【代码】生物信息分析 mibiogen 菌群分析 源码。
这是文菌装NAS的第六篇内容了，久等了！特别提醒：如果不了解NAS是何物的朋友，可以简单理解为它是一个插着网线的硬盘盒，相当于在家里安装了服务器，我们的手机、电脑，都可以随时随地的访问里面的内容。而它又像一台电脑，可以自动备份照片文件，可以下载电影，管理文件，会非常的爽。这次，我会分享我组装一台高性能全能NAS的全流程，包含硬件购买、组装、软件安装、调试等。最终实现：虚拟机、软路由、NAS存储、电
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2023-09-09 18:40:28
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# 在群晖上通过Docker部署阿文菌服务
在信息化的今天，许多人对于如何使用Docker在群晖NAS上部署服务产生了浓厚的兴趣，其中阿文菌作为一款灵活的服务应用，成为了热门选择。本文将介绍如何在群晖上使用Docker来部署阿文菌，并提供代码示例和状态图，深入探讨这一技术的应用。
## 什么是阿文菌？
阿文菌是一款基于微服务架构的在线应用，支持多种数据源接入，提供丰富的API接口，并具有良好
原创
2024-09-18 03:49:48
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微生物是地球上最古老、分布最广泛、多样性最丰富的生命形式之一。作为生态系统的重要组分部分，微生物在陆地和海洋生态系统物质循环和能量流动过程中发挥着举足轻重的作用，它们的活动是一切生物地球化学循环的基础。在自然界，微生物个体很少单独存在，而是彼此聚集在一起形成庞大且高度动态的群落；它们通过细胞间不断的物质、能量和信息交流，相互作用形成错综复杂的生态网络，这些复杂的网络对于生态系统的组成、结构和功能至
谷禾健康当谈到肠道菌群研究时，16S测序是一种常用的方法，它在了解微生物组成和多样性方面非常重要且实用。16S rRNA是细菌和古细菌中的一个高度保守的基因片段，同时具有一定的变异性。通过对16S rRNA基因进行测序，可以确定微生物群落中存在的不同菌属和菌种，并评估它们的相对丰度。针对肠道菌群16s测序概括起来可以了解以下内容：揭示微生物组成：通过16S rRNA测序，可以获得关于肠道菌群中存在
作者：Damian W. Rivett，英国曼彻斯特大学编译：何晴摘要细菌群落对地球生态系统的运行至关重要。通过量化细菌分类群在自然界中的功能作用来了解生态系统的特性随着时间或不同环境条件的变化，这已经成为了一个微生物生态学研究的关键挑战。而利用上述知识可以了解细菌是如何调节生物地球化学循环，同时通过设计细菌群落来优化所需的功能过程。然而，我们对天然细菌群落内错综复杂的相互作用是如何调节生态系统功
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2023-12-30 21:17:51
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有小伙伴问：我家娃小学三年级，对python感兴趣，正在网上自学python，可我纠结是不是学R更好些？小丫答：都行，娃感兴趣就好。同时反思：我是不是也该引导我家小小丫，让她对R感兴趣？怎么才能让小小丫对R感兴趣呢？我选择从画图开始。刚好最近买了香菇菌棒，那就测测指标画画图，顺便开启香菇主题STEAM启蒙。太长不看版：本文包含2个实验和7个衍生活动，文末有“小丫画图STEAM启蒙群5-9岁”的入群
人类微生物组计划HMP https://commonfund.nih.gov/hmp 国家基因库MDB https://db.cngb.org/microbiome/ Human Gut (9.9M) https://db.cngb.org/microbiome/genecatalog/geneca
原创
2022-09-01 09:54:17
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研究摘要高通量测序方法，结合物种分类和其相对丰度信息，对微生物生态学研究具有显著的促进作用。然而，相对丰度并不能反映微生物群落的真实数量和类群间的样本差异。在这项研究中，我们改进并应用了一种高通量绝对丰度定量方法（iHAAQ），这种方法将相对丰度（高通量测序）和细菌总数（定量PCR）结合在一起从而对土壤细菌群落进行定量分析。通过内参菌株EDL933和实验室菌株WG5验证了iHAAQ方法
子概述iMeta主页：http://www.imeta.s
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2023-07-19 09:20:48
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title: “利用NMDS对药物处理下肠道菌群微生物群落多态性分析” author: “Yang” date: “2021/5/12” output: html_document背景知识：NMDS 非度量多维尺度分析（Non-metric multidimensional scaling,NMDS）是一种将多维空间的研究对象简化到低维空间进行定位，分析和归类，同时又保留对象间原始关系的数据分析方
前言 前期，我们解读了Nature Microbiology的关于快速分析肠道菌群耐药性的论文。【文献解读】Nature Microbiology | 使用
中新社玉溪10月7日电 题：云南菌农变“菌导” 野生菌特色产业有“蘑”力
中新社记者 韩帅南
“大家在采摘野生菌时不要破坏它的生长环境，握住菌柄轻轻一摇就能摘出来。”近日，在云南省玉溪市易门县的一片山林中，采菌向导普艳兰正带领一批来自河北省的游客开启采摘野生菌之旅。
8月25日，采菌向导普艳兰(右一)带着游客在云南省易门县一处山林中寻觅野生菌。中新社记者 刘冉阳 摄
原创
2024-10-17 17:38:02
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一、同期群分析概念和理论 1 同期群分析方法介绍 同期群分析（CohortAnalysis）实际上是一种用户分群的细分类型，是一种“纵横”结合的分析方法： 横向上——分析同期群随着周期推移而发生的变化； 纵向上——分析在生命周期相同阶段的群组之间的差异。 “同期群”：同一时期的群体。可以是“同一天注 ...
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2021-03-25 21:21:00
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A-D采用R的cor()函数计算pearson相关系数，并使用Corrplot包展示，时间轴使用pheatmap绘制热图展示。E
点击蓝字 关注我们肠道菌群稳态：肠道菌群稳态在宿主健康中发挥着重要作用，在这项研究中，作者发现，肠道真菌和
今日主题： 你并不孤单，也并非完全由“你”的细胞构成。一个由数万亿微生物组成的复杂生态系统——主要存在于你的肠道中——正与你共生。这个被称为肠道微生物组的集合，远不止负责消化，它深刻地影响着你的免疫、情绪、甚至行为。今天，我们将探索这个与你同呼吸、共命运的“被遗忘的器官”。一、核心概念：你就是一座“行走的生态系统”数量与规模： 人体内微生物的数量与人体细胞数量相当，甚至更多。它们编码的基因总数（微
人工智能学习离不开实践的验证，推荐大家可以多在FlyAI-AI竞赛服务平台多参加训练和竞赛，以此来提升自己的能力。FlyAI是为AI开发者提供数据竞赛并支持GPU离线训练的一站式服务平台。每周免费提供项目开源算法样例，支持算法能力变现以及快速的迭代算法模型。大赛简介蘑菇中富含多种呈味氨基酸、核苷酸和糖类，这些物质造就了极其鲜美的味道，使得被端上餐桌上的它们深受人们喜爱。特别是在野生菌种类繁多的云南
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2024-01-31 03:13:26
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点击蓝字 关注我们一种用于理解人类肠道微生物组在二型糖尿病中相关变化的神经网络
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2023-07-18 16:49:26
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本文代码已经上传至https://github.com/iMetaScience/iMetaPlot如果你使用本代码，请引用：Changchao Li. 2023. Destabilized microbial networks with distinct performances of abundant and rare biospheres in maintaining networks un
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2024-03-19 22:24:59
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