网络图是生物信息学中常用的显示不同节点之间关联方向与关联程度的可视化方法。在富集分析中,网络图常被用于表示功能与估计到该功能的基因的联系。在蛋白质互作用网络中,网络图常用于表示编码基因之间的互作用类型与作用强度,基于这些信息,还可以通过某一节点与其他节点的连接数量来判断该节点在整个网络中的贡献度(degree)。绘制网络图常使用cystoscape软件,通过输入符合规范的数据,调整合适的参数,就可
欢迎关注”生信修炼手册”!从数据库中得到蛋白质的相互作用信息之后,我们可以构建蛋白质间的相互作用网络,但是这个网络是非常复杂的,节点和连线的个数很多,如果从整体上看,很难挖掘出任何有生物学价值的信息,所以我们需要借助一些算法来深入挖掘。随着各个数据库中信息通量的不断提高,基于网络的分析方法越来越受欢迎,比如我们常见的蛋白质相互网络,基因共表达网络,转录因子调控网络,pathway网络等等,为了更好
dpi :(Dots Per Inch),指每英寸的像素,是衡量打印机打印精度的主要参数之一ppiPPI(Pixel Per Inch)表示数字影像的解析度(也许这样太过于抽象,dpi=ppi)px:像素单位。最基础的图像构成元素单位,css pixel 逻辑像素,浏览器使用的单位 dp pt:device independent pixel 设备无关像素或物理像素dpr:devicepixel
目录PPI数据集:PPI数据集代码的理解算法原理:代码实现:代码理解训练过程 PPI数据集:参考:PPI(生物化学结构) 网络是蛋白质相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI网络的简称,在GCN中主要用于节点分类任务 PPI是指两种或以上的蛋白质结合的过程,通常旨在执行其生化功能。一般地,如果两个蛋白质共同参与一个生命过程或者协同完成某一功能,都被看作这两个蛋白质
一、引言PPI全称为Producer Price Index,中文名为“生产者物价指数“,也称为工业品出厂价格指数。它是一个反映生产领域物价变化的指标,通常用来测量生产领域的价格水平和通货膨胀压力。在经济生活中,PPI可以用于衡量生产成本、预测CPI走势、分析通货膨胀压力、评估产业竞争力、反映经济增长程度。而PPI本身就是一种时间序列数据,其具有时间特征,因此我们可以采用时间序列模型ARIMA对其
从今天开始正式进入针对药物发现的相关数据集的介绍与应用。文章中所有的代码都是依托PYG来实现的。PPI数据集下载地址:https://data.dgl.ai/dataset/ppi.zip1. 数据集介绍蛋白质 - 蛋白质相互作用网络,包含位置基因集,基序基因集和免疫特征作为特征(共50个)和基因本体集作为标签(共121个)。graphsnodesedgesfeaturestasks20~2,24
PPI蛋白互作网络构建详细步骤string数据库是目前数据量最丰富、应用最广泛的研究蛋白质相互作用的数据库之一,收录了超过14000个物种、6千多万种蛋白、200多亿个相互作用的信息。这些蛋白质相互作用既包括直接的物理作用,也包括间接的功能相关性。1. 进入官网(https://string-db.org)之后,点击search,点击之后的界面如下图所示:左侧为选项,有根据单个蛋白名字、单个蛋白序
十分钟快速理解DPI和PPI,不再傻傻分不清! https://baijiahao.baidu.com/s?id=1605834796518990333&wfr=spider&for=pc 关于UX测试相关的: 之前一直搞的不是很清楚 这个百家号的解释挺好的 简单转帖一下 以后仔细研究, 设计师充电站 18-07-1308:58 72DPI的图片拿去打印会糊吗?手机
CPICPI是消费者物价指数(consumer price index),又名居民消费价格指数,简称CPI。是一个反映居民家庭一般所购买的消费品和服务项目价格水平变动情况的宏观经济指标。它是在特定时段内度量一组代表性消费商品及服务项目的价格水平随时间而变动的相对数,是用来反映居民家庭购买消费商品及服务的价格水平的变动情况,是一个月内商品和服务零售价变动系数。PPIPPI是生产价格指数(Produc
欢迎关注”生信修炼手册”!在之前的文章中,我们提到利用网络聚类算法可以从复杂的蛋白质网络中挖掘蛋白复合体或者
原创 2022-06-21 06:17:31
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度 / 自由度的理解度(degree)/ 自由度,也叫valency(直译化合价),是指Graph(图)中一个节点,有多少条边连接其上。图的度是其所有节点的度中最大。对于“度”的理解,结合自由度,和化合价这个英文原词来理解,本意应该是衡量一个节点与外界连通性的度量。例如在计算二阶导数时一元函数(一维函数)其公式如下,直观上可以理解为:其二阶导数等于其在所有自由度上微扰之后获得的增益。一维函数其自
一、像素像素是构成位图的基本单元,当位图图像放大到一定程度时,所看到的一个一个的马赛克色块就是像素且像素色块的大小不是绝对的。1.物理像素(设备像素)一个显示屏的成像原理是通过一系列的小点排列成一个大的矩形,不同的小点通过显示不同的颜色来显示成图像。这每一个小点被叫做一个物理像素(即设备像素)。2.CSS像素CSS像素作为Web开发者我们整天在CSS里用px作为长度单位。这里的px指的是CSS像素
前面用简单算法算出了六个时间参数,但是还是有很多人不明白,觉得这样做不简单。这种方法熟练了在10秒左右就可以每个节点上的数、计算工期和关键线路,这是非常节省时间的,造价工程师考试能提速一分钟都至关重要,基本上有95%以上的人都做不完题,如果把造价工程师案例科目考试时间增加到5个小时通过率会翻3-5倍,所有说在考场上时间非常宝贵。下面我在用一个新的网络图给算一下参数。 算之前必须记住口
# 获取Java图像的PPI 在处理图像时,有时候我们需要知道图像的PPI(每英寸像素数)以便进行进一步的处理。在Java中,我们可以通过一些方法来获取图像的PPI。 ## 问题描述 假设我们有一个Java应用程序,需要根据图像的PPI来进行一些操作。现在我们需要一个方法来获取图像的PPI。 ## 解决方案 我们可以通过使用Java内置的ImageIO类和BufferedImag
原创 6月前
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如何导出Redis Hash Redis是一个开源的高性能键值存储系统,它支持多种数据结构,其中之一就是Hash。Hash是一个键值对集合,它可以用于存储对象,每个对象都包含多个字段和对应的。在实际应用中,我们有时需要将Redis中的Hash数据导出到其他系统或进行分析处理。本文将介绍如何使用Python导出Redis中的Hash,并提供一个实际问题的解决方案。 ## 问题描述 假设我
原创 8月前
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一,澄清一些误区1.1概念dpi是dot per inch,每英寸多少点,针对的是印刷页即打印到纸上或者应用到ui切的图片中; ppi是 Pixel per inch,每英寸像素数,针对的是手机屏幕;1.2误区网上有dpi和ppi的关系,甚至还有给出两者之间的换算关系的。 产生dpi和ppi混乱的原因:ui切图的时候以dpi为准,而手机厂商给定的屏幕分辨率参数中给的是ppi。实际上ppi和dp
欢迎关注”生信修炼手册”!NetworkAnalyst是一个在线网站,通过该网站可以方便的分析基因表达谱数据
原创 2022-06-21 06:17:38
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几个很重要的概念:ppi(pixels per inch) :图像分辨率 ------在图像中,每英寸所包含的像素数目dpi(dots per inch):打印分辨率    ------每英寸所能答应的点数,即打印精度 DPI最初用于衡量打印物上每英寸的点数密度,就是说你的打印机可以在一英寸内打多少个点。DPI越小,图像越不精细。当DPI的概念用在计算机屏幕上时,就
 屏幕ppi的计算器:​​https://www.itpwd.com/tools/ppicalc.php​​大屏幕ppi的表格:  根据PPI(像素密度计算),32寸2K相当于,23.8寸的1080P。​ 
php
转载 2021-04-13 14:17:00
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1. dpi是dot per inch,每英寸多少点,ppi是 Pixel per inch,每英寸像素数,针对显示器的设计时,dpi=ppi。而安卓代码中常用density(点密度)来表示。ppi的计算方式呢可以根据勾股定理以及小学数学知识就能算出了哈哈,例如小米2s分辨率1280*720,4.3寸。这样的话可以得到ppi=(√1280^2+720^2)/4.3=341.53...可以粗略估计为
转载 2023-08-17 16:39:47
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