1.进入官网下载:https://www.python.org/downloads/ 进入后,如下图所示操作,点击Downloads,我的电脑是Windows系统的,这里直接点击下载最新版本。 如果想下载其他版本可以在当前页面往下拉,找到“Looking for a specific release?”,我这里以下载Python 3.8.1为例点击Download后会出现对应版本的详细信息下拉页面            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2023-07-05 13:04:40
                            
                                233阅读
                            
                                                                             
                 
                
                                
                     
                                    
                             
         
            
            
            
            提供了丰富的功能,包括高质量的3D渲染、多种分子表示方式(如球棒模型、卡通模型、表面表示等)、灵活的动画制作以及测量和            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
                            2024-10-13 12:49:29
                            
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            (1)报错:通过pymol:interfaceresidue.py 运行时候出现报错:pymol not running: entering library mode(experienment) (2)分析原因:确认Pymol的安装目录是否正确:你需要检查Pymol的安装位置,确保其安装在正确的位置。可以从Pymol的官方网站或其他可靠的来源上下载Pymol的安装程序,并且确保在安装Py            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2024-01-14 10:56:32
                            
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            PyMol堪称分子展示神器了,关键是开源。 文章目录安装与初步认识目录与文件下载分子绘图操作 安装与初步认识下载pyMol的whl文件,这里选择pymol-2.5.0-cp39-cp39-win_amd64.whl,需要python3.9的环境。如果用的是python其他版本,可以自行选择可以适配的文件。在安装pyMol之前,需要安装numpy, mkl, pwm依赖,然后把下载的pymol复制到            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2024-05-24 11:58:23
                            
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            PyMOL 是一个广泛使用的分子可视化工具,常用于生物化学和结构生物学领域。通过预编译的 whl 文件安装 PyMOL 可以简化安装过程,尤其是在编译时可能会遇到依赖问题的情况下。以下是详细的安装步骤:安装前准备:Python环境:确保已经安装了Python,并且Python版本与whl文件兼容。pip:确保已经安装了pip,这是Python的包管理器,用来安装外部库。下载whl文件:从可靠的来源            
                
         
            
            
            
            
            1. 下载pymol:PyMOL | pymol.org2. 完成安装3. 找到下图所示的Prompt, 并运行pymol -R命令打开pymol server         4. 可以使用如下的简单代码运行pymolfrom rdkit.Chem import PyMol
from rdkit impor            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2023-06-20 16:07:36
                            
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            -壹-下载Anaconda利刃君为大家提供的是适用于Windows 64系统的安装程序,如需其他系统的,可以自行至下面网址下载:https://www.anaconda.com/download/下面为网站截图,大家可根据自己电脑系统选择下载。       新手建议选择Python 3.6 Version,如果你电脑中还有需使用Pyhon 2.7的软件,建议选用Python            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2023-11-01 22:56:55
                            
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                   在做分子对接前,需要对蛋白质和分子进行预处理。对蛋白质进行:去水,去配体,加氢,处理;小分子需要加氢,做能量优化。       关于数据库:DUDE数据库上有蛋白质受体和配套的阳性、阴性配体。从DUDE数据库上下载的蛋白质和PDB数据库上下载的有所差异,但是对接使用的是蛋白质口袋,外圈的其实影响不大,DU            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2023-10-17 22:53:34
                            
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            Win10(64位)系统下安装Pymol(1.8.6)Linux(CentOS 7)(64位)系统下安装Pymol(1.8.6)Pymol(1.8.6)作图技巧之cartoon和surface镶嵌模型Pymol(1.8.6)作图技巧之创建质心Pymol | Pymol绘制GridBox图PyMOLPyMOL软件以Py+MOL命名:“Py”表示它是由一种计算机语言Python所衍生出来的,“MOL”            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2023-09-26 18:16:46
                            
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            一、欧氏距离(Euclidean distance)指m维中两点之间的真实距离,缺点:对某些量纲不同的变量(如“身高”和“体重”)赋予同等重要程度,没有进行标准化处理。计算公式 点P1(x11,x12,…,x1n)与P2(x21,x22,…,x2n)之间的欧式距离为:用Jupyter Notebook编写代码:import numpy as np
x = np.array([1,1])
y = n            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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                            2023-11-28 10:03:30
                            
                                580阅读
                            
                                                                             
                 
                
                                
                     
                                    
                             
         
            
            
            
            pymol.desktop[Desktop Entry]Name = PyMOLExec = /home/tqc/software/pymol/pymolIcon=/home/tqc/software/pymol/share/pymol/data/pymol/icons/icon2_128x128.pngTerminal=falseStartupNotify=trueType=A...            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
                            2021-08-04 10:33:18
                            
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            Step 1:将文件下载到桌面。通过查看别的博主,进入链接下载pymol-版本号-cpPthon号-cpPthon号-win_amd64.whl的版本。pip insall            
                
         
            
            
            
            PyMOL是一个Python增强的分子图形工具。它擅长蛋白质、小分子、密度、表面和轨迹的3D可视化。它还包括分子编辑、射线追踪和动画。            
                
         
            
            
            
            # 如何实现“pymol页面显示python停止使用”
## 引言
欢迎来到这篇文章!如果你是一名刚入行的开发者,正在寻找如何在pymol页面上显示python停止使用的方法,那么你来对地方了。我将为你提供一份详细的步骤指南,以帮助你完成这个任务。
作为一名经验丰富的开发者,我知道学习编程中常常会遇到问题,特别是对于新手来说。但是,不要担心,我将会尽我所能来帮助你。在这篇文章中,我将以简单明了            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
                            2023-11-15 15:13:40
                            
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            如何卸载老版本Python并下载新版本Pymol软件
在帮助小白开发者实现“卸载老版本Python并下载新版本Pymol软件还能使用”的过程中,我们需要分为几个步骤进行操作。以下是整个流程的步骤表格:
| 步骤 | 操作 |
| --- | --- |
| 步骤一 | 卸载老版本的Python |
| 步骤二 | 下载新版本的Python |
| 步骤三 | 安装新版本的Python |
|            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
                            2024-01-13 03:35:14
                            
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            摘要本文将带大家使用免费开源的PyMOL软件绘制D715-2441蛋白与与PB2cap配体分子的结合模式图。我们先来看一张成品图:研究背景根据分析结果,我们获得以下相互作用:1、化合物D715-2441的芳环夹在氨基酸残基H357和F404之间并形成π-π堆积作用,还与F404形成疏水作用;2、化合物苯环上的羟基与E361的羧基和K376的N+原子形成氢键作用,另一个羟基与F404的O原子形成氢            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            在介绍之前,先简单介绍一下这个软件,虽然前面我们简单的使用,但没有过多介绍,这里就简单介绍一下,具体细节上的东西,需要你不断使用,才能熟悉。下面是软件界面。1.设定工作目录,打开文件打开PyMOL软件,设置我们的工作目录。或者通过命令cd F:\AutoDock来实现,这与window的dos命令行和Linux系统的cd(Change Directory)命令一样。导入刚才下载的复合物PDB文件(            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
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            PyMOL是一款领先的三维分子建模与可视化软件,适用于生物化学、药物研发等领域。该软件以其精细的图形渲染、灵活的分子操作与动画制作闻名,可实现蛋白质、核酸及其他生物分子结构的高质量呈现与深入分析。用户可通过直观界面或Python脚本对分子进行旋转、缩放、添加标记,执行结构比对、表面展示、电荷分布分析等功能,助力科研人员直观解读复杂的生物结构信息。文内提供PyMOL2.5.7下载,亲测可激活成功。支            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        原创
                                                                                    
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            PyMol安装教程(Windows10)pymol的使用需要基于python环境,本教程从python环境配置开始,基于python2.7进行安装。如果您曾经安装过python,可以直接进入pymol安装步骤,但是要留意下载对应版本的whl文件。本次使用到的文件:链接:https://pan.baidu.com/s/1aPQggII3HvvTM6X3j-wlhA  提取码:1234&nb            
                
                    
                        
                                                            
                                                                        
                                                                                        转载
                                                                                    
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