笔记主要内容：1~3代测序技术，fastq文件 & FASTQC（1）测序技术1、一代测序技术：Sanger Sequencing测序条件：需要有足够的量的单链DNA，即相同序列需要达到多少数量才能进行测序。测序过程：以一条链作为模板，DNA聚合酶将环境中的材料（dNTP & ddNTP），进行结合，即合成另一条链（ddNTP结合之后，DNA合成反应终止）。下图所示，SEQUENC
预定义的参数，通过传入预定义的一些参数，我们可以通过这些参数进行一些判断 二代增强查找方式： 1、由于二代增强是一批特殊命名的函数增强，由于这批函数在程序中进行了调用，可以通过在主程序中搜索CALL CUSTOMER-FUNCTION的方式找到，然后通SE37查看相应的函数。 函数命名规则：EXIT ...
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2021-09-19 11:27:00
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目录step:1 准备工作step:2 数据过滤比对参考基因组安装BWA建立索引bwa一共有三种比对算法，这里使用mem数据过滤安装samtools筛选三步走step:3 组装step:4 共线性分析使用MUMmer进行分析安装mummer-3.23：联配相近序列数据整理step:5-6 基因组环化+gap填充(尚未补充完整)step:7 组装评估 step:1 准备工作获得原始数据 获得样本参
一、初现庐山真面目一代测序：又称Sanger测序（多分子，单克隆）历史：第一代DNA测序技术（又称Sanger测序）在1975年，由Sanger等人开创，并在1977年完成第一个基因组序列（噬菌体X174），全长5375个碱基。研究人员经过30年的实践并对技术及测序策略的不断改进（如使用了不同策略的作图法、鸟枪法），2001年完成的首个人类基因组图谱就是以改进了的Sanger法为其测序基础。原理：
二代测序原理：1、DNA待测文库构建。 超声波把DNA打断成小片段，一般200--500bp，两端加上不同的接头2、Flowcell。一个flowcell，8个channel，很多接头3、桥式PCR扩增。每个DNA片段将在各自位置集中成束，每一束含有单个DNA模板的很多拷贝，目的：将碱基的信号强度放大，达到测序所需的信号要求。4、测序。边合成边测序。反应所需材料，dNTP的3’端特殊处理，不能继续
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2023-07-02 17:24:09
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平台介绍爬虫程序， 二代蜘蛛侠，此版本完全重新开发，比上一代更加强大（性能，易用，架构，分布式，简洁，成熟）使用技术java 功能介绍1. 应用性能，易用，架构，分布式，简洁，成熟源码下载地址git@gitee.com:l-weiwei/Spiderman2.git
原创
2020-12-30 10:33:23
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虽然三代测序现在已经商用，但是目前的主流还是二代测序，尤其是Illumina公司的测序方式更是大行其道。那么，下面我们从四个方面来说说illumina家的二代测序是怎么得到的生物数据。0、 基本原理基于可逆终止的，荧光标记dNTP，做边合成边测序分为三步：样本准备 Sample Prep成簇 Cluster Generation测序 Sequencing数据分析 Data Anal...
原创
2022-03-08 14:35:16
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R批量做GSEA分析还没有官方的包，但是clusterprofiler可以做，它调用了最新的gfsea包。Gene Set Testing for RNA-seq - fgsea教程 RNA-seq是利器，大部分做实验的老板手下都有大量转录组数据，所以RNA-seq的分析需求应该是很大的（大部分的生信从业人员应该都差不多要沾边吧）。普通的转录组套路并不多，差异表达基因、富集分析、WGCN
比较通俗易懂的帖子，希望大家有时间看看作者本人的博客：http://waveletlegend.spaces.live.com/
原创
2022-08-26 09:15:39
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对一个8点序列，怎样实现第二代小波变换。1. 奇偶分开。非常简单，就是[2,4,6,8]组成一列向量，[1,3,5,7]组成一列向量。2. 预测。用[2,4,6,8]来预测[1,3,5,7]。比如说1，3估计2； 3，5估计4； 5，7估计6； 7，1估计8。（边缘处理，我采用循环方法）。估计公式可以用别人的，也可以自己做。举一个线性的例子：2=1*a+3*b,4=3*
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2022-08-15 13:35:44
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## Java二代混淆器实现流程
### 1. 混淆器原理简介
在软件开发中，为了保护源代码不被反编译、解析和修改，常常需要对代码进行混淆处理。混淆器是一种工具，可以通过对源代码进行多种变换和加密，使得代码变得难以理解和分析，从而增加反编译的难度。
Java二代混淆器是一种高级混淆器，它不仅可以对代码进行常规的变形、重命名和加密，还可以利用Java虚拟机（JVM）的特性，在运行时动态地进行代
# 精伦二代 Java 开发指南
在这一篇文章中，我们将深入探讨如何实现“精伦二代”这一项目，特别是使用 Java 语言进行开发。此项目的一般流程分为若干步骤，下面的表格将对此进行详细说明：
| 步骤 | 描述 |
|------|------------------------------------------|
高通量测序技术，就是二代测序，已经成为现代生物学研究的一个较为常规的实验手段。这一技术的发展极大地推动了基因组学，表观基因组学以及翻译组学的研究。RNA-seq 通过测定稳定状态下的RNA样品的序列来对RNA样品进行研究，从而避免了许多之前研究手段的不足，比如象基因芯片或者 PCR 就需要背景知识。而且 RNA-seq 还可以触及以前无法研究的领域，比如复杂结构的转录体。RNA-seq可以应用于以
经过几十年的改进，第一代测序仪不仅在读长上有较大的突破，准确率高达99.999%，而且测定成本也大幅下降，达到每千碱基序列为0.5美元。但是，不管怎么改进，由于对电泳分离技术的依赖，第一代测序技术在速度和成本方面都已达到极限。在这种情况下，第二代测序技术（Next-generation sequencing）应运而生。 第二代测序技术的核心思想是边合成
二代支付系统 国家处理中心(NPC)：NPC是人民银行连接支付系统所有城市节点和特许参与者的中枢节点，负责接收、转发各CCPC和接收、处理特许参与者的支付指令，以及资金清算的一组硬件和软件系统的总称。参加支付系统的直接参与者必须在人民银行国家处理中心开设清算账户。 城市处理中心(CCPC)：CCPC是人民银行支付系统的城市节点，连接NPC和各直接参与者，负责在NPC和直接参与者
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2023-09-08 13:52:01
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1. gateway 网关 1.1 GateWay工作简介 Spring Cloud GateWay是Spring Cloud的一个全新项目，目标是取代Netflix Zuul，它基于Spring5.0+SpringBoot2.0+WebFlux（基于高性能的Reactor模式响应式通信框架Nett ...
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2021-08-23 09:57:00
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本文主要介绍以太网的MAC（Media Access Control，即媒体访问控制子层协议）和PHY（物理层）之间的MII（Media Independent Interface ，媒体独立接口），以及MII的各种衍生版本——GMII、SGMII、RMII、RGMII等。简介从硬件的角度看，以太网接口电路主要由MAC（Media Access Control）控制器和物理层接口PHY（Physi
# Java二代三代代码的实现流程
## 概述
在开始之前，我们需要明确Java二代三代代码的实现流程。下面是一个简单的表格展示了这个流程：
| 步骤 | 描述 |
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酷睿2目前共分为四个系列： T系列 移动酷睿2处理器！ （T1XXX为单核处理器 T2XXX为双核处理器） E系列 台式机酷睿2双核处理器！ （E6XXX为FSB 1066版 E4XXX为FSB 800版） X系列 台式机酷睿2至尊版处理器及服务器！ （台式只有X6800至尊版一款，X3XXX为至强版，酷睿2双核服务器处理器！） QX系列 台式机酷睿2四核处理器！ 目前有QX6700 和QX66
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2023-07-18 16:06:27
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一个贫二代的杯具:由于家里穷，小时候躲过了毒奶粉，地沟油，稍大没钱上幼儿园躲过了歹徒的残杀，后躲过了残酷的高考招生的黑幕，再大躲过了暴力拆迁带来的自焚，后不敢创业躲过了城管的追捕，最后光荣地走进了富士康人啊，不想做做人了。
原创
2010-05-29 09:55:52
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