前言:bedtools等工具号称是可以代替普通的生物信息学数据处理工程师的!我这里用一个专题来讲解它的用法,其实它能实现的需求,我们写脚本都是可以做的,而且我强烈建议正在学编程的小朋友模仿它的各种功能来增强自己的脚本功力。 BEDTools是可用于genomic features的比较,相关操作及进行注释的工具。而genomic features通常使用Browser Extensibl
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2024-02-23 21:25:23
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用途:返回修正Bessel函数值,它与用纯虚数参数运算时的Bessel 函数值相等。 语法:BESSELI(x,n) 参数:X为参数值。N为函数的阶数。如果 n 非整数,则截尾取整。 2.BESSELJ 用途:返回 Bessel 函数值。 语法:BESSELJ(x,n) 参数:同上 3.BESSELK 用途:返回修正Bessel函数值,它与用纯虚数参数运算时的Bessel 函数
Bedtools是处理基因组信息分析的强大工具集合,本文列出自己学习其官方文档的几个点,多样品peak相似...
原创
2023-05-02 21:50:45
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点击阅读原文跳转完整教案。基因组中的趣事(二)- 最长的基因2.7 million,最短的基因
原创
2023-04-26 09:55:52
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为什么不得不用bedtools? 速度,当数据到达百万级以上,R和C的速度差别就非常明显了 专业,但凡涉及到region、peak的处理,bedtools都可以胜任 目录 bed文件基本处理:导出,排序 用一个query region去overlap另一个database region,并取得属性
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2021-03-03 16:09:00
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# 使用R语言实现Bedtools功能的入门指引
在数据生物信息学领域,Bedtools是一个非常强大的工具,用于处理基因组数据。虽然Bedtools主要是用命令行方式操作,但我们也可以通过R语言来实现类似的功能。本篇文章将引导你如何在R中实现Bedtools的基本操作,适合刚入门的开发者学习。
## 流程概述
以下是我们将要实现的基本步骤:
| 步骤 | 描述
#include<bits/stdc++.h>using namespace std;#define rep(i,l,r) for(int i=(l);i<=(r);i++)#define per(i,l,r
原创
2022-08-16 14:53:56
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.closest() .closest( selector )Returns: jQuery Description: For each element in the set, get the first element that matches the selector by testing th
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2019-06-28 15:04:00
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pandas DataFrame的增删查改总结系列文章:pandas DaFrame的创建方法pandas DataFrame的查询方法pandas DataFrame行或列的删除方法pandas DataFrame的修改方法在操作DataFrame时,肯定会经常用到loc,iloc,at等函数,各个函数看起来差不多,但是还是有很多区别的,我们一起来看下吧。首先,还是列出一个我们用的DataFra
软件github地址:https://github.com/arq5x/bedtools2/比较好的介绍文档:https://w
原创
2022-11-06 01:27:13
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wget https://github.com/arq5x/bedtools2/archive/v2.25.0.tar.gztar xzvf v2.25.0 cd bedtools2-2.25.0/makecd bin/export PATH=$PWD:$PATH
原创
2023-10-08 10:36:15
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定义和用法closest() 方法返回被选元素的第一个祖先元素。祖先是父、祖父、曾祖父,依此类推。DOM 树:该方法从当前元素向上遍历,直至文档根元素的所有路径(),来查找 DOM 元素的第一个祖先元素。该方法与 parents() 类似,都是向上遍历 DOM 树,不同点是:closest()从当前元素开始沿 DOM 树向上遍历,并返回匹配所传递的表达式的第一个单一祖先返回包含零个或一个元素的 j
原创
2019-11-07 14:06:28
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Find the K closest points to a target point in a 2D plane.
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2017-01-01 04:16:00
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Given a time represented in the format "HH:MM", form the next closest time by reusing the current digits. There is no limit on how many times a digit
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2019-05-28 07:27:00
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jQuery 是一款开源的,最流行的,面向对象的Javascript框架,因为平时经常使用,也就萌生了阅读源码的想法,尝试着去分析一下,如果有问题,还请大家指点。阅读 jQuery 源码之前,必须要了解 jQuery 的工作机制,在我看来,实际上 jQuery 是一个标准的以面向对象的程序结构,jQuery 本身是一个类,而每一个我们构建的 jQuery 对象则是这个类实例。因此我从如下两个方法来
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2024-08-08 23:28:41
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.closest( selector )Description: For each element in the set, get the first element that matches the selector by testing the element itself and traversing up through its ancestors in the DOM tre
原创
2023-04-12 02:47:11
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UVA_10487
将所有和算出来之后进行排序,再二分查找即可。
#include<stdio.h>#include<string.h>#include<stdlib.h>int cmp(const void *_p,const void *_q){int *p=(int *)_p;int *q=(int *)_q;return *p-*q;}int
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2011-09-22 08:39:00
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Given an arraySofnintegers, find three integers inSsuch that the sum is closest to a given number, target. Return the sum of the three integers. You may assume that each input would have exactly one solution. For example, given array S = {-1 2 1 -4}, and target = 1. The sum that is closest to ...
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2013-10-17 11:47:00
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