1.测试数据的准备和相关包的安装。library(stringr)
> d1 <- read.table('test.txt', sep = '\t', header = TRUE)
> d1
                 tag    t    c    g    a
1 ENSG00000000003.13 2969 4725 1350 1667
2  ENSG00000            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            本教程向您介绍如何用CorelDRAW实现表格的制作。我们在制作一些简单的表格时常会用到,但它确实没有专业的表格软件那么的方便,因为用cdr会涉及到合并单元格的问题,这里将介绍三种在cdr实现表格的方法。利用图纸工具制作表格1、在工具箱中选择“图纸工具”,开始绘制之前先要设定表格的行数和列数,在属性栏的右上角设置“图纸的行数和列数”。2、设置完毕,绘制“表格”,在窗口里从左上角往右下角拉动,在表格            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            在工作中使用Excel时,经常会有需要在对原始记录清单进行整理时,剔除其中一些重复项。接下来本文就来讲解下Excel中去除重复项的几种常用技巧。所谓的重复项,通常是指在Excel中某些记录在各个字段中都有相同的内容(纵向称为字段,横向称为记录),例如下面图中的第三行数据记录和第五行数据记录就是完全相同的两条记录,除此以外还有第六行和第十行也是一组相同记录。在另外一些场景下,用户也许会希望找出并剔除            
                
         
            
            
            
             文章目录RNA-seq 相关概念RNA-Seq转录组(transcriptome)RNA种类可变剪切体(Alternative splicing isoform)junction readsRead countRPKMFPKM安装软件安装miniconda添加channel创建虚拟环境查看虚拟环境搜索bioconda镜像中的软件安装相关软件 RNA-seq 相关概念RNA-Seq具体来说,首先对            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            目标实现对beanName包含service的bean对象的每个方法, 都打印出其运行时间beanName不包含service的不打印通过@EnableMethodCostTime注解来控制打印的开启与关闭本文涉及知识本文的实现@EnableXXX注解的方法可以看做是对多数spring中该类型注解实现的模拟 同时, 在bean对象初始化时, 对对象生成代理对象从而增强, 体会bean的生命周期 同            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            通俗理解:一个算法的能力是有限的,把多个算法模型集成在一起Boosting方法(串行)Boosting主要思想是将弱学习器组装成一个强学习器(通过加法模型将弱分类器进行线性组合)训练集数据在学习过程中,通常根据它们的上一轮的分类准确率给予不同的权重,加弱学习器之后,数据通常会被重新加权,来强化对之前分类错误数据点的分类(每轮学习完,分类错误的,增加样本的权重,降低弱学习器的权重)个体学习器之间存在            
                
         
            
            
            
            写笔记的目的一是加深对论文的理解,二是便于日后回顾。标题:Urban Traffic Prediction from Spatio-Temporal Data Using Deep Meta Learning简介:KDD 2019的论文,考虑了节点和边的元信息来做预测。解决的问题:已有的ST模型大体包括特征提取模块、预测模块,对于预测模块关注的少,文章认为,不同的区域,如办公区,住宅区在早晚高峰会            
                
         
            
            
            
            rsid common SNP的ID,一般以rs开头,其实完全可以用坐标代替,那样可读性就很差了。 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/rs223337 【案例】 我们来看看一个SNP有哪些基本信息?            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            研究需要,得找出差异表达基因列表中的转录因子。列表长度上百,适合批量查询。经过同学提醒,在 Genecards 上可以查询到一个基因是否为转录因子,就着这个线索,我在 Genecards 基因页面中发现其利用了 HPA (human protein atlas) 的数据。顺藤摸瓜找到了 Protein class 这个字段,其中的元素用逗号隔开的,如果元素中含有 Transcription fac            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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             KEGG的数据KEGG中的pathway是根据相关知识手绘的,这里的手绘的意思可能是指人工以特定的语言格式来确定通路各组件的联系;基因组信息主要是从NCBI等数据库中得到的,除了有完整的基因序列外,还有没完成的草图;另外KEGG中有一个“专有名词”KO(KEGG),它是蛋白质(酶)的一个分类体系,序列高度相似,并且在同一条通路上有相似功能的蛋白质被归为一组,然后打上KO(或K)标签。下面就首先来            
                
         
            
            
            
            VEP是一款强大的注释、分析软件,在我们的变异检测中经常使用其进行SNP、INDEL、CNV和SV的注释,同时借助数据库的内容,对变异结果进行过滤。如此一款强大和功能齐全的软件,其参数必然会非常之多,对于初次接触的人来说,过多的参数非常影响对此软件的理解和使用,甚至耗费大量时间来安装软件。笔者也面对了此问题,耗费大量时间在软件调研和安装步骤中,为了方便后来者的快速使用,特此将安装使用心得分享给大家            
                
         
            
            
            
            Ensemble IDEnsemble ID 是Ensembl 数据库使用的ID标识符,用于标识不同的分子特征,如基因,转录本,外显子,蛋白。大多数据库都有一套自己的ID命名。ID 主要是为消除歧义,在特征注释或数据库更新时也能保持一致。不像人为命名的分子名字,如基因名字那样可能发生改变。就类似于我们的身份证号, 名字方便于平常的交流使用,ID是独一无二的。ID 格式Ensemble ID 个格式            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2024-05-06 17:53:01
                            
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            本文概述由于将项目的paragonie / random_compat依赖项(或项目的依赖项的依赖项)升级到1.5或主要版本而出现此错误。许多开发人员在使用Laravel和Symfony(symfony / polyfill-php70)时都遇到了这个问题。基本上是问题所在, 如消息中所示, 你的系统上没有更新的PRNG, 你需要提供一个。伪随机数生成器(PRNG), 也称为确定性随机位生成器(D            
                
         
            
            
            
            1.集成学习简介集成学习是通过构建并结合多个学习器来完成学习任务,这些学习器被称为“个体学习器”,不同的个体学习器 和 这些个体学习器的不同的集成方式决定了不同的集成学习方法。如果个体学习器都是从某一种学习算法从训练数据中产生,则称这样的集成学习是同质的,此时的个体学习器也称作基学习器,相应的学习算法称作基学习算法;如果个体学习器是从某几种学习算法从训练数据中产生,则称这样的集成学习是异质的强可学            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            基因结构其实这个结构不完整,完整的如下:主要注意UTR这个结构真核生物的基因结构包括编码区和非编码区。编码区编码区其实是断裂基因结构,也就是不连续基因。具有蛋白编码功能的不连续 DNA 序列称为外显子,外显子之间的非编码序列为内含子。 每个外显子和内含子接头区都有一段高度保守的一致序列,即内含子5’末端大多数是 GT 开始,3’末端大多是 AG 结束,称为 GT-AG 法则,是普遍存在于真核基因中            
                
         
            
            
            
            前端开发移动端经常遇到px转rem自适应屏幕宽度。首先我们要了解什么是rem,什么是像素。rem是什么?rem是一种长度单位,是而且仅是根据根元素html改变的长度单位。Root em(REM)是CSS3中新定义的一种长度单位。和之前的em(根据父元素改变大小)单位相比在使用上具有明显的优势。著名的响应式web框架Fundation就是用REMs作为基本的长度单位。接下来还有几个重要的概念需要交代            
                
         
            
            
            
            特征处理特征是对象的表达,模式识别中处理特征的方法可以分为两类:1 特征选择特征选择就是在原始特征集合中,挑选出一些最具有代表性、可分性最好的特征子集——典型的组合优化问题、NP问题。从统计观点——变量的选择特征选择:1)可以降低特征空间维数;2)特征本身常常具有明确的意义。搜索策略顺序前进法——不考虑特征相关性,由少到多,不断增加特征顺序后退法——不考虑特征相关性,由多到少,不断减少特征遗传算法            
                
         
            
            
            
            欢迎观看 Lightroom Classic 教程,小编带大家学习 Lightroom Classic 的基本工具和使用技巧,了解如何将照片从Lightroom 移至Photoshop,在Photoshop 中为照片应用滤镜。在将 Lightroom 照片移至 Photoshop 的所有原因中,利用 Photoshop 的创意功能是最重要的原因之一。从图层样式、3D 效果到剪贴蒙版和变形应有尽有。            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2024-07-01 07:04:49
                            
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            ensemble组合方法1、ensemble概念通过聚合多个分类器的预测来提高分类的准确率,这种技术称为组合方法(ensemble method) 。组合方法由训练数据构建一组基分类器,然后通过对每个基分类器的预测进行权重控制来进行分类。Ensemble技术在数据挖掘的三个方向:1.在样本上做文章,基分类器为同一个分类算法,主要的技术有bagging,boosting;2.在分类算法上做工作,即用            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            在数据分析中,经常需要下载物种的参考基因组序列。通常情况下,可以考虑以下3个数据库NCBIEnsemblUCSC这三个数据库都是公共的大型数据库,里面存储了很多物种的基因组序列。这3个数据库作为第一选择,如果这三个数据库中都没有你要寻找的物种,可以尝试寻找该物种特有的数据库。同一个基因组在以上三大数据库中的记录还是稍有不同的,以human为例,在NCBI中的链接如下https://www.ncbi