## Symbols 的出现是为了什么呢?
* Symbols 是 JavaScript 最新推出的一种基本类型,它被当做对象属性时特别有用,但是有什么是它能做而 String 不能做的呢?
* 在我们开始探索 Symbols 功能之前,我们先来看一下被很多开发者忽略 JavaScript 的特性。
### 背景:
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2024-08-19 15:19:55
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目前在 ENS 系统中, .eth 域名资源依然非常丰富,很多优质的域名还没有被注册,比较容易挑选到心仪的域名,建议有意向的童鞋们抓紧吧。下面我们来演示一下如何在以太坊上注册一个 .eth 域名。
ENS 域名系统中目前支持三种顶级域名,分别是 .eth .xyz .luxe。其中, .eth 是 ENS
前言使用工具:R 一.下载数据到网站NCBI下载数据我这次选择了两个样本GSM4138111和GSM4138110进行下载, 需要下载下面的三个文件,下载的时候要将文件归类,数据是那个样本的就放到以该样本命名的文件夹中。二.文件改名在使用的时候需要对文件名进行更改,改成如下名字:genes改成features就好如果样本很多,那么改名字就很麻烦了,可以使用以下R语言代码进行批量更改名字:
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2024-06-13 21:15:04
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前端开发移动端经常遇到px转rem自适应屏幕宽度。首先我们要了解什么是rem,什么是像素。rem是什么?rem是一种长度单位,是而且仅是根据根元素html改变的长度单位。Root em(REM)是CSS3中新定义的一种长度单位。和之前的em(根据父元素改变大小)单位相比在使用上具有明显的优势。著名的响应式web框架Fundation就是用REMs作为基本的长度单位。接下来还有几个重要的概念需要交代
零基础入门转录组数据分析——数据处理(自测序数据) 目录零基础入门转录组数据分析——数据处理(自测序数据)1. 原始数据集2. 数据处理(Rstudio)3. 数据标准化(Rstudio) 通常有的小伙伴会选择将自己的样本送到不同的测序公司进行测序,会出现以下几种情况:有的公司返回来的数据文件中是已经注释好的count(行为基因symbol,列为样本名),这种情况的可以直接用于后续的分析。但是有的
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2024-10-08 12:37:13
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在这之前,假设阅读者已经对GEO数据库有了一定的了解,并且知道数据下载的几种方式。需要说明的是,R包GEOquery下载数据对网速要求比较高,假如网速不是很好进行ID转换之前需要两个文件:1.基因表达量矩阵文件2.探针ID与gene symbol对应的文件 基因矩阵文件,第一列为探针ID,其余列是样本表达量
探针ID与ge
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2023-10-16 17:19:41
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1.请根据R包org.Hs.eg.db找到下面ensembl 基因ID 对应的基因名(symbol)
包中自带函数toTable可以将各种命名方式转换为数据框
其中每种命名方式都和共同的gene_id对应,可以通过gene_id对各个命名数据框进行联结操作。> head(toTable(org.Hs.egENSEMBL))
gene_id ensembl_id
1
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2023-10-09 13:17:40
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本着学语言精神的数据类型-循环-构造函数-ctrl+c-用包的过程,先来研究数据结构。R语言数据结构总共可以分三大类:1:向量,因子2:矩阵,数据框3:列表,数组首先研究一下向量和因子吧!①:向量首先,向量是最基本的数据容器,向量内的数值类型,判断方法与转换类型函数如下,向量里面的数据必须是同一类型1向量的创建:
a<-c(1,2,3,4,5,6,7,8,9)
assign("a",c(1,
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2023-06-20 15:20:24
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## 从Gene ID到ENSG ID:Python实现
在生物信息学中,基因(gene)是生物体中传递遗传信息的基本单位。每个基因都有一个独特的标识符,通常用来表示基因的是Gene ID。而在基因组学研究中,我们经常需要将Gene ID转换为ENSG ID,即基因在Ensembl数据库中的唯一标识符。为了帮助研究人员快速实现这一转换,我们可以利用Python编程语言来实现这一功能。
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原创
2024-06-28 06:45:47
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TCGA 基因ID转换 R语言
在生物信息学领域,TCGA(癌症基因组图谱)提供了丰富的基因组数据,使用 R 语言进行基因 ID 的转换是一项常见且重要的任务。在本文中,我们将深入探讨如何进行 TCGA 基因 ID 转换的相关技术细节和实现步骤。
### 版本对比
在进行 TCGA 基因 ID 的转换时,不同版本的 R 包提供了不同的功能和支持。以下是关于一些主要版本的比较以及兼容性分析的时
OrgDb库enrichGO默认gene type是entrezID,但其他OrgDb支持的类型(ENSEMBLE,SYMBOL等)都可以通过参数keyType指定。gene的ID type不一样,富集的结果也会有稍微的差异。 原gene list是entrezID,直接通过bitr转换成ensembl和symbol,分别做enrichGO。 发现entrezedID可能对应多个ENSEMBL的。
## 从tcga基因id转换为R语言代码
在生物信息学研究中,我们经常需要将TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中的基因ID转换为R语言中使用的格式,以进行后续的数据分析和可视化。本文将介绍如何将TCGA基因ID转换为R语言代码。
### 什么是TCGA基因ID?
TCGA基因ID是指在TCGA数据库中使用的一种特定的基因标识符,用于标记基因在不同样本中的表达情况
原创
2024-06-22 03:59:57
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ID转换如何去重R语言
在数据处理的过程中,经常会遇到“ID转换如何去重R语言”这一问题,尤其是面对大数据集时,去重操作显得尤为重要。有效地进行ID去重,不仅能提高数据处理效率,也能保证数据的准确性。以下是我整理的一些内容,希望帮助大家理解如何在R语言中进行ID转换去重的操作。
*现象描述*
- 在处理一个包含重复ID的数据集时,发现有多个条目拥相同的ID。
- 数据分析结果不一致,影响最后
GEO芯片数据下载和探针ID转换(保姆级教程)一、问题描述探针ID转换数据是否预处理过二、Rstudio的安装(建议阅读,避免后续转换时出错)安装包的下载安装步骤三、(正文)芯片数据下载和ID转换相关设置和包的加载数据下载 本文章主要参考了: ①R 语言的安装(详细教程) ②GEO芯片数据下载和探针ID转换一、问题描述探针ID转换我们需要的基因表达量信息在NCBI的GEO数据库中对应的编号为GS
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2024-04-04 15:09:19
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基因id转换为基因名是基因组学研究中常见的任务之一。在生物学研究中,基因id通常以一系列数字或字母的组合形式表示,这使得基因的理解和分析变得困难。因此,将基因id转换为基因名可以更好地帮助研究人员理解和解释基因功能、相互作用等。
在R语言中,有许多工具和库可用于基因id转换为基因名。下面将介绍一种常用的方法,并给出相应的代码示例。
## 安装依赖库
在开始之前,我们需要安装两个R语言的依赖库
原创
2024-01-02 09:36:10
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基因名字是我们日常数据分析、阅读文献中最常见的一类术语,以下根据自己工作经验探讨下基因名在生物信息学数据分析中常见的坑!坑1:一个基因有两种名字基因的名字分成两种:一种是给计算机看的,也就是各种数据库中的基因ID,最常用的基因id数据库来源包括:Ensembl,NCBI,UCSC等;另一种是给人看的,就是我们常见的gene symbol,例如TP53。所以,根据名字来判断是哪个数据库中的id,是数
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2024-10-08 21:08:14
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早前的文章说过proe建模的素材,其中有提及ID图的处理。今天就更深入的介绍下此种建模方式。我们就用典型的手机的ID图导入proe建模为例加以说明(其他3c产品、电子、玩具等等其实大同小异)。首先还是看看典型的ID图:这就是前面上我说过的ID图,如果这个上面还带有工艺,那就是CMF图了。如下图:这种图通常是AI做的,AI是Adobe Illustrator的简称,是一流的矢量图软件(矢
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2023-11-15 18:53:26
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1.bioMart包的介绍bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口,能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库,这个包可以做以下几个工作: 1.查找某个基因在染色体上的位置。反之,给定染色体每一区间,返回该区间的基因; 2.通过EntrezGene的ID查找到相关序列的GO注释。反之,给定相关的GO注释,获取相关的EntrezGene的ID; 3.通过EntrezGene的I
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2023-10-12 12:44:51
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CNN训练注意事项 1.用Mini-batch SGD对神经网络做训练的过程如下:不断循环 :① 采样一个 batch 数据( ( 比如 32 张 )②前向计算得到损失 loss③ 反向传播计算梯度( 一个 batch)④ 用这部分梯度迭代更新权重参数2.去均值去均值一般有两种方式:第一种是在每个像素点都算出3个颜色通道上的平均值,然后对应减去,如AlexNet。 第二种是在整个样
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2024-06-17 21:12:25
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R语言中的ID转换以后无数据NA可以通过使用dplyr包中的mutate()函数来实现。下面是详细的步骤和代码示例。
## 流程图
```mermaid
graph TD;
A[开始] --> B[导入数据];
B --> C[定义ID转换表];
C --> D[合并数据];
D --> E[ID转换];
E --> F[处理NA];
F -->
原创
2024-02-03 06:12:40
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