，扩展包涉及到各行各业的数据分析内容。包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合，包括R程序，运行该程序的其他语言(例如C语言)，解释这个程序功能、方法的帮助文档，例子、测试数据等。R自带了一系列默认包，包括base、datasets、utils、graDevices、graphics、stats以及methods。这些包提供了很多的默
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2023-06-20 14:26:00
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决策树模型
是一种简单易用的非参数分类器。它不需要对数据有任何的先验假设，计算速度较快，结果容易解释，而且稳健性强，不怕噪声数据和缺失数据。决策树模型的基本计算步骤如下：先从n个自变量中挑选一个，寻找最佳分割点，将数据划分为两组。针对分组后数据，将上述步骤重复下去，直到满足某种条件。
在决策树建模中需要解决的重要问题有三个：
如何选择自变量 如何选择分割点 确定停止划分的条件在 R语言 中
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2023-08-07 10:10:14
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（课程视频链接：https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?p=1）1.R语言 R语言是S语言的一种实现。R是一个全面的统计研究平台，提供了各式各样的数据分析技术，拥有顶尖的绘图功能。 R
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2023-10-30 21:30:41
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