六秒钟后仪表显示加载重量完成标定。键盘上没有【B】键的：将主板下的短路块短接，短路块在键盘座左边，开机显示“0”，加载满量程的三分之一标准砝码。稳定后，同时按住[置零][去皮]键不放，六秒钟后仪表显示加载重量完成标定。取下短路块。如果提示[PUSHB]说明未按住B键，请重复操作。金菊1)金菊计重秤标定：先短路，按开机，然后迅速放开，放开后立即长按开机键，直到显示内码后，按三下开机键就会显示标定的
diff与patch命令diff与patch命令真可谓是天作之合，命令中的黄金搭档。老师讲了之后其实自己不是很懂，因为上课的时候没有好好听，上课走神了。怎么办呢，肯定不能放着不管了，而这两个命令确实很重要，所以只能厚着脸皮课后死啃资料自己学习咯，学了之后才有开头第一句的感慨。 diff和patch是一对工具，数学上说，diff是对两个集合的差运算，patch是对两个集合的和运算。diff
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2024-10-27 22:52:33
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Cufflinks下主要包含cufflinks,cuffmerge,cuffcompare和cuffdiff等几支主要的程序。主要用于基因表达量的计算和差异表达基因的寻找。1. Cufflinks简介Cufflinks程序主要根据Tophat的比对结果，依托或不依托于参考基因组的GTF注释文件，计算出(各个gene的)isoform的FPKM值，并给出trascripts.gtf注释结果(组装出转
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2024-05-20 17:38:38
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1. Cuffmerge简介Cuffmerge将各个Cufflinks生成的transcripts.gtf文件融合称为一个更加全面的transcripts注释结果文件merged.gtf。以利于用Cuffdiff来分析基因差异表达。2. 使用方法$ cuffmerge [options]* 输入文件为一个文本文件，是包含着GTF文件路径的list。常用例子： $ cuffmerge -o ./me
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2024-04-04 21:27:39
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# cufflinks: 用Python可视化数据的利器
## 前言
在数据分析和机器学习的过程中，数据可视化是非常重要的一环。通过可视化，我们可以更直观地理解数据的特征和趋势，从而做出更准确的分析和预测。Python语言中有很多强大的数据可视化库，如Matplotlib和Seaborn等，但它们的使用可能稍显繁琐，特别是对于初学者来说。本文将介绍一款名为cufflinks的Python库，它
原创
2023-09-02 10:56:00
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一、直方图的基本概念在上文中介绍了，要计算联合熵，可以借助直方图提供的概率密度估计结果。直方图既是一种精确表示数值型数据分布的统计图。从更一般的数学意义看，直方图也是一种不预先设定概率分布模型，只利用数据本身，进行概率密度估计的算法。属于统计学中非参数估计的基础算法。直方图也有很多种，用得最多的一维频率直方图。虽然这种直方图看起来跟条形图(bar graph)差不多，但是条形图目的是关联两个数据维
Cole Trapnellsaid：there are three strategies:1) merge bams and assemble in a single run of Cufflinks2) assemble each bam an
原创
2023-11-06 15:07:36
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在network菜单下我们安排了网络相关的技术：如果导入与网络无关的数据将会导致出错的技术。相对比的是，在tools菜单下我们安排了网络分析中经常被用到，
并且也同时经常在与网络无关的分析中被用到的技术。Multidimensionalscaling 和clusteranalysis就是这方面的例子。在UCINET6.0中，所有的数据都用矩阵描述。有些提
公式：名称概念计算公式净现值（NPV）（优先考虑）net present value不同时间发生的等额资金在加之上不相等；按一定的折现率将隔年净现金流量折现到；统一试点的现值累加值。未来收益的现金；流折现-初始投资额；npv=终值／（1+x）的N次方越大越好；>=0项目可以接受；<0不能接受内部收益率（IRR）经济含义是项目内部每年的净收益率。当NPV=0时对折现率越大越好（至少大于行
（1）安装cufflinks tophat http://5527lok.blog.163.com/blog/static/6475158201242823917220/ （2）使用Tophat分析RNA-seq结果 http://5527lok.blog.163.com/blog/static/6
原创
2023-11-08 09:06:11
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Cufflinks计算差异表达 Cufflinks包含了以下程序：Cufflinks 使用经过Tophat比对好的SAM格式来拼接转录组（每一个样本都进行拼接），如果有基因组注释文件的话，效果会更好。这个步骤的目的在前面已经讲过，包括后面的cuffmerge，即为了更精确地确定转录组的所有转录本以及其所有的剪接变体，从而更精确的进行定量分析。 如果已经有了参考基因组和基因组注释文件，这个步骤和cu
本文将深入探讨Python库Cufflinks的使用，通过一些实例来帮助读者理解如何利用Cufflinks进行数据可视化。Cufflinks可以与Pandas DataFrame一起使用，轻松创建交互式图表。这篇博文将包含多个技术部分，确保清晰地覆盖背景、操作方法、以及相关的优化建议。
在开始之前，了解Cufflinks的发展背景非常重要。Cufflinks自2016年开始开发，旨在通过简单的接
转录组分析工具大比拼 文献阅读与翻译 - Gaining comprehensive biological insight into the transcriptome by performing a broad-spectrum RNA-seq analysis摘要RNA-sequencing (RNA-seq)是转录组研究的重要技术。自从RNA-seq技术问世以来，已经开发
Python 实现 TOPSIS 方法评价 TOPSIS （Technique for Order of Preference by Similarity to Ideal Solution，趋近理想解的排序方法）是一种常用于多属性决策的评价方法。它通过将每个决策方案与一个“理想解”和一个“反理想解”进行比较，生成一个综合得分，用于评价方案的绩效。 TOPSIS 方法需要输入一个包含每个决策方案的
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2024-10-18 08:16:16
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定性--用文字语言进行相关描述
定量--用数学语言进行描述
定性分析与定量分析应该是统一的，相互补充的；; 定性分析是定量分析的基本前提，没有定性的定量是一种盲目的、毫无价值的定量；; 定量分析使之定性更加科学、准确，它可以促使定性分析得出广泛而深入的结论
定量分析是依据统计数据，建立数学模型，并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经
定量预测有两个核心，一个是历史数据，第二个是统计模型。也就是说定量预测是基于历史数据，并在数据上应用数学模型，最后得到统计结果。定量预测可以从数学关系上揭示变量之间的数学关系，可以预测事故未来发展的趋势与变化情况。定量预测可以分为时序预测与因果预测，时序预测即根据历史数据的变化，找出其中的规律，并把未来看做过去的延伸；因果分析法倾向于寻找指标之间的相互关联，并把这些关联关系作为预测未来的依据。在交
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2021-02-02 12:26:07
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定量变量（Quantitative Variables）：也称为数值型变量（Numerical Variables），可以用连续值或离散值表示。比如：气温（连续值），学生人数（离散值）。 为什么要对定量变量进行转换？大多数情况下，我们可以直接使用定量变量。但是有时候，特征和目标之间不呈线性关系。比如说年龄和收入之间的关系，当人年轻时，收入通常会稳步上升，但到了一定年纪之后，收入便开始降低
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2023-11-27 10:44:59
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定量预测有两个核心，一个是历史数据，第二个是统计模型。也就是说定量预测是基于历史数据，并在数据上应用数学模型，最后得到统计结果。定量预测可以从数学关系上揭示变量之间的数学关系，可以预测事故未来发展的趋势与变化情况。定量预测可以分为时序预测与因果预测，时序预测即根据历史数据的变化，找出其中的规律，并把未来看做过去的延伸；因果分析法倾向于寻找指标之间的相互关联，并把这些关联关系作为预测未来的依据。在交
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2021-02-02 12:26:05
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欢迎关注”生信修炼手册”!featuresCounts软件用于统计基因/转录本上mapping的reads数
原创
2022-06-21 09:12:51
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1.编写一个名为print_info()的函数，它打印一个句子，指出你在本章学的是什么。调用这个函数，确认显示的信息正确无误 def print_info():
learn = '函数'
print('本章学的内容是:'+learn)
print_info()运行结果：本章学的内容是:函数 2.编写一个名为favorite_book()的函数，其中包含一个名为bookn
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2023-11-10 01:44:36
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